294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0524 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3488  zeta-phytoene desaturase  71.3 
 
 
552 aa  783    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2710  phytoene desaturase  73.67 
 
 
546 aa  794    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.487747 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1000  phytoene desaturase  72.57 
 
 
549 aa  786    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0524  amine oxidase  100 
 
 
556 aa  1115    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.599626 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2155  phytoene dehydrogenase-related protein  71.16 
 
 
553 aa  775    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.774687  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  47.54 
 
 
492 aa  456  1e-127  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  45.32 
 
 
512 aa  437  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  43.98 
 
 
511 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  43.39 
 
 
493 aa  432  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  43.05 
 
 
511 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  43.48 
 
 
511 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3577  zeta-phytoene desaturase  45.34 
 
 
504 aa  428  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557125  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  46.05 
 
 
508 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  42.67 
 
 
511 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3200  phytoene desaturase  45.04 
 
 
508 aa  414  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177165  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  44.97 
 
 
507 aa  415  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1619  phytoene dehydrogenase-related protein  44.99 
 
 
508 aa  412  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3236  phytoene desaturase  44.82 
 
 
508 aa  404  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.689878  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  43.13 
 
 
498 aa  399  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3011  phytoene desaturase  44.44 
 
 
508 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.194152  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0493  phytoene desaturase  43.18 
 
 
507 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.145536  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  42.75 
 
 
505 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1712  phytoene desaturase  41.57 
 
 
504 aa  394  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678565  normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2211  phytoene desaturase  41.92 
 
 
531 aa  389  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  0.130578 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1585  zeta-phytoene desaturase  42.29 
 
 
492 aa  384  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02162  phytoene dehydrogenase  37.78 
 
 
537 aa  372  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1816  amine oxidase  40.9 
 
 
492 aa  375  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3134  amine oxidase  41.92 
 
 
492 aa  374  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.954476  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0943  phytoene dehydrogenase-related protein  41.62 
 
 
495 aa  372  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.988075 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0143  amine oxidase  36.04 
 
 
519 aa  329  7e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1024  phytoene dehydrogenase-related protein  36.67 
 
 
518 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2029  phytoene desaturase  39.26 
 
 
496 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3508  phytoene dehydrogenase  37.62 
 
 
524 aa  318  1e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.691648  normal  0.885719 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0271  phytoene dehydrogenase  35.93 
 
 
518 aa  311  2e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1914  phytoene dehydrogenase-related protein  35.93 
 
 
518 aa  311  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.603026 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5197  phytoene desaturase  31.61 
 
 
525 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  29.68 
 
 
502 aa  231  3e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  29.68 
 
 
502 aa  231  3e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0845  amine oxidase  32.01 
 
 
492 aa  216  8e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3637  phytoene desaturase  31.15 
 
 
530 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.197726  normal  0.0326307 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3441  phytoene desaturase  31.01 
 
 
530 aa  211  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.826621  normal  0.0554878 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3750  phytoene desaturase  30.83 
 
 
530 aa  210  5e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2742  phytoene desaturase  29.6 
 
 
553 aa  208  2e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1046  phytoene dehydrogenase  26.58 
 
 
494 aa  203  8e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3573  phytoene desaturase  31.01 
 
 
509 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5128  zeta-phytoene desaturase  30.17 
 
 
506 aa  194  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.146602 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5038  phytoene desaturase  30.25 
 
 
529 aa  193  6e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.710499  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2268  phytoene desaturase  28.31 
 
 
497 aa  189  8e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1847  phytoene dehydrogenase-related protein  29.89 
 
 
503 aa  189  9e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2704  phytoene desaturase  28.97 
 
 
498 aa  186  6e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2045  phytoene desaturase  30.08 
 
 
490 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.716362  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2128  phytoene desaturase  27.54 
 
 
504 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.423753  decreased coverage  0.0000406201 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3228  Zeta-phytoene desaturase  29.41 
 
 
519 aa  184  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285222  normal  0.0185992 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2502  phytoene desaturase  30.21 
 
 
494 aa  182  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000691138  hitchhiker  0.00865975 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1810  phytoene dehydrogenase family protein  23.45 
 
