More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2843 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  67.21 
 
 		 511 aa  682    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  63.34 
 
 		 511 aa  665    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  68.79 
 
 		 512 aa  668    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  67.41 
 
 		 511 aa  687    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3200  phytoene desaturase  80.31 
 
 		 508 aa  809    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3236  phytoene desaturase  79.72 
 
 		 508 aa  783    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.689878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  76.77 
 
 		 508 aa  762    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1619  phytoene dehydrogenase-related protein  64.57 
 
 		 508 aa  640    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  100 
 
 		 507 aa  1010    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3011  phytoene desaturase  80.31 
 
 		 508 aa  796    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.194152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  65.99 
 
 		 511 aa  677    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0493  phytoene desaturase  64.5 
 
 		 507 aa  630  1e-179  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.145536  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  53.39 
 
 		 492 aa  533  1e-150  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02162  phytoene dehydrogenase  48.28 
 
 		 537 aa  506  9.999999999999999e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0143  amine oxidase  50.41 
 
 		 519 aa  503  1e-141  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3577  zeta-phytoene desaturase  53.14 
 
 		 504 aa  494  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1024  phytoene dehydrogenase-related protein  49.39 
 
 		 518 aa  484  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0271  phytoene dehydrogenase  49.8 
 
 		 518 aa  474  1e-132  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1914  phytoene dehydrogenase-related protein  49.8 
 
 		 518 aa  474  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.603026 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  48.55 
 
 		 493 aa  459  9.999999999999999e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2211  phytoene desaturase  51.93 
 
 		 531 aa  458  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  0.130578 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3508  phytoene dehydrogenase  48.99 
 
 		 524 aa  457  1e-127  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.691648  normal  0.885719 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2029  phytoene desaturase  49.89 
 
 		 496 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1712  phytoene desaturase  48.07 
 
 		 504 aa  454  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678565  normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  49.39 
 
 		 505 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1585  zeta-phytoene desaturase  50.86 
 
 		 492 aa  448  1e-125  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  50.1 
 
 		 498 aa  445  1e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3488  zeta-phytoene desaturase  45.75 
 
 		 552 aa  440  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2155  phytoene dehydrogenase-related protein  45.85 
 
 		 553 aa  438  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.774687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1816  amine oxidase  47.81 
 
 		 492 aa  436  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0943  phytoene dehydrogenase-related protein  50 
 
 		 495 aa  436  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.988075 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2710  phytoene desaturase  45.44 
 
 		 546 aa  429  1e-119  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.487747 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1000  phytoene desaturase  46.11 
 
 		 549 aa  428  1e-118  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3134  amine oxidase  47.02 
 
 		 492 aa  419  1e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.954476  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0524  amine oxidase  45.06 
 
 		 556 aa  394  1e-108  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.599626 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5197  phytoene desaturase  38.43 
 
 		 525 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3441  phytoene desaturase  37.91 
 
 		 530 aa  279  7e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.826621  normal  0.0554878 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3750  phytoene desaturase  37.91 
 
 		 530 aa  279  7e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2268  phytoene desaturase  35.03 
 
 		 497 aa  270  2.9999999999999997e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2742  phytoene desaturase  34.85 
 
 		 553 aa  266  5e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3637  phytoene desaturase  36.99 
 
 		 530 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.197726  normal  0.0326307 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3573  phytoene desaturase  38.12 
 
 		 509 aa  259  6e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3075  putative phytoene desaturase  37.53 
 
 		 506 aa  257  3e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.873802  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1387  amine oxidase  36.1 
 
 		 503 aa  256  8e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  hitchhiker  0.00651843 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5128  zeta-phytoene desaturase  36.1 
 
 		 506 aa  254  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.146602 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1046  phytoene dehydrogenase  29.67 
 
 		 494 aa  254  3e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26410  UDP-galactopyranose mutase  37.98 
 
 		 507 aa  251  2e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0845  amine oxidase  35.74 
 
 		 492 aa  251  2e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5031  phytoene desaturase  34.94 
 
 		 509 aa  249  6e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3436  phytoene desaturase  34.91 
 
 		 512 aa  247  3e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240701 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3632  phytoene desaturase  34.7 
 
 		 512 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.109765  normal  0.0371662 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3745  phytoene desaturase  34.7 
 
 		 512 aa  246  6e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5038  phytoene desaturase  35.21 
 
 		 529 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.710499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1811  phytoene dehydrogenase-related protein  35.47 
 
