More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1614 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1614  phytoene dehydrogenase-related protein  100 
 
 		 520 aa  1052    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4005  FAD dependent oxidoreductase  55.53 
 
 		 516 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.665607  hitchhiker  0.00234507 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1289  FAD dependent oxidoreductase  55.69 
 
 		 516 aa  548  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.571457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3760  FAD dependent oxidoreductase  55.02 
 
 		 524 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00569391 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2984  CrtD protein  58.47 
 
 		 503 aa  537  1e-151  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2048  phytoene desaturase  56 
 
 		 515 aa  531  1e-149  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.51701 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6441  hydroxyneurosporene and rhodopin dehydrogenase  56.11 
 
 		 509 aa  512  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1706  phytoene desaturase  54.97 
 
 		 519 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2726  phytoene desaturase  57.68 
 
 		 499 aa  485  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2848  phytoene desaturase  56.73 
 
 		 512 aa  479  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.984953  normal  0.88934 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3693  phytoene desaturase  56.6 
 
 		 499 aa  477  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357896 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2953  phytoene desaturase  57.46 
 
 		 499 aa  475  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294845 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2822  phytoene desaturase  54.15 
 
 		 511 aa  464  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.429882  normal  0.241296 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0183  amine oxidase  45.06 
 
 		 523 aa  369  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3513  methoxyneurosporene dehydrogenase  44.83 
 
 		 532 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.705776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2040  phytoene dehydrogenase-related protein  43.89 
 
 		 495 aa  332  9e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.492251 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1910  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.95 
 
 		 495 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.295436 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0266  methoxyneurosporene dehydrogenase  44.54 
 
 		 495 aa  312  1e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0609  zeta-phytoene desaturase  35.37 
 
 		 495 aa  252  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.392694  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2535  zeta-phytoene desaturase  37.7 
 
 		 491 aa  251  2e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00482984  unclonable  0.000000000435247 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1811  phytoene dehydrogenase-related protein  37.14 
 
 		 502 aa  246  8e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000642179  normal  0.0141145 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3225  Zeta-phytoene desaturase  36.57 
 
 		 475 aa  234  4.0000000000000004e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328594  hitchhiker  0.00724213 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2983  phytoene desaturase  35.83 
 
 		 495 aa  226  8e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00166806  normal  0.0111696 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1108  phytoene desaturase  36.97 
 
 		 500 aa  226  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556955  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5031  phytoene desaturase  33.66 
 
 		 509 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3745  phytoene desaturase  32.81 
 
 		 512 aa  220  5e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3436  phytoene desaturase  32.61 
 
 		 512 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240701 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2740  phytoene desaturase  31.31 
 
 		 518 aa  215  9.999999999999999e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3632  phytoene desaturase  32.41 
 
 		 512 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.109765  normal  0.0371662 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3833  hydroxyneurosporene dehydrogenase  36.98 
 
 		 471 aa  213  7.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0251377 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2586  zeta-phytoene desaturase  28.8 
 
 		 497 aa  207  4e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2640  zeta-phytoene desaturase  28.8 
 
 		 497 aa  207  4e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0845  amine oxidase  31.99 
 
 		 492 aa  206  6e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  32.87 
 
 		 505 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3228  Zeta-phytoene desaturase  31.65 
 
 		 519 aa  201  3e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285222  normal  0.0185992 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2546  phytoene desaturase  33.2 
 
 		 496 aa  200  6e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.343335  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3248  phytoene dehydrogenase-related protein  34.92 
 
 		 495 aa  197  3e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.242639  normal  0.13988 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  29.47 
 
 		 511 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  29.09 
 
 		 511 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  29.55 
 
 		 511 aa  194  4e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3475  zeta-phytoene desaturase  34.69 
 
 		 495 aa  192  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.419175  normal  0.0366285 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3156  phytoene desaturase  31.19 
 
 		 509 aa  192  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.205158  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1392  FAD dependent oxidoreductase  36.06 
 
 		 495 aa  189  7e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000446309 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2045  phytoene desaturase  31.7 
 
 		 490 aa  187  4e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.716362  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5197  phytoene desaturase  31.58 
 
 		 525 aa  186  7e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5128  zeta-phytoene desaturase  33 
 
 		 506 aa  185  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.146602 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5124  zeta-phytoene desaturase  33.97 
 
 		 452 aa  185  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.229738  normal  0.0794369 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0796  phytoene desaturase  31.13 
 
 		 475 aa  184  4.0000000000000006e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4929  zeta-phytoene desaturase  30.67 
 