 
499 aa  180  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.149228  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4439  phytoene dehydrogenase-related protein  30.31 
 
 
492 aa  180  7e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.93912 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1387  amine oxidase  28.68 
 
 
503 aa  179  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  hitchhiker  0.00651843 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2545  phytoene desaturase  28.93 
 
 
536 aa  179  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139145  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3436  phytoene desaturase  28.36 
 
 
512 aa  178  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.240701 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3745  phytoene desaturase  27.84 
 
 
512 aa  177  6e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26410  UDP-galactopyranose mutase  30.15 
 
 
507 aa  176  8e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3075  putative phytoene desaturase  29.55 
 
 
506 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.873802  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1897  phytoene desaturase  26.89 
 
 
499 aa  176  9.999999999999999e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.29228 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13830  phytoene desaturase  28.79 
 
 
552 aa  175  1.9999999999999998e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000359632  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0609  zeta-phytoene desaturase  27.79 
 
 
495 aa  175  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.392694  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5031  phytoene desaturase  28.05 
 
 
509 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4929  zeta-phytoene desaturase  30.06 
 
 
492 aa  173  9e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258823  normal  0.799895 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1001  phytoene desaturase  29.7 
 
 
527 aa  173  9e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.917372  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3632  phytoene desaturase  27.68 
 
 
512 aa  172  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.109765  normal  0.0371662 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0116  phytoene dehydrogenase-related protein  27.32 
 
 
491 aa  168  2e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5454  phytoene dehydrogenase-related protein  28.07 
 
 
512 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5075  amine oxidase  27.88 
 
 
512 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5163  phytoene dehydrogenase-related protein  27.88 
 
 
512 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134146  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2373  phytoene desaturase  27.39 
 
 
519 aa  164  3e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145608  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2535  zeta-phytoene desaturase  28.46 
 
 
491 aa  164  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00482984  unclonable  0.000000000435247 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1578  phytoene dehydrogenase-related protein  28.33 
 
 
504 aa  164  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0475016 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1606  phytoene desaturase  23.32 
 
 
511 aa  163  9e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000200105  unclonable  6.43078e-23 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1811  phytoene dehydrogenase-related protein  27.78 
 
 
502 aa  162  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000642179  normal  0.0141145 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2740  phytoene desaturase  25.88 
 
 
518 aa  161  3e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3809  phytoene desaturase  28.44 
 
 
492 aa  155  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3156  phytoene desaturase  27.2 
 
 
509 aa  154  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.205158  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2983  phytoene desaturase  26.69 
 
 
495 aa  151  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00166806  normal  0.0111696 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5960  phytoene desaturase  24.77 
 
 
490 aa  152  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1360  phytoene desaturase  25.14 
 
 
500 aa  152  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.259348 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2093  phytoene desaturase  23.92 
 
 
493 aa  150  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456364  decreased coverage  0.00855511 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1399  phytoene desaturase  27.22 
 
 
502 aa  150  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5620  phytoene desaturase  25.51 
 
 
497 aa  148  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.476172 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3309  phytoene desaturase  29.54 
 
 
494 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2546  phytoene desaturase  29.56 
 
 
496 aa  147  7.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.343335  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2640  zeta-phytoene desaturase  25.34 
 
 
497 aa  143  9e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2586  zeta-phytoene desaturase  25.34 
 
 
497 aa  143  9e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2891  phytoene desaturase  30.09 
 
 
550 aa  140  7e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.101189 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2030  phytoene desaturase  25.09 
 
 
501 aa  139  8.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05325  Phytoene dehydrogenase C terminal region  33.04 
 
 
238 aa  139  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.156493  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3225  Zeta-phytoene desaturase  29.11 
 
 
475 aa  139  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328594  hitchhiker  0.00724213 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00915  CrtI1  25.42 
 
 
488 aa  139  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04430  phytoene desaturase  27.49 
 
 
548 aa  138  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0057  phytoene dehydrogenase-related protein  23.55 
 
 
488 aa  138  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0340  phytoene desaturase  25.83 
 
 
542 aa  138  3.0000000000000003e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0903063 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3827  phytoene desaturase  26.63 
 
 
489 aa  138  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47122  normal  0.0454978 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>