More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1001 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2704  phytoene desaturase  78.1 
 
 
498 aa  850    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1360  phytoene desaturase  65.16 
 
 
500 aa  657    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.259348 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2373  phytoene desaturase  62 
 
 
519 aa  647    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145608  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1897  phytoene desaturase  67.75 
 
 
499 aa  707    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.29228 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1001  phytoene desaturase  100 
 
 
527 aa  1075    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.917372  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1684  phytoene desaturase  55.51 
 
 
506 aa  570  1e-161  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127101  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0318  phytoene desaturase  57.31 
 
 
526 aa  563  1.0000000000000001e-159  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.158779  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0116  phytoene dehydrogenase-related protein  47.28 
 
 
491 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2045  phytoene desaturase  47.13 
 
 
490 aa  457  1e-127  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.716362  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0057  phytoene dehydrogenase-related protein  38.83 
 
 
488 aa  417  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2030  phytoene desaturase  39.15 
 
 
501 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00915  CrtI1  38.36 
 
 
488 aa  397  1e-109  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2093  phytoene desaturase  37.91 
 
 
493 aa  390  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456364  decreased coverage  0.00855511 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5960  phytoene desaturase  39.18 
 
 
490 aa  389  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5620  phytoene desaturase  36.97 
 
 
497 aa  383  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.476172 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2545  phytoene desaturase  38.55 
 
 
536 aa  340  4e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139145  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04430  phytoene desaturase  38.13 
 
 
548 aa  336  5.999999999999999e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12770  phytoene desaturase  38.59 
 
 
532 aa  335  1e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.500323 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0340  phytoene desaturase  33.33 
 
 
542 aa  318  2e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0903063 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13830  phytoene desaturase  35.92 
 
 
552 aa  300  3e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000359632  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21220  phytoene desaturase  35.68 
 
 
566 aa  292  1e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3491  phytoene desaturase  37.59 
 
 
551 aa  285  2.0000000000000002e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2891  phytoene desaturase  36.52 
 
 
550 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.101189 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3436  phytoene desaturase  32.14 
 
 
512 aa  262  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.240701 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3745  phytoene desaturase  32.14 
 
 
512 aa  261  2e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1073  phytoene dehydrogenase-related protein  32.61 
 
 
460 aa  261  2e-68  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5031  phytoene desaturase  33.4 
 
 
509 aa  261  3e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3632  phytoene desaturase  32.52 
 
 
512 aa  260  4e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.109765  normal  0.0371662 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3156  phytoene desaturase  32.28 
 
 
509 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.205158  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  32.33 
 
 
505 aa  244  3e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0845  amine oxidase  33.07 
 
 
492 aa  243  7.999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1046  phytoene dehydrogenase  28.27 
 
 
494 aa  240  5e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2740  phytoene desaturase  30.41 
 
 
518 aa  238  1e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0409  phytoene dehydrogenase-related protein  33.92 
 
 
465 aa  238  2e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2742  phytoene desaturase  28.74 
 
 
553 aa  237  3e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2268  phytoene desaturase  29.78 
 
 
497 aa  237  5.0000000000000005e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2211  phytoene desaturase  31.59 
 
 
531 aa  231  3e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  0.130578 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  27.49 
 
 
502 aa  228  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  27.49 
 
 
502 aa  228  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0703  phytoene desaturase  31.2 
 
 
453 aa  228  2e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.687275  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  29.83 
 
 
492 aa  218  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02162  phytoene dehydrogenase  29.43 
 
 
537 aa  213  7.999999999999999e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5197  phytoene desaturase  30.62 
 
 
525 aa  212  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2535  zeta-phytoene desaturase  31.86 
 
 
491 aa  211  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00482984  unclonable  0.000000000435247 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0143  amine oxidase  29.38 
 
 
519 aa  208  2e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3577  zeta-phytoene desaturase  29.89 
 
 
504 aa  206  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557125  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2502  phytoene desaturase  32.74 
 
 
494 aa  206  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000691138  hitchhiker  0.00865975 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  31.61 
 
 
512 aa  205  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  29.81 
 
 
493 aa  204  4e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0493  phytoene desaturase  29.16 
 
 
507 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.145536  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2710  phytoene desaturase  29.38 
 
