228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0796 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0796  phytoene desaturase  100 
 
 		 475 aa  999    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0609  zeta-phytoene desaturase  35.48 
 
 		 495 aa  265  2e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.392694  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2535  zeta-phytoene desaturase  36.22 
 
 		 491 aa  251  2e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00482984  unclonable  0.000000000435247 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1811  phytoene dehydrogenase-related protein  35.19 
 
 		 502 aa  247  3e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000642179  normal  0.0141145 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0845  amine oxidase  31.71 
 
 		 492 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2983  phytoene desaturase  34.1 
 
 		 495 aa  230  5e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00166806  normal  0.0111696 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5031  phytoene desaturase  28.88 
 
 		 509 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  28.09 
 
 		 492 aa  211  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3632  phytoene desaturase  28.83 
 
 		 512 aa  211  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.109765  normal  0.0371662 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3745  phytoene desaturase  28.63 
 
 		 512 aa  211  3e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3436  phytoene desaturase  28.83 
 
 		 512 aa  211  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240701 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5620  phytoene desaturase  28.34 
 
 		 497 aa  210  6e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.476172 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3833  hydroxyneurosporene dehydrogenase  30.74 
 
 		 471 aa  206  9e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0251377 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  28.17 
 
 		 505 aa  204  4e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2045  phytoene desaturase  29.65 
 
 		 490 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.716362  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0116  phytoene dehydrogenase-related protein  30.47 
 
 		 491 aa  201  3e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2586  zeta-phytoene desaturase  28.03 
 
 		 497 aa  200  6e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2640  zeta-phytoene desaturase  28.03 
 
 		 497 aa  200  6e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  25.05 
 
 		 511 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3156  phytoene desaturase  28.84 
 
 		 509 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.205158  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  26.99 
 
 		 512 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1289  FAD dependent oxidoreductase  29.03 
 
 		 516 aa  196  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.571457  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2740  phytoene desaturase  27.72 
 
 		 518 aa  196  6e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2704  phytoene desaturase  27.88 
 
 		 498 aa  194  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4005  FAD dependent oxidoreductase  28.6 
 
 		 516 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.665607  hitchhiker  0.00234507 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3248  phytoene dehydrogenase-related protein  27.41 
 
 		 495 aa  195  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.242639  normal  0.13988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5960  phytoene desaturase  28.83 
 
 		 490 aa  194  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  26.26 
 
 		 511 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  26.06 
 
 		 511 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2211  phytoene desaturase  26.09 
 
 		 531 aa  191  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  0.130578 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1712  phytoene desaturase  28.83 
 
 		 504 aa  191  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678565  normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3225  Zeta-phytoene desaturase  27.78 
 
 		 475 aa  190  5e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328594  hitchhiker  0.00724213 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  26.06 
 
 		 511 aa  189  9e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2373  phytoene desaturase  28.93 
 
 		 519 aa  187  3e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145608  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3760  FAD dependent oxidoreductase  28 
 
 		 524 aa  186  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00569391 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  27.38 
 
 		 508 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6441  hydroxyneurosporene and rhodopin dehydrogenase  28.57 
 
 		 509 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3475  zeta-phytoene desaturase  28.09 
 
 		 495 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.419175  normal  0.0366285 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1108  phytoene desaturase  26.95 
 
 		 500 aa  184  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556955  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2093  phytoene desaturase  25.4 
 
 		 493 aa  182  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456364  decreased coverage  0.00855511 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5197  phytoene desaturase  28.29 
 
 		 525 aa  180  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2546  phytoene desaturase  29.55 
 
 		 496 aa  179  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.343335  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  26.93 
 
 		 507 aa  179  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00915  CrtI1  25.31 
 
 		 488 aa  178  2e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3693  phytoene desaturase  27.63 
 
 		 499 aa  177  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357896 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0057  phytoene dehydrogenase-related protein  27.7 
 
 		 488 aa  176  6e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1706  phytoene desaturase  28.21 
 
 		 519 aa  176  7e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1392  FAD dependent oxidoreductase  28.69 
 
 		 495 aa  176  9e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000446309 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3228  Zeta-phytoene desaturase  27.27 
 
 		 519 aa  176  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285222  normal  0.0185992 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4929  zeta-phytoene desaturase  26.56 
 
 		 492 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258823  normal  0.799895 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  28.37 
 
