More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2502 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2502  phytoene desaturase  100 
 
 		 494 aa  971    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000691138  hitchhiker  0.00865975 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3573  phytoene desaturase  53.09 
 
 		 509 aa  437  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4929  zeta-phytoene desaturase  52 
 
 		 492 aa  422  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258823  normal  0.799895 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3228  Zeta-phytoene desaturase  51.42 
 
 		 519 aa  416  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285222  normal  0.0185992 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4439  phytoene dehydrogenase-related protein  51.16 
 
 		 492 aa  416  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.93912 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1387  amine oxidase  49.9 
 
 		 503 aa  402  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  hitchhiker  0.00651843 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1847  phytoene dehydrogenase-related protein  48.91 
 
 		 503 aa  396  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5075  amine oxidase  50 
 
 		 512 aa  395  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5163  phytoene dehydrogenase-related protein  50 
 
 		 512 aa  395  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5454  phytoene dehydrogenase-related protein  50.1 
 
 		 512 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5128  zeta-phytoene desaturase  49.07 
 
 		 506 aa  385  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.146602 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1578  phytoene dehydrogenase-related protein  48.77 
 
 		 504 aa  384  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475016 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26410  UDP-galactopyranose mutase  50.82 
 
 		 507 aa  385  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3075  putative phytoene desaturase  49.38 
 
 		 506 aa  379  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.873802  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1399  phytoene desaturase  50.41 
 
 		 502 aa  381  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3809  phytoene desaturase  47.84 
 
 		 492 aa  369  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3827  phytoene desaturase  47.55 
 
 		 489 aa  363  3e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47122  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3309  phytoene desaturase  49.49 
 
 		 494 aa  362  8e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0470  phytoene desaturase  41.99 
 
 		 496 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.605444  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  34.61 
 
 		 492 aa  278  1e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0493  phytoene desaturase  36.16 
 
 		 507 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.145536  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0845  amine oxidase  38.37 
 
 		 492 aa  272  1e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0484  phytoene desaturase  41.85 
 
 		 493 aa  271  2e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  34.3 
 
 		 511 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  34.3 
 
 		 511 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  35.58 
 
 		 512 aa  261  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  33.47 
 
 		 511 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  33.94 
 
 		 493 aa  256  5e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  32.44 
 
 		 511 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  35.64 
 
 		 505 aa  254  3e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2268  phytoene desaturase  34.81 
 
 		 497 aa  253  5.000000000000001e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  35.68 
 
 		 507 aa  249  6e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2704  phytoene desaturase  36.11 
 
 		 498 aa  246  6.999999999999999e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  35.29 
 
 		 498 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  35.86 
 
 		 508 aa  241  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  29.76 
 
 		 502 aa  240  4e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1585  zeta-phytoene desaturase  36.73 
 
 		 492 aa  240  4e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  29.76 
 
 		 502 aa  240  4e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2535  zeta-phytoene desaturase  37.09 
 
 		 491 aa  239  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00482984  unclonable  0.000000000435247 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3441  phytoene desaturase  35.08 
 
 		 530 aa  237  3e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.826621  normal  0.0554878 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2045  phytoene desaturase  33.61 
 
 		 490 aa  237  3e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.716362  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3200  phytoene desaturase  34.99 
 
 		 508 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1619  phytoene dehydrogenase-related protein  35.12 
 
 		 508 aa  236  5.0000000000000005e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5197  phytoene desaturase  35.1 
 
 		 525 aa  236  9e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1712  phytoene desaturase  33.54 
 
 		 504 aa  235  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678565  normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3750  phytoene desaturase  34.88 
 
 		 530 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2211  phytoene desaturase  32.65 
 
 		 531 aa  234  3e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  0.130578 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0143  amine oxidase  31.63 
 
 		 519 aa  233  5e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3134  amine oxidase  34.08 
 
 		 492 aa  231  2e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.954476  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02162  phytoene dehydrogenase  29 
 
 		 537 aa  230  4e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5620  phytoene desaturase  30.3 
 
 		 497 aa  229  7e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.476172 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2742  phytoene desaturase  31.73 
 
 		 553 aa  229  8e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3637  phytoene desaturase  34.04 
 
 		 530 aa  228  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.197726  normal  0.0326307 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3577  zeta-phytoene desaturase  32.41 
 
