More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0183 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0183  amine oxidase  100 
 
 
523 aa  1062    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3513  methoxyneurosporene dehydrogenase  60.34 
 
 
532 aa  565  1e-160  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.705776  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2040  phytoene dehydrogenase-related protein  57.65 
 
 
495 aa  503  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.492251 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0266  methoxyneurosporene dehydrogenase  57.44 
 
 
495 aa  480  1e-134  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1910  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  57.65 
 
 
495 aa  480  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.295436 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4005  FAD dependent oxidoreductase  44.83 
 
 
516 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.665607  hitchhiker  0.00234507 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3760  FAD dependent oxidoreductase  45.03 
 
 
524 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00569391 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2984  CrtD protein  45.28 
 
 
503 aa  369  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1289  FAD dependent oxidoreductase  42.39 
 
 
516 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.571457  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6441  hydroxyneurosporene and rhodopin dehydrogenase  43.89 
 
 
509 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2048  phytoene desaturase  43.8 
 
 
515 aa  365  1e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.51701 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1706  phytoene desaturase  42.86 
 
 
519 aa  365  2e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1614  phytoene dehydrogenase-related protein  45.06 
 
 
520 aa  347  3e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2822  phytoene desaturase  44.65 
 
 
511 aa  341  1e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.429882  normal  0.241296 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3693  phytoene desaturase  45.2 
 
 
499 aa  342  1e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00357896 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2848  phytoene desaturase  44.42 
 
 
512 aa  322  8e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.984953  normal  0.88934 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2726  phytoene desaturase  43.64 
 
 
499 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171136  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2953  phytoene desaturase  43.42 
 
 
499 aa  318  2e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0294845 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2535  zeta-phytoene desaturase  34.27 
 
 
491 aa  211  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00482984  unclonable  0.000000000435247 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1811  phytoene dehydrogenase-related protein  34.15 
 
 
502 aa  211  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000642179  normal  0.0141145 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0609  zeta-phytoene desaturase  31.11 
 
 
495 aa  196  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.392694  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2983  phytoene desaturase  34.94 
 
 
495 aa  196  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00166806  normal  0.0111696 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2640  zeta-phytoene desaturase  29.34 
 
 
497 aa  193  6e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2586  zeta-phytoene desaturase  29.34 
 
 
497 aa  193  6e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3632  phytoene desaturase  31.4 
 
 
512 aa  187  5e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.109765  normal  0.0371662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3436  phytoene desaturase  31.81 
 
 
512 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.240701 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3745  phytoene desaturase  31.61 
 
 
512 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  30.66 
 
 
511 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3225  Zeta-phytoene desaturase  33.33 
 
 
475 aa  184  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328594  hitchhiker  0.00724213 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  31.12 
 
 
511 aa  183  7e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5197  phytoene desaturase  30.94 
 
 
525 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  30.79 
 
 
511 aa  180  7e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5124  zeta-phytoene desaturase  33.04 
 
 
452 aa  179  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.229738  normal  0.0794369 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2740  phytoene desaturase  29.9 
 
 
518 aa  174  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1392  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
495 aa  173  6.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000446309 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  29.96 
 
 
505 aa  172  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0796  phytoene desaturase  29.5 
 
 
475 aa  170  5e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3833  hydroxyneurosporene dehydrogenase  33.74 
 
 
471 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0251377 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  29.22 
 
 
511 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3475  zeta-phytoene desaturase  32.31 
 
 
495 aa  167  4e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.419175  normal  0.0366285 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  30.83 
 
 
508 aa  167  5e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3248  phytoene dehydrogenase-related protein  32.93 
 
 
495 aa  167  5e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.242639  normal  0.13988 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  30.81 
 
 
512 aa  166  8e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5031  phytoene desaturase  30.97 
 
 
509 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  31.19 
 
 
507 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3577  zeta-phytoene desaturase  30.42 
 
 
504 aa  161  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557125  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1108  phytoene desaturase  32.63 
 
 
500 aa  160  6e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556955  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1492  FAD dependent oxidoreductase  30.95 
 
 
447 aa  158  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.226993  hitchhiker  0.000066146 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1712  phytoene desaturase  29.98 
 