 		 498 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1614  phytoene dehydrogenase-related protein  29.9 
 
 		 520 aa  172  1e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2030  phytoene desaturase  25.51 
 
 		 501 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3577  zeta-phytoene desaturase  25.73 
 
 		 504 aa  171  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  24.37 
 
 		 502 aa  170  4e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  24.37 
 
 		 502 aa  170  4e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2128  phytoene desaturase  26.24 
 
 		 504 aa  170  5e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.423753  decreased coverage  0.0000406201 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1684  phytoene desaturase  26.96 
 
 		 506 aa  170  5e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127101  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1619  phytoene dehydrogenase-related protein  24.74 
 
 		 508 aa  169  7e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2545  phytoene desaturase  27.86 
 
 		 536 aa  170  7e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139145  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0183  amine oxidase  29.31 
 
 		 523 aa  169  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2268  phytoene desaturase  26.76 
 
 		 497 aa  167  2.9999999999999998e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2742  phytoene desaturase  26.45 
 
 		 553 aa  167  2.9999999999999998e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1360  phytoene desaturase  28.86 
 
 		 500 aa  167  4e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.259348 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3134  amine oxidase  27.5 
 
 		 492 aa  167  5e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.954476  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1897  phytoene desaturase  27.86 
 
 		 499 aa  167  5e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.29228 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3750  phytoene desaturase  27.69 
 
 		 530 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2726  phytoene desaturase  27.25 
 
 		 499 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3441  phytoene desaturase  27.49 
 
 		 530 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.826621  normal  0.0554878 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4439  phytoene dehydrogenase-related protein  25.93 
 
 		 492 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.93912 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1001  phytoene desaturase  26.26 
 
 		 527 aa  165  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.917372  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1810  phytoene dehydrogenase family protein  24.76 
 
 		 499 aa  163  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.149228  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1024  phytoene dehydrogenase-related protein  25.91 
 
 		 518 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0493  phytoene desaturase  24.95 
 
 		 507 aa  163  7e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.145536  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0703  phytoene desaturase  26.11 
 
 		 453 aa  163  8.000000000000001e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.687275  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1578  phytoene dehydrogenase-related protein  27.38 
 
 		 504 aa  162  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475016 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2953  phytoene desaturase  27.85 
 
 		 499 aa  162  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294845 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3637  phytoene desaturase  26.76 
 
 		 530 aa  161  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.197726  normal  0.0326307 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3513  methoxyneurosporene dehydrogenase  28.23 
 
 		 532 aa  160  3e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.705776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3200  phytoene desaturase  24.75 
 
 		 508 aa  160  7e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5038  phytoene desaturase  26.14 
 
 		 529 aa  159  7e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.710499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2848  phytoene desaturase  28.48 
 
 		 512 aa  159  9e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.984953  normal  0.88934 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13830  phytoene desaturase  25.8 
 
 		 552 aa  159  9e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000359632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  24.7 
 
 		 493 aa  157  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2984  CrtD protein  28.89 
 
 		 503 aa  157  4e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0143  amine oxidase  23.75 
 
 		 519 aa  157  4e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2048  phytoene desaturase  27.71 
 
 		 515 aa  156  6e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.51701 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3827  phytoene desaturase  26.44 
 
 		 489 aa  156  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47122  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2502  phytoene desaturase  27.03 
 
 		 494 aa  155  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000691138  hitchhiker  0.00865975 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1847  phytoene dehydrogenase-related protein  27.13 
 
 		 503 aa  155  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2822  phytoene desaturase  25.73 
 
 		 511 aa  155  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.429882  normal  0.241296 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1816  amine oxidase  25.79 
 
 		 492 aa  154  4e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0340  phytoene desaturase  25.87 
 
 		 542 aa  154  5e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0903063 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29222  predicted protein  25.33 
 
 		 521 aa  153  7e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.821914  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5124  zeta-phytoene desaturase  26.26 
 
 		 452 aa  153  8e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.229738  normal  0.0794369 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2040  phytoene dehydrogenase-related protein  27.69 
 
 		 495 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.492251 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3011  phytoene desaturase  25.16 
 
 		 508 aa  152  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.194152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2155  phytoene dehydrogenase-related protein  24.26 
 
 		 553 aa  151  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.774687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04430  phytoene desaturase  25.14 
 
 		 548 aa  150  3e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3236  phytoene desaturase  25.36 
 
 		 508 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.689878  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>