More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1810 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1810  phytoene dehydrogenase family protein  100 
 
 		 499 aa  1003    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.149228  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2268  phytoene desaturase  33.27 
 
 		 497 aa  324  2e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1046  phytoene dehydrogenase  35.16 
 
 		 494 aa  301  1e-80  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  31.39 
 
 		 502 aa  283  4.0000000000000003e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  31.39 
 
 		 502 aa  283  4.0000000000000003e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0845  amine oxidase  29.98 
 
 		 492 aa  266  4e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  27.02 
 
 		 505 aa  252  1e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  27.94 
 
 		 492 aa  240  4e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3577  zeta-phytoene desaturase  25.65 
 
 		 504 aa  239  9e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2211  phytoene desaturase  25.1 
 
 		 531 aa  231  3e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  0.130578 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  25.81 
 
 		 507 aa  231  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0493  phytoene desaturase  26.52 
 
 		 507 aa  223  6e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.145536  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1712  phytoene desaturase  26.76 
 
 		 504 aa  223  7e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678565  normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  28.1 
 
 		 511 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2128  phytoene desaturase  26.89 
 
 		 504 aa  219  7e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.423753  decreased coverage  0.0000406201 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1585  zeta-phytoene desaturase  24.9 
 
 		 492 aa  219  7.999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  27.89 
 
 		 511 aa  219  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  24.75 
 
 		 493 aa  218  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  25.3 
 
 		 498 aa  216  5e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  24.16 
 
 		 508 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  25.92 
 
 		 512 aa  215  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0943  phytoene dehydrogenase-related protein  25.74 
 
 		 495 aa  215  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.988075 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3200  phytoene desaturase  25.45 
 
 		 508 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  26.22 
 
 		 511 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5197  phytoene desaturase  25.15 
 
 		 525 aa  211  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  26.49 
 
 		 511 aa  207  5e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2704  phytoene desaturase  25.79 
 
 		 498 aa  206  7e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3134  amine oxidase  24.6 
 
 		 492 aa  206  9e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.954476  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02162  phytoene dehydrogenase  25.55 
 
 		 537 aa  203  5e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1619  phytoene dehydrogenase-related protein  25.45 
 
 		 508 aa  202  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5031  phytoene desaturase  24.21 
 
 		 509 aa  200  5e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3745  phytoene desaturase  22.52 
 
 		 512 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3436  phytoene desaturase  23.32 
 
 		 512 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240701 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1811  phytoene dehydrogenase-related protein  28.16 
 
 		 502 aa  198  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000642179  normal  0.0141145 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3011  phytoene desaturase  24.79 
 
 		 508 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.194152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0116  phytoene dehydrogenase-related protein  25.49 
 
 		 491 aa  197  5.000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3632  phytoene desaturase  23.32 
 
 		 512 aa  195  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.109765  normal  0.0371662 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2535  zeta-phytoene desaturase  27.27 
 
 		 491 aa  194  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00482984  unclonable  0.000000000435247 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0143  amine oxidase  25.66 
 
 		 519 aa  194  4e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1897  phytoene desaturase  25.72 
 
 		 499 aa  193  5e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.29228 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1816  amine oxidase  23.8 
 
 		 492 aa  193  6e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2373  phytoene desaturase  25.19 
 
 		 519 aa  192  1e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145608  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2045  phytoene desaturase  24.59 
 
 		 490 aa  192  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.716362  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2742  phytoene desaturase  26.06 
 
 		 553 aa  191  4e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3750  phytoene desaturase  26.35 
 
 		 530 aa  190  5e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3441  phytoene desaturase  26.35 
 
 		 530 aa  189  7e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.826621  normal  0.0554878 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1000  phytoene desaturase  25.28 
 
 		 549 aa  189  9e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3156  phytoene desaturase  23.28 
 
 		 509 aa  189  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.205158  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3236  phytoene desaturase  24.17 
 
 		 508 aa  188  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.689878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2586  zeta-phytoene desaturase  27.74 
 
 		 497 aa  186  8e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2640  zeta-phytoene desaturase  27.74 
 
 		 497 aa  186  8e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0271  phytoene dehydrogenase  25 
 
 		 518 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1914  phytoene dehydrogenase-related protein  25 
 
 		 518 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.603026 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2740  phytoene desaturase  25.82 
 
 		 518 aa  184  3e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5038  phytoene desaturase  25.79 
 
