265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3693 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3693  phytoene desaturase  100 
 
 		 499 aa  974    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357896 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2822  phytoene desaturase  66.67 
 
 		 511 aa  570  1e-161  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.429882  normal  0.241296 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2953  phytoene desaturase  67.46 
 
 		 499 aa  569  1e-161  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294845 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2726  phytoene desaturase  67.46 
 
 		 499 aa  571  1e-161  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2848  phytoene desaturase  68.03 
 
 		 512 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.984953  normal  0.88934 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4005  FAD dependent oxidoreductase  58.95 
 
 		 516 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.665607  hitchhiker  0.00234507 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3760  FAD dependent oxidoreductase  57.92 
 
 		 524 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00569391 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1289  FAD dependent oxidoreductase  56.4 
 
 		 516 aa  521  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.571457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6441  hydroxyneurosporene and rhodopin dehydrogenase  58.65 
 
 		 509 aa  524  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2984  CrtD protein  58.8 
 
 		 503 aa  511  1e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2048  phytoene desaturase  59.22 
 
 		 515 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.51701 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1706  phytoene desaturase  55.6 
 
 		 519 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1614  phytoene dehydrogenase-related protein  56.6 
 
 		 520 aa  465  9.999999999999999e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0183  amine oxidase  45.22 
 
 		 523 aa  346  6e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3513  methoxyneurosporene dehydrogenase  47.34 
 
 		 532 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.705776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2040  phytoene dehydrogenase-related protein  45.51 
 
 		 495 aa  318  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.492251 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1910  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.71 
 
 		 495 aa  302  8.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.295436 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0266  methoxyneurosporene dehydrogenase  45.7 
 
 		 495 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0609  zeta-phytoene desaturase  35.93 
 
 		 495 aa  258  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.392694  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2535  zeta-phytoene desaturase  35.27 
 
 		 491 aa  230  4e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00482984  unclonable  0.000000000435247 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1811  phytoene dehydrogenase-related protein  34.15 
 
 		 502 aa  209  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000642179  normal  0.0141145 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5031  phytoene desaturase  33.33 
 
 		 509 aa  207  4e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3833  hydroxyneurosporene dehydrogenase  36.89 
 
 		 471 aa  202  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0251377 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3745  phytoene desaturase  32.01 
 
 		 512 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3436  phytoene desaturase  32.01 
 
 		 512 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240701 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2983  phytoene desaturase  33.54 
 
 		 495 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00166806  normal  0.0111696 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1108  phytoene desaturase  36.38 
 
 		 500 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556955  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3225  Zeta-phytoene desaturase  34.59 
 
 		 475 aa  195  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328594  hitchhiker  0.00724213 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3632  phytoene desaturase  31.81 
 
 		 512 aa  195  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.109765  normal  0.0371662 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2640  zeta-phytoene desaturase  26.19 
 
 		 497 aa  185  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2586  zeta-phytoene desaturase  26.19 
 
 		 497 aa  185  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3156  phytoene desaturase  31.68 
 
 		 509 aa  183  6e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.205158  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1387  amine oxidase  32.73 
 
 		 503 aa  179  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  hitchhiker  0.00651843 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3228  Zeta-phytoene desaturase  31.03 
 
 		 519 aa  179  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285222  normal  0.0185992 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  33.27 
 
 		 508 aa  177  5e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2742  phytoene desaturase  30.43 
 
 		 553 aa  174  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0845  amine oxidase  32.02 
 
 		 492 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3248  phytoene dehydrogenase-related protein  34.24 
 
 		 495 aa  173  5e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.242639  normal  0.13988 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2211  phytoene desaturase  29.94 
 
 		 531 aa  173  5.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  0.130578 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2740  phytoene desaturase  29.1 
 
 		 518 aa  173  6.999999999999999e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3309  phytoene desaturase  33.73 
 
 		 494 aa  172  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1392  FAD dependent oxidoreductase  34.58 
 
 		 495 aa  170  4e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000446309 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  27.16 
 
 		 511 aa  170  7e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  29.9 
 
 		 498 aa  169  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  26.72 
 
 		 511 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  28.07 
 
 		 493 aa  169  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3573  phytoene desaturase  32.42 
 
 		 509 aa  168  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  28.02 
 
 		 511 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  26.92 
 
 		 511 aa  167  5e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0796  phytoene desaturase  27.82 
 