 
504 aa  156  8e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678565  normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2045  phytoene desaturase  26.86 
 
 
490 aa  155  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.716362  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0386  FAD dependent oxidoreductase  32.71 
 
 
451 aa  152  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0302403  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3228  Zeta-phytoene desaturase  28.74 
 
 
519 aa  152  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285222  normal  0.0185992 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3200  phytoene desaturase  30.06 
 
 
508 aa  150  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177165  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  28.57 
 
 
492 aa  150  7e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3156  phytoene desaturase  28.51 
 
 
509 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.205158  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0143  amine oxidase  27.99 
 
 
519 aa  149  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2546  phytoene desaturase  30.9 
 
 
496 aa  148  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.343335  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0493  phytoene desaturase  28.19 
 
 
507 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.145536  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1847  phytoene dehydrogenase-related protein  29.69 
 
 
503 aa  147  5e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  29.55 
 
 
498 aa  145  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02162  phytoene dehydrogenase  25.57 
 
 
537 aa  145  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2704  phytoene desaturase  27.51 
 
 
498 aa  145  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3134  amine oxidase  29.8 
 
 
492 aa  144  5e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.954476  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2742  phytoene desaturase  26.89 
 
 
553 aa  144  6e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1578  phytoene dehydrogenase-related protein  30.43 
 
 
504 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0475016 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2128  phytoene desaturase  28.85 
 
 
504 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.423753  decreased coverage  0.0000406201 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1024  phytoene dehydrogenase-related protein  26.88 
 
 
518 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3750  phytoene desaturase  28.09 
 
 
530 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1619  phytoene dehydrogenase-related protein  29.6 
 
 
508 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2268  phytoene desaturase  28.32 
 
 
497 aa  139  1e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3637  phytoene desaturase  27.33 
 
 
530 aa  139  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.197726  normal  0.0326307 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2211  phytoene desaturase  28.46 
 
 
531 aa  137  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  0.130578 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3441  phytoene desaturase  27.81 
 
 
530 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.826621  normal  0.0554878 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  25.8 
 
 
493 aa  135  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0845  amine oxidase  27.03 
 
 
492 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5128  zeta-phytoene desaturase  28.95 
 
 
506 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.146602 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5454  phytoene dehydrogenase-related protein  29.52 
 
 
512 aa  133  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2373  phytoene desaturase  26.17 
 
 
519 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145608  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2502  phytoene desaturase  31.35 
 
 
494 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000691138  hitchhiker  0.00865975 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1387  amine oxidase  28.31 
 
 
503 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  hitchhiker  0.00651843 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2306  FAD dependent oxidoreductase  30.19 
 
 
494 aa  132  1.0000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5620  phytoene desaturase  26.83 
 
 
497 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.476172 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5075  amine oxidase  29.33 
 
 
512 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3827  phytoene desaturase  31.38 
 
 
489 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47122  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5163  phytoene dehydrogenase-related protein  29.33 
 
 
512 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134146  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1399  phytoene desaturase  30.3 
 
 
502 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1816  amine oxidase  27.36 
 
 
492 aa  130  5.0000000000000004e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3508  phytoene dehydrogenase  28.69 
 
 
524 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.691648  normal  0.885719 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2030  phytoene desaturase  26.79 
 
 
501 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3011  phytoene desaturase  30.08 
 
 
508 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.194152  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00915  CrtI1  24.8 
 
 
488 aa  127  3e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  24.05 
 
 
502 aa  127  5e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  24.05 
 
 
502 aa  127  5e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1360  phytoene desaturase  25.26 
 
 
500 aa  127  6e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.259348 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1000  phytoene desaturase  26.22 
 
 
549 aa  126  9e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3309  phytoene desaturase  30.02 
 
 
494 aa  126  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3236  phytoene desaturase  29.69 
 
 
508 aa  126  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.689878  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2155  phytoene dehydrogenase-related protein  26.75 
 
 
553 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.774687  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1001  phytoene desaturase  27.7 
 
 
527 aa  126  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.917372  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29222  predicted protein  27.17 
 
 
521 aa  125  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.821914  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>