 		 529 aa  183  6e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.710499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0057  phytoene dehydrogenase-related protein  27.16 
 
 		 488 aa  182  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29222  predicted protein  25 
 
 		 521 aa  182  2e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.821914  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2710  phytoene desaturase  24.17 
 
 		 546 aa  180  4e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.487747 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1024  phytoene dehydrogenase-related protein  23.94 
 
 		 518 aa  179  9e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5620  phytoene desaturase  22.61 
 
 		 497 aa  176  6e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.476172 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3637  phytoene desaturase  25.68 
 
 		 530 aa  176  9e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.197726  normal  0.0326307 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3488  zeta-phytoene desaturase  23.23 
 
 		 552 aa  175  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0609  zeta-phytoene desaturase  25.22 
 
 		 495 aa  175  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.392694  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2029  phytoene desaturase  24.68 
 
 		 496 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13830  phytoene desaturase  21.93 
 
 		 552 aa  174  3.9999999999999995e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000359632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2983  phytoene desaturase  25.37 
 
 		 495 aa  173  6.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00166806  normal  0.0111696 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2155  phytoene dehydrogenase-related protein  23.23 
 
 		 553 aa  173  7.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.774687  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00915  CrtI1  26.53 
 
 		 488 aa  172  1e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2545  phytoene desaturase  23.47 
 
 		 536 aa  172  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139145  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3508  phytoene dehydrogenase  23.82 
 
 		 524 aa  171  3e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.691648  normal  0.885719 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1684  phytoene desaturase  23.69 
 
 		 506 aa  170  5e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127101  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1360  phytoene desaturase  23.06 
 
 		 500 aa  170  6e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.259348 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3760  FAD dependent oxidoreductase  24.75 
 
 		 524 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00569391 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3573  phytoene desaturase  22.61 
 
 		 509 aa  168  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1606  phytoene desaturase  25.7 
 
 		 511 aa  167  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000200105  unclonable  6.43078e-23 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1001  phytoene desaturase  23.27 
 
 		 527 aa  164  3e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.917372  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3075  putative phytoene desaturase  24.02 
 
 		 506 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.873802  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2030  phytoene desaturase  22.83 
 
 		 501 aa  163  6e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4005  FAD dependent oxidoreductase  24.02 
 
 		 516 aa  162  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.665607  hitchhiker  0.00234507 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0524  amine oxidase  23.66 
 
 		 556 aa  160  6e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.599626 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5960  phytoene desaturase  25.15 
 
 		 490 aa  159  9e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3228  Zeta-phytoene desaturase  24.16 
 
 		 519 aa  157  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285222  normal  0.0185992 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4929  zeta-phytoene desaturase  21.29 
 
 		 492 aa  157  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258823  normal  0.799895 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1387  amine oxidase  22.92 
 
 		 503 aa  157  4e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  hitchhiker  0.00651843 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04430  phytoene desaturase  21.18 
 
 		 548 aa  156  6e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2093  phytoene desaturase  24.45 
 
 		 493 aa  156  7e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456364  decreased coverage  0.00855511 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4439  phytoene dehydrogenase-related protein  21.09 
 
 		 492 aa  156  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.93912 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1289  FAD dependent oxidoreductase  23.41 
 
 		 516 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.571457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0318  phytoene desaturase  23.39 
 
 		 526 aa  151  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.158779  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3309  phytoene desaturase  23.6 
 
 		 494 aa  152  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0340  phytoene desaturase  21.86 
 
 		 542 aa  151  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0903063 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43904  phytoene desaturase. zeta-carotene desaturase. bacterial-like protein  24.09 
 
 		 696 aa  150  4e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.476322  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3827  phytoene desaturase  21.54 
 
 		 489 aa  150  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47122  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2502  phytoene desaturase  23.33 
 
 		 494 aa  150  7e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000691138  hitchhiker  0.00865975 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1706  phytoene desaturase  23.2 
 
 		 519 aa  146  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0796  phytoene desaturase  24.76 
 
 		 475 aa  144  4e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1073  phytoene dehydrogenase-related protein  26.57 
 
 		 460 aa  142  9.999999999999999e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5128  zeta-phytoene desaturase  21.2 
 
 		 506 aa  140  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.146602 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1399  phytoene desaturase  21.41 
 
 		 502 aa  137  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12770  phytoene desaturase  21.32 
 
 		 532 aa  135  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.500323 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>