 		 502 aa  245  9.999999999999999e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000642179  normal  0.0141145 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2128  phytoene desaturase  34.1 
 
 		 504 aa  241  2e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.423753  decreased coverage  0.0000406201 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1399  phytoene desaturase  37.6 
 
 		 502 aa  241  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3228  Zeta-phytoene desaturase  33.61 
 
 		 519 aa  240  4e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285222  normal  0.0185992 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2535  zeta-phytoene desaturase  35.56 
 
 		 491 aa  239  9e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00482984  unclonable  0.000000000435247 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4929  zeta-phytoene desaturase  35.9 
 
 		 492 aa  239  9e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258823  normal  0.799895 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2740  phytoene desaturase  32.02 
 
 		 518 aa  236  5.0000000000000005e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4439  phytoene dehydrogenase-related protein  35.04 
 
 		 492 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.93912 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  29.14 
 
 		 502 aa  236  8e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  29.14 
 
 		 502 aa  236  8e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2045  phytoene desaturase  32.77 
 
 		 490 aa  234  3e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.716362  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0609  zeta-phytoene desaturase  33.04 
 
 		 495 aa  233  9e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.392694  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1847  phytoene dehydrogenase-related protein  35.95 
 
 		 503 aa  231  3e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1810  phytoene dehydrogenase family protein  25.81 
 
 		 499 aa  231  3e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.149228  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1578  phytoene dehydrogenase-related protein  35.04 
 
 		 504 aa  228  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475016 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0116  phytoene dehydrogenase-related protein  31.85 
 
 		 491 aa  225  2e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5454  phytoene dehydrogenase-related protein  34.76 
 
 		 512 aa  220  5e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3156  phytoene desaturase  33.68 
 
 		 509 aa  220  5e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.205158  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2502  phytoene desaturase  33.83 
 
 		 494 aa  219  7e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000691138  hitchhiker  0.00865975 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5075  amine oxidase  34.76 
 
 		 512 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5163  phytoene dehydrogenase-related protein  34.76 
 
 		 512 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2704  phytoene desaturase  31.75 
 
 		 498 aa  215  1.9999999999999998e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13830  phytoene desaturase  32.68 
 
 		 552 aa  214  2.9999999999999995e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000359632  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00915  CrtI1  27.44 
 
 		 488 aa  213  4.9999999999999996e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5620  phytoene desaturase  27.14 
 
 		 497 aa  212  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.476172 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5960  phytoene desaturase  29.25 
 
 		 490 aa  211  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2030  phytoene desaturase  28.3 
 
 		 501 aa  208  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1897  phytoene desaturase  30.02 
 
 		 499 aa  204  2e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.29228 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2586  zeta-phytoene desaturase  27.35 
 
 		 497 aa  204  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2640  zeta-phytoene desaturase  27.35 
 
 		 497 aa  204  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0057  phytoene dehydrogenase-related protein  25.84 
 
 		 488 aa  199  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2545  phytoene desaturase  31.76 
 
 		 536 aa  198  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139145  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2983  phytoene desaturase  32.05 
 
 		 495 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00166806  normal  0.0111696 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1684  phytoene desaturase  30.99 
 
 		 506 aa  196  1e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127101  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3809  phytoene desaturase  33.2 
 
 		 492 aa  192  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3309  phytoene desaturase  33.47 
 
 		 494 aa  192  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2373  phytoene desaturase  28.71 
 
 		 519 aa  190  5e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145608  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2093  phytoene desaturase  25.61 
 
 		 493 aa  188  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456364  decreased coverage  0.00855511 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1360  phytoene desaturase  28.69 
 
 		 500 aa  188  2e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.259348 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29222  predicted protein  27.94 
 
 		 521 aa  183  8.000000000000001e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.821914  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21220  phytoene desaturase  30.62 
 
 		 566 aa  181  2e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3491  phytoene desaturase  34.07 
 
 		 551 aa  180  5.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04430  phytoene desaturase  30.08 
 
 		 548 aa  179  1e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12770  phytoene desaturase  30.16 
 
 		 532 aa  176  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.500323 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1001  phytoene desaturase  28.06 
 
 		 527 aa  175  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.917372  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2891  phytoene desaturase  33.33 
 
 		 550 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.101189 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1606  phytoene desaturase  23.09 
 
 		 511 aa  174  2.9999999999999996e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000200105  unclonable  6.43078e-23 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>