 
546 aa  201  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.487747 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  30.16 
 
 
511 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3750  phytoene desaturase  29.64 
 
 
530 aa  201  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2128  phytoene desaturase  28.24 
 
 
504 aa  200  5e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.423753  decreased coverage  0.0000406201 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2983  phytoene desaturase  30.83 
 
 
495 aa  199  7.999999999999999e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00166806  normal  0.0111696 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2640  zeta-phytoene desaturase  27.7 
 
 
497 aa  199  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  29.69 
 
 
511 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2586  zeta-phytoene desaturase  27.7 
 
 
497 aa  199  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  30.71 
 
 
508 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3441  phytoene desaturase  29.59 
 
 
530 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.826621  normal  0.0554878 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  29.9 
 
 
511 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3134  amine oxidase  28.41 
 
 
492 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.954476  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1000  phytoene desaturase  29.18 
 
 
549 aa  197  4.0000000000000005e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  29.82 
 
 
511 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1712  phytoene desaturase  28.49 
 
 
504 aa  197  6e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678565  normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1585  zeta-phytoene desaturase  30.6 
 
 
492 aa  196  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1811  phytoene dehydrogenase-related protein  30.14 
 
 
502 aa  195  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000642179  normal  0.0141145 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3228  Zeta-phytoene desaturase  29.94 
 
 
519 aa  194  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285222  normal  0.0185992 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3637  phytoene desaturase  27.94 
 
 
530 aa  192  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.197726  normal  0.0326307 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29222  predicted protein  26.5 
 
 
521 aa  192  2e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.821914  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3573  phytoene desaturase  29.39 
 
 
509 aa  188  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0943  phytoene dehydrogenase-related protein  30.8 
 
 
495 aa  188  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.988075 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1816  amine oxidase  28.44 
 
 
492 aa  188  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  28.74 
 
 
507 aa  187  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4929  zeta-phytoene desaturase  27.25 
 
 
492 aa  187  4e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258823  normal  0.799895 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3488  zeta-phytoene desaturase  28.75 
 
 
552 aa  187  5e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1387  amine oxidase  29.3 
 
 
503 aa  186  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  hitchhiker  0.00651843 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  29.89 
 
 
498 aa  185  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4439  phytoene dehydrogenase-related protein  27.9 
 
 
492 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.93912 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5038  phytoene desaturase  30.34 
 
 
529 aa  184  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.710499  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1847  phytoene dehydrogenase-related protein  29.96 
 
 
503 aa  182  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2155  phytoene dehydrogenase-related protein  28.75 
 
 
553 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.774687  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1810  phytoene dehydrogenase family protein  23.98 
 
 
499 aa  181  4e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.149228  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5128  zeta-phytoene desaturase  29.43 
 
 
506 aa  179  9e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.146602 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1619  phytoene dehydrogenase-related protein  29.56 
 
 
508 aa  179  1e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3200  phytoene desaturase  27.65 
 
 
508 aa  178  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177165  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0609  zeta-phytoene desaturase  27.44 
 
 
495 aa  176  9e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.392694  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1024  phytoene dehydrogenase-related protein  27.88 
 
 
518 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3508  phytoene dehydrogenase  28.82 
 
 
524 aa  176  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.691648  normal  0.885719 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3827  phytoene desaturase  28.65 
 
 
489 aa  175  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47122  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0470  phytoene desaturase  30.23 
 
 
496 aa  172  1e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.605444  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3075  putative phytoene desaturase  28.17 
 
 
506 aa  170  6e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.873802  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0524  amine oxidase  29.57 
 
 
556 aa  170  6e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.599626 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3309  phytoene desaturase  28.86 
 
 
494 aa  170  8e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1399  phytoene desaturase  29.41 
 
 
502 aa  169  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5454  phytoene dehydrogenase-related protein  28.15 
 
 
512 aa  167  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0796  phytoene desaturase  26.91 
 
 
475 aa  166  1.0000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5075  amine oxidase  28.15 
 
 
512 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5163  phytoene dehydrogenase-related protein  28.15 
 
 
512 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134146  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26410  UDP-galactopyranose mutase  29.89 
 
 
507 aa  163  6e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.739873 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>