195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1763 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1763  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 498 aa  1038    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0939  amine oxidase  33.47 
 
 		 496 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2065  FAD dependent oxidoreductase  31.7 
 
 		 484 aa  256  9e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6289  FAD dependent oxidoreductase  27.77 
 
 		 510 aa  247  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00968377  normal  0.473682 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3726  phytoene dehydrogenase and related proteins-like  29.89 
 
 		 586 aa  232  9e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2408  FAD dependent oxidoreductase  29 
 
 		 563 aa  206  6e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.410244  normal  0.0736984 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_715  FAD dependent oxidoreductase  26.65 
 
 		 500 aa  188  2e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0731  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  26.65 
 
 		 500 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.444322  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0811  phytoene dehydrogenase  25.1 
 
 		 523 aa  177  3e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0324739  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  22.63 
 
 		 503 aa  97.4  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  23.77 
 
 		 503 aa  96.7  8e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1053  all-trans-retinol 13,14-reductase  20.95 
 
 		 501 aa  92  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  22.61 
 
 		 503 aa  88.6  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  21.91 
 
 		 505 aa  85.1  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  23.02 
 
 		 522 aa  85.1  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1896  FAD dependent oxidoreductase  45.71 
 
 		 73 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0544  amine oxidase  24.63 
 
 		 525 aa  82.8  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00189501  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03825  hypothetical protein  20.98 
 
 		 508 aa  82.4  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1209  conserved hypothetical protein, FAD-binding domain protein  23.17 
 
 		 502 aa  81.6  0.00000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  22.6 
 
 		 507 aa  81.3  0.00000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  21.51 
 
 		 508 aa  80.9  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0845  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  22.03 
 
 		 740 aa  77  0.0000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03701  phytoene dehydrogenase  21.71 
 
 		 509 aa  76.6  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640229  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1077  all-trans-retinol 13,14-reductase  20.28 
 
 		 505 aa  76.6  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2672  amine oxidase  20.52 
 
 		 513 aa  75.9  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  21.36 
 
 		 506 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  21.5 
 
 		 547 aa  74.7  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39472  predicted protein  19.25 
 
 		 645 aa  72.8  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000845209  normal  0.555705 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  20.93 
 
 		 505 aa  72  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1898  hypothetical protein  20.43 
 
 		 511 aa  72  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.405447  normal  0.754346 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03711  phytoene dehydrogenase  21.5 
 
 		 509 aa  72  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  21.37 
 
 		 492 aa  71.6  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1874  All-trans-retinol 13,14-reductase  19.46 
 
 		 501 aa  70.5  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32217  predicted protein  22.54 
 
 		 504 aa  70.5  0.00000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.340213  normal  0.0518556 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  19.47 
 
 		 508 aa  70.5  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0543  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  23.13 
 
 		 526 aa  70.5  0.00000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000116233  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  19.96 
 
 		 512 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  20.73 
 
 		 559 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2665  putative phytoene dehydrogenase  20.4 
 
 		 495 aa  68.9  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  19.57 
 
 		 493 aa  69.3  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  19.96 
 
 		 512 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1069  FAD dependent oxidoreductase  20.16 
 
 		 496 aa  68.2  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.302171  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  20.48 
 
 		 516 aa  67  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0318  FAD dependent oxidoreductase  21.58 
 
 		 547 aa  66.6  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12111  hypothetical protein  22.09 
 
 		 509 aa  66.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  21.31 
 
 		 554 aa  65.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  20 
 
 		 515 aa  65.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5970  FAD dependent oxidoreductase  20.66 
 
 		 534 aa  65.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.633554  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0340  phytoene desaturase  21.48 
 
 		 542 aa  65.1  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0903063 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0143  amine oxidase  20.57 
 
 		 519 aa  64.7  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  20.24 
 
 		 511 aa  64.7  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  20.4 
 
 		 506 aa  64.3  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2032  FAD dependent oxidoreductase  20 
 
