239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0939 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0939  amine oxidase  100 
 
 		 496 aa  1012    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1763  FAD dependent oxidoreductase  33.47 
 
 		 498 aa  298  1e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2065  FAD dependent oxidoreductase  32.59 
 
 		 484 aa  263  6.999999999999999e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0811  phytoene dehydrogenase  30.02 
 
 		 523 aa  226  8e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0324739  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6289  FAD dependent oxidoreductase  26.16 
 
 		 510 aa  223  8e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00968377  normal  0.473682 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0731  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  29.62 
 
 		 500 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.444322  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_715  FAD dependent oxidoreductase  29.48 
 
 		 500 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3726  phytoene dehydrogenase and related proteins-like  25.56 
 
 		 586 aa  206  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2408  FAD dependent oxidoreductase  25.25 
 
 		 563 aa  168  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.410244  normal  0.0736984 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  26.47 
 
 		 522 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  25.53 
 
 		 503 aa  101  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  26.75 
 
 		 503 aa  101  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  24.37 
 
 		 503 aa  100  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  25.27 
 
 		 508 aa  95.5  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1053  all-trans-retinol 13,14-reductase  22.68 
 
 		 501 aa  91.7  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03701  phytoene dehydrogenase  25.19 
 
 		 509 aa  91.7  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640229  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03711  phytoene dehydrogenase  25.28 
 
 		 509 aa  89.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  23.5 
 
 		 512 aa  87  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  23.5 
 
 		 512 aa  87  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03825  hypothetical protein  22.42 
 
 		 508 aa  86.3  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1712  phytoene desaturase  24.66 
 
 		 504 aa  85.5  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678565  normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  24.23 
 
 		 938 aa  85.1  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  24.25 
 
 		 505 aa  84  0.000000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  23.96 
 
 		 506 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  23.88 
 
 		 515 aa  82.8  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0544  amine oxidase  25.95 
 
 		 525 aa  82.8  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00189501  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  22.62 
 
 		 532 aa  80.9  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2512  FAD dependent oxidoreductase  22.54 
 
 		 497 aa  80.9  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224928  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0845  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  22.85 
 
 		 740 aa  80.5  0.00000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  21.37 
 
 		 507 aa  80.1  0.00000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  23.72 
 
 		 502 aa  80.1  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2672  amine oxidase  22.39 
 
 		 513 aa  79  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7528  putative phytoene dehydrogenase and related proteins  22.66 
 
 		 708 aa  78.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  21.29 
 
 		 492 aa  79  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  20.7 
 
 		 505 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0871  amine oxidase  26.51 
 
 		 512 aa  78.6  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598168  normal  0.0715769 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  20.54 
 
 		 493 aa  77.8  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3602  FAD dependent oxidoreductase  22.32 
 
 		 497 aa  77.8  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1046  phytoene dehydrogenase  23.03 
 
 		 494 aa  77.8  0.0000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0706  FAD dependent oxidoreductase  27.18 
 
 		 717 aa  77  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0405  amine oxidase  25.66 
 
 		 711 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0201487  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1896  FAD dependent oxidoreductase  44.29 
 
 		 73 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1000  phytoene desaturase  24.07 
 
 		 549 aa  75.9  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  21.53 
 
 		 547 aa  75.5  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1246  carotene isomerase  21.75 
 
 		 504 aa  74.7  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3577  zeta-phytoene desaturase  21.75 
 
 		 504 aa  74.7  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  21.12 
 
 		 506 aa  74.3  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1077  all-trans-retinol 13,14-reductase  22.37 
 
 		 505 aa  74.7  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09643  hypothetical protein  21.92 
 
 		 535 aa  74.3  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0783431  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  21.66 
 
 		 511 aa  73.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12061  putative carotenoid isomerase  24.48 
 
 		 514 aa  73.9  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.809432  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  20 
 
 		 508 aa  73.6  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0345  phytoene dehydrogenase  24.14 
 