 		 492 aa  182  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258823  normal  0.799895 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3309  phytoene desaturase  31.99 
 
 		 494 aa  180  4.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1847  phytoene dehydrogenase-related protein  32.26 
 
 		 503 aa  179  8e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1387  amine oxidase  31.49 
 
 		 503 aa  179  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  hitchhiker  0.00651843 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  31.14 
 
 		 512 aa  177  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  30.8 
 
 		 508 aa  176  6e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  28.63 
 
 		 511 aa  176  8e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  30.08 
 
 		 498 aa  176  8e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2268  phytoene desaturase  29.6 
 
 		 497 aa  171  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4439  phytoene dehydrogenase-related protein  30.04 
 
 		 492 aa  170  5e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.93912 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  30.43 
 
 		 507 aa  170  6e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3827  phytoene desaturase  30.16 
 
 		 489 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47122  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3134  amine oxidase  28.74 
 
 		 492 aa  168  2.9999999999999998e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.954476  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3200  phytoene desaturase  28.76 
 
 		 508 aa  167  4e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3577  zeta-phytoene desaturase  29.01 
 
 		 504 aa  167  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2211  phytoene desaturase  29.33 
 
 		 531 aa  166  6.9999999999999995e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  0.130578 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2502  phytoene desaturase  30.99 
 
 		 494 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000691138  hitchhiker  0.00865975 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5620  phytoene desaturase  27.24 
 
 		 497 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.476172 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2704  phytoene desaturase  29.4 
 
 		 498 aa  162  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1619  phytoene dehydrogenase-related protein  30.63 
 
 		 508 aa  161  3e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  26.14 
 
 		 492 aa  160  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1024  phytoene dehydrogenase-related protein  26.65 
 
 		 518 aa  160  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1399  phytoene desaturase  31.14 
 
 		 502 aa  159  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1046  phytoene dehydrogenase  24.65 
 
 		 494 aa  159  1e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2128  phytoene desaturase  28.19 
 
 		 504 aa  159  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.423753  decreased coverage  0.0000406201 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3573  phytoene desaturase  29.9 
 
 		 509 aa  159  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1810  phytoene dehydrogenase family protein  22.13 
 
 		 499 aa  157  4e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.149228  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0143  amine oxidase  25.49 
 
 		 519 aa  157  5.0000000000000005e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1712  phytoene desaturase  28.34 
 
 		 504 aa  157  5.0000000000000005e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678565  normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3441  phytoene desaturase  30.12 
 
 		 530 aa  156  7e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.826621  normal  0.0554878 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1684  phytoene desaturase  28.12 
 
 		 506 aa  155  1e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127101  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3750  phytoene desaturase  30.08 
 
 		 530 aa  156  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0493  phytoene desaturase  28.74 
 
 		 507 aa  155  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.145536  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3236  phytoene desaturase  30.13 
 
 		 508 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.689878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2710  phytoene desaturase  27.49 
 
 		 546 aa  153  8e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.487747 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0470  phytoene desaturase  32.4 
 
 		 496 aa  152  1e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.605444  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  27.98 
 
 		 493 aa  152  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2742  phytoene desaturase  28.54 
 
 		 553 aa  151  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3637  phytoene desaturase  29.61 
 
 		 530 aa  150  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.197726  normal  0.0326307 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1360  phytoene desaturase  27.54 
 
 		 500 aa  150  5e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.259348 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5038  phytoene desaturase  28.72 
 
 		 529 aa  150  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.710499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29222  predicted protein  27.34 
 
 		 521 aa  150  5e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.821914  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02162  phytoene dehydrogenase  23.55 
 
 		 537 aa  150  6e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3075  putative phytoene desaturase  29.94 
 
 		 506 aa  150  7e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.873802  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0116  phytoene dehydrogenase-related protein  27.2 
 
 		 491 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1816  amine oxidase  26.04 
 
 		 492 aa  148  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2373  phytoene desaturase  27.26 
 
 		 519 aa  147  3e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145608  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3488  zeta-phytoene desaturase  27.51 
 
 		 552 aa  147  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3011  phytoene desaturase  29.38 
 
 		 508 aa  148  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.194152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2155  phytoene dehydrogenase-related protein  27.54 
 
 		 553 aa  147  5e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.774687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2030  phytoene desaturase  25.96 
 
 		 501 aa  146  8.000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3809  phytoene desaturase  28.77 
 
 		 492 aa  146  9e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>