 		 475 aa  167  5.9999999999999996e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3200  phytoene desaturase  28.8 
 
 		 508 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5197  phytoene desaturase  31.66 
 
 		 525 aa  163  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3475  zeta-phytoene desaturase  33.8 
 
 		 495 aa  162  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.419175  normal  0.0366285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5124  zeta-phytoene desaturase  34.62 
 
 		 452 aa  160  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.229738  normal  0.0794369 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1046  phytoene dehydrogenase  23.02 
 
 		 494 aa  160  6e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2268  phytoene desaturase  29.35 
 
 		 497 aa  160  7e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3134  amine oxidase  28.94 
 
 		 492 aa  159  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.954476  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  30.96 
 
 		 507 aa  159  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1847  phytoene dehydrogenase-related protein  31.75 
 
 		 503 aa  158  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3809  phytoene desaturase  31.63 
 
 		 492 aa  157  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2546  phytoene desaturase  32.31 
 
 		 496 aa  156  6e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.343335  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02162  phytoene dehydrogenase  24.45 
 
 		 537 aa  156  8e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4929  zeta-phytoene desaturase  29.25 
 
 		 492 aa  155  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258823  normal  0.799895 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3827  phytoene desaturase  30.78 
 
 		 489 aa  155  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47122  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5128  zeta-phytoene desaturase  30.97 
 
 		 506 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.146602 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4439  phytoene dehydrogenase-related protein  29.88 
 
 		 492 aa  154  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.93912 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  25.87 
 
 		 492 aa  153  5.9999999999999996e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  29.77 
 
 		 505 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3577  zeta-phytoene desaturase  28.51 
 
 		 504 aa  152  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0143  amine oxidase  25.5 
 
 		 519 aa  152  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2704  phytoene desaturase  30.02 
 
 		 498 aa  152  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1619  phytoene dehydrogenase-related protein  29.61 
 
 		 508 aa  152  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1399  phytoene desaturase  31.52 
 
 		 502 aa  152  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  29.31 
 
 		 512 aa  150  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5075  amine oxidase  29.55 
 
 		 512 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5163  phytoene dehydrogenase-related protein  29.55 
 
 		 512 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0493  phytoene desaturase  28.8 
 
 		 507 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.145536  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2710  phytoene desaturase  26.63 
 
 		 546 aa  146  7.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.487747 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5454  phytoene dehydrogenase-related protein  29.37 
 
 		 512 aa  146  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3236  phytoene desaturase  29.51 
 
 		 508 aa  145  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.689878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3488  zeta-phytoene desaturase  26.23 
 
 		 552 aa  144  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0943  phytoene dehydrogenase-related protein  28.77 
 
 		 495 aa  144  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.988075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3011  phytoene desaturase  29.33 
 
 		 508 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.194152  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1000  phytoene desaturase  27.04 
 
 		 549 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2128  phytoene desaturase  27.24 
 
 		 504 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.423753  decreased coverage  0.0000406201 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1816  amine oxidase  27.56 
 
 		 492 aa  142  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2155  phytoene dehydrogenase-related protein  26.23 
 
 		 553 aa  141  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.774687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3441  phytoene desaturase  30.54 
 
 		 530 aa  141  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.826621  normal  0.0554878 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1585  zeta-phytoene desaturase  28.99 
 
 		 492 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3750  phytoene desaturase  30.12 
 
 		 530 aa  140  6e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1712  phytoene desaturase  26.28 
 
 		 504 aa  138  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678565  normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2045  phytoene desaturase  26.67 
 
 		 490 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.716362  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2502  phytoene desaturase  29.66 
 
 		 494 aa  136  9e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000691138  hitchhiker  0.00865975 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0470  phytoene desaturase  31.34 
 
 		 496 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.605444  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3637  phytoene desaturase  28.72 
 
 		 530 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.197726  normal  0.0326307 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1897  phytoene desaturase  27.27 
 
 		 499 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.29228 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1578  phytoene dehydrogenase-related protein  28.97 
 
 		 504 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475016 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2093  phytoene desaturase  24.9 
 
 		 493 aa  134  5e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456364  decreased coverage  0.00855511 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5620  phytoene desaturase  25.9 
 
 		 497 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.476172 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3075  putative phytoene desaturase  29.06 
 
 		 506 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.873802  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>