 		 509 aa  72.8  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03741  phytoene dehydrogenase  24.08 
 
 		 509 aa  72.8  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  24.04 
 
 		 554 aa  72.4  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2268  phytoene desaturase  21.89 
 
 		 497 aa  72  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2211  phytoene desaturase  21.64 
 
 		 531 aa  72.4  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  0.130578 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  22.58 
 
 		 506 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  22.06 
 
 		 511 aa  72  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4578  FAD dependent oxidoreductase  24.68 
 
 		 512 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0637  putative dehydrogenase  23.03 
 
 		 548 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0715988 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0845  amine oxidase  24.78 
 
 		 492 aa  71.2  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1423  carotenoid isomerase  22.3 
 
 		 518 aa  70.9  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12211  putative carotenoid isomerase  23.77 
 
 		 514 aa  70.9  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  23.72 
 
 		 559 aa  70.9  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1126  putative carotenoid isomerase  24.49 
 
 		 514 aa  70.9  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.777729  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  23.38 
 
 		 510 aa  70.5  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  21.08 
 
 		 511 aa  70.5  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2128  phytoene desaturase  25.47 
 
 		 504 aa  70.5  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.423753  decreased coverage  0.0000406201 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3374  C-3',4' desaturase CrtD  22.93 
 
 		 499 aa  70.1  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1681  carotenoid isomerase  21.49 
 
 		 518 aa  69.7  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1841  FAD dependent oxidoreductase  21.48 
 
 		 512 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  21.62 
 
 		 498 aa  69.7  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4888  FAD dependent oxidoreductase  20.96 
 
 		 520 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.162383 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43564  predicted protein  22.41 
 
 		 554 aa  69.7  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.079373  normal  0.0235879 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2737  C-3',4' desaturase CrtD  22.03 
 
 		 499 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000928862  unclonable  0.00000000408673 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1209  conserved hypothetical protein, FAD-binding domain protein  23.87 
 
 		 502 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0543  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  24.07 
 
 		 526 aa  68.9  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000116233  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  21.49 
 
 		 516 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1874  All-trans-retinol 13,14-reductase  21.9 
 
 		 501 aa  68.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10011  putative carotenoid isomerase  20.87 
 
 		 520 aa  68.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  20.92 
 
 		 507 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  24.1 
 
 		 554 aa  68.6  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1711  FAD dependent oxidoreductase  20.85 
 
 		 501 aa  68.2  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1606  phytoene desaturase  23.62 
 
 		 511 aa  68.2  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000200105  unclonable  6.43078e-23 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39472  predicted protein  28.22 
 
 		 645 aa  68.6  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000845209  normal  0.555705 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  20.89 
 
 		 511 aa  67.4  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1027  C-3',4' desaturase CrtD  22.18 
 
 		 504 aa  67.8  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9210  CRTISO5 carotenoid isomerase 5,phytoene dehydrogenase-related protein  26.72 
 
 		 530 aa  67.4  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0319  amine oxidase  21.18 
 
 		 489 aa  67.4  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.354274 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2640  amine oxidase  23.34 
 
 		 495 aa  66.6  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0096  FAD dependent oxidoreductase  25.48 
 
 		 722 aa  66.6  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.490674 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4505  FAD dependent oxidoreductase  20.76 
 
 		 520 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4592  FAD dependent oxidoreductase  20.76 
 
 		 520 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.593862 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12221  putative carotenoid isomerase  24.61 
 
 		 514 aa  65.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1898  hypothetical protein  20.91 
 
 		 511 aa  65.1  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.405447  normal  0.754346 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1816  amine oxidase  21.45 
 
 		 492 aa  65.1  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  19.66 
 
 		 510 aa  64.7  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3200  phytoene desaturase  20.56 
 
 		 508 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5197  phytoene desaturase  21.14 
 
 		 525 aa  64.3  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128771 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>