 		 520 aa  63.9  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.756687 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3134  amine oxidase  20.7 
 
 		 492 aa  63.9  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.954476  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0319  amine oxidase  22.42 
 
 		 489 aa  63.5  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.354274 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0970  phytoene dehydrogenase-like  23.98 
 
 		 523 aa  63.2  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.354104  normal  0.67541 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  19.96 
 
 		 554 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0761  hypothetical protein  19.85 
 
 		 510 aa  62.4  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1027  C-3',4' desaturase CrtD  22.25 
 
 		 504 aa  62.4  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  19.96 
 
 		 511 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  19.16 
 
 		 511 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0577  All-trans-retinol 13,14-reductase  21.83 
 
 		 542 aa  61.6  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1898  hypothetical protein  38.46 
 
 		 73 aa  61.6  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1000  phytoene desaturase  20.99 
 
 		 549 aa  62  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0345  phytoene dehydrogenase  20.61 
 
 		 509 aa  61.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09643  hypothetical protein  20.44 
 
 		 535 aa  61.2  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0783431  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1712  phytoene desaturase  21.97 
 
 		 504 aa  60.8  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678565  normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3374  C-3',4' desaturase CrtD  21.19 
 
 		 499 aa  60.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  22.92 
 
 		 556 aa  60.8  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3602  FAD dependent oxidoreductase  20.9 
 
 		 497 aa  60.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1995  All-trans-retinol 13,14-reductase  19.92 
 
 		 499 aa  60.1  0.00000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0871  amine oxidase  20.65 
 
 		 512 aa  60.1  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598168  normal  0.0715769 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12770  phytoene desaturase  22.41 
 
 		 532 aa  60.1  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.500323 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03741  phytoene dehydrogenase  20.15 
 
 		 509 aa  60.1  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  19.96 
 
 		 506 aa  60.1  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  20.53 
 
 		 532 aa  59.7  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2737  C-3',4' desaturase CrtD  21.19 
 
 		 499 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000928862  unclonable  0.00000000408673 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0057  phytoene dehydrogenase-related protein  21.38 
 
 		 488 aa  60.1  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  19.08 
 
 		 520 aa  59.3  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2043  amine oxidase  21.2 
 
 		 476 aa  58.9  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112057  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  19.84 
 
 		 511 aa  58.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1606  phytoene desaturase  24.66 
 
 		 511 aa  58.2  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000200105  unclonable  6.43078e-23 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2512  FAD dependent oxidoreductase  21.06 
 
 		 497 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224928  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1681  carotenoid isomerase  20.31 
 
 		 518 aa  57.4  0.0000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1585  zeta-phytoene desaturase  21.15 
 
 		 492 aa  57.4  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3286  FAD dependent oxidoreductase  21.1 
 
 		 488 aa  57.4  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.370539 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1723  carotene isomerase  21.36 
 
 		 516 aa  57.4  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0489  hypothetical protein  21.84 
 
 		 509 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3309  phytoene desaturase  20.16 
 
 		 494 aa  56.6  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2002  FAD dependent oxidoreductase  20.43 
 
 		 510 aa  56.6  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  20 
 
 		 502 aa  56.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  21.15 
 
 		 529 aa  56.2  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1935  FAD dependent oxidoreductase  22.95 
 
 		 521 aa  56.2  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790128  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1423  carotenoid isomerase  18.59 
 
 		 518 aa  55.5  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0637  putative dehydrogenase  21.77 
 
 		 548 aa  55.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0715988 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  18.36 
 
 		 520 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0436  All-trans-retinol 13,14-reductase  19.38 
 
 		 511 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.601478 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10011  putative carotenoid isomerase  18.64 
 
 		 520 aa  55.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0425  All-trans-retinol 13,14-reductase  19.79 
 
 		 511 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3011  All-trans-retinol 13,14-reductase  18.96 
 
 		 544 aa  54.7  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>