 		 504 aa  228  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0943  phytoene dehydrogenase-related protein  35.22 
 
 		 495 aa  226  8e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.988075 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3632  phytoene desaturase  32.73 
 
 		 512 aa  225  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.109765  normal  0.0371662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3011  phytoene desaturase  34.99 
 
 		 508 aa  224  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.194152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1816  amine oxidase  33.06 
 
 		 492 aa  221  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3436  phytoene desaturase  32.4 
 
 		 512 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240701 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5031  phytoene desaturase  33.2 
 
 		 509 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2740  phytoene desaturase  32.58 
 
 		 518 aa  220  3.9999999999999997e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1360  phytoene desaturase  33.81 
 
 		 500 aa  220  3.9999999999999997e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.259348 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1001  phytoene desaturase  32.87 
 
 		 527 aa  220  3.9999999999999997e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.917372  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3745  phytoene desaturase  32.53 
 
 		 512 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1024  phytoene dehydrogenase-related protein  32.52 
 
 		 518 aa  220  5e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0116  phytoene dehydrogenase-related protein  32.17 
 
 		 491 aa  219  7e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3236  phytoene desaturase  34.78 
 
 		 508 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.689878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2373  phytoene desaturase  31.13 
 
 		 519 aa  219  7.999999999999999e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145608  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1811  phytoene dehydrogenase-related protein  34.87 
 
 		 502 aa  219  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000642179  normal  0.0141145 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1897  phytoene desaturase  32.31 
 
 		 499 aa  215  9.999999999999999e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.29228 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29222  predicted protein  30.33 
 
 		 521 aa  216  9.999999999999999e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.821914  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1000  phytoene desaturase  29.62 
 
 		 549 aa  215  1.9999999999999998e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1046  phytoene dehydrogenase  28.32 
 
 		 494 aa  212  1e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2030  phytoene desaturase  31.03 
 
 		 501 aa  212  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2128  phytoene desaturase  31.36 
 
 		 504 aa  211  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.423753  decreased coverage  0.0000406201 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2155  phytoene dehydrogenase-related protein  30.24 
 
 		 553 aa  211  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.774687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5038  phytoene desaturase  32.77 
 
 		 529 aa  210  4e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.710499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0609  zeta-phytoene desaturase  32.99 
 
 		 495 aa  207  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.392694  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2545  phytoene desaturase  33.59 
 
 		 536 aa  207  3e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139145  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0271  phytoene dehydrogenase  32.93 
 
 		 518 aa  206  8e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1914  phytoene dehydrogenase-related protein  32.93 
 
 		 518 aa  206  8e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.603026 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2710  phytoene desaturase  28.38 
 
 		 546 aa  205  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.487747 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2983  phytoene desaturase  33.69 
 
 		 495 aa  205  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00166806  normal  0.0111696 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3508  phytoene dehydrogenase  33.13 
 
 		 524 aa  206  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.691648  normal  0.885719 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3488  zeta-phytoene desaturase  28.81 
 
 		 552 aa  205  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3156  phytoene desaturase  31.86 
 
 		 509 aa  205  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.205158  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1684  phytoene desaturase  32.12 
 
 		 506 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127101  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2093  phytoene desaturase  26.98 
 
 		 493 aa  199  7e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456364  decreased coverage  0.00855511 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04430  phytoene desaturase  35.14 
 
 		 548 aa  199  1.0000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0524  amine oxidase  30.33 
 
 		 556 aa  198  2.0000000000000003e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.599626 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13830  phytoene desaturase  33.15 
 
 		 552 aa  197  3e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000359632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0340  phytoene desaturase  31.69 
 
 		 542 aa  195  1e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0903063 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12770  phytoene desaturase  33.52 
 
 		 532 aa  195  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.500323 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2029  phytoene desaturase  32.48 
 
 		 496 aa  194  4e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5960  phytoene desaturase  30.14 
 
 		 490 aa  193  7e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21220  phytoene desaturase  34.3 
 
 		 566 aa  191  2.9999999999999997e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2586  zeta-phytoene desaturase  27.76 
 
 		 497 aa  189  7e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2640  zeta-phytoene desaturase  27.76 
 
 		 497 aa  189  7e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00915  CrtI1  27.52 
 
 		 488 aa  189  1e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0057  phytoene dehydrogenase-related protein  26.1 
 
 		 488 aa  183  6e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>