More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1308 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  100 
 
 		 512 aa  1063    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  62.45 
 
 		 520 aa  697    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  82.5 
 
 		 506 aa  887    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  99.8 
 
 		 512 aa  1061    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  76.03 
 
 		 506 aa  820    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  70.55 
 
 		 508 aa  756    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1423  carotenoid isomerase  65.88 
 
 		 518 aa  724    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1681  carotenoid isomerase  65.69 
 
 		 518 aa  715    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1126  putative carotenoid isomerase  61.66 
 
 		 514 aa  669    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.777729  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1246  carotene isomerase  81.26 
 
 		 504 aa  841    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12221  putative carotenoid isomerase  61.9 
 
 		 514 aa  671    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  76.36 
 
 		 532 aa  812    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10011  putative carotenoid isomerase  65.42 
 
 		 520 aa  714    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12211  putative carotenoid isomerase  61.71 
 
 		 514 aa  670    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12061  putative carotenoid isomerase  61.68 
 
 		 514 aa  662    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.809432  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  63.14 
 
 		 520 aa  696    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  65.17 
 
 		 516 aa  712    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  46.29 
 
 		 507 aa  458  1e-127  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  45.96 
 
 		 508 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  44.69 
 
 		 503 aa  440  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  44.29 
 
 		 503 aa  437  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  44.89 
 
 		 503 aa  437  1e-121  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  44.89 
 
 		 505 aa  429  1e-119  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  43.48 
 
 		 522 aa  424  1e-117  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  38.03 
 
 		 502 aa  305  2.0000000000000002e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  36.59 
 
 		 506 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2672  amine oxidase  35.4 
 
 		 513 aa  282  1e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  35.9 
 
 		 515 aa  275  1.0000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2512  FAD dependent oxidoreductase  34.5 
 
 		 497 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224928  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3602  FAD dependent oxidoreductase  34.5 
 
 		 497 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  31.76 
 
 		 938 aa  269  7e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12111  hypothetical protein  34.06 
 
 		 509 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1841  FAD dependent oxidoreductase  35.09 
 
 		 512 aa  252  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0489  hypothetical protein  33.46 
 
 		 509 aa  251  2e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0871  amine oxidase  35.14 
 
 		 512 aa  251  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598168  normal  0.0715769 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4578  FAD dependent oxidoreductase  34.26 
 
 		 512 aa  246  8e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43564  predicted protein  33.4 
 
 		 554 aa  226  8e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.079373  normal  0.0235879 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1898  hypothetical protein  33.47 
 
 		 511 aa  220  3.9999999999999997e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.405447  normal  0.754346 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03711  phytoene dehydrogenase  31.1 
 
 		 509 aa  216  9e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32217  predicted protein  31.72 
 
 		 504 aa  215  9.999999999999999e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.340213  normal  0.0518556 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03741  phytoene dehydrogenase  30.92 
 
 		 509 aa  213  5.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03701  phytoene dehydrogenase  30.08 
 
 		 509 aa  213  7.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640229  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0345  phytoene dehydrogenase  30.12 
 
 		 509 aa  210  5e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1723  carotene isomerase  34.06 
 
 		 516 aa  205  2e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54842  carotenoid isomerase  30.76 
 
 		 595 aa  201  1.9999999999999998e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0761  hypothetical protein  32.6 
 
 		 510 aa  199  1.0000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39472  predicted protein  31.75 
 
 		 645 aa  192  1e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000845209  normal  0.555705 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9210  CRTISO5 carotenoid isomerase 5,phytoene dehydrogenase-related protein  32.43 
 
 		 530 aa  187  5e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45243  carotenoid isomerase  29.06 
 
 		 598 aa  186  7e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0755538  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_51868  carotenoid isomerase  30.97 
 
 		 633 aa  183  6e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1711  FAD dependent oxidoreductase  29.86 
 
 		 501 aa  181  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2342  amine oxidase  30.39 
 
 		 505 aa  168  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4273  C-3',4' desaturase CrtD  28.91 
 
 		 499 aa  163  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.938391 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1027  C-3',4' desaturase CrtD  27.66 
 
 		 504 aa  155  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3374  C-3',4' desaturase CrtD  29.71 
 
 		 499 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0845  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.26 
 
 		 740 aa  150  6e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3330  C-3',4' desaturase CrtD  28.03 
 
 		 510 aa  150  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2737  C-3',4' desaturase CrtD  29.65 
 
 		 499 aa  150  7e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000928862  unclonable  0.00000000408673 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4343  amine oxidase  27.77 
 
 		 517 aa  150  8e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0706  FAD dependent oxidoreductase  28.79 
 
 		 717 aa  149  9e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0096  FAD dependent oxidoreductase  27.62 
 
 		 722 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.490674 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0970  phytoene dehydrogenase-like  28.91 
 
 		 523 aa  148  2.0000000000000003e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.354104  normal  0.67541 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0319  amine oxidase  25.77 
 
 		 489 aa  143  9e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.354274 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0318  FAD dependent oxidoreductase  28.17 
 
 		 547 aa  141  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7528  putative phytoene dehydrogenase and related proteins  26.35 
 
 		 708 aa  140  7e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1069  FAD dependent oxidoreductase  25.11 
 
 		 496 aa  140  7e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.302171  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0346  amine oxidase  26.25 
 
 		 494 aa  138  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0405  amine oxidase  27.22 
 
 		 711 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0201487  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  27.17 
 
 		 507 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1053  all-trans-retinol 13,14-reductase  27.91 
 
 		 501 aa  136  9e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0305  amine oxidase  28.37 
 
 		 492 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3011  All-trans-retinol 13,14-reductase  28.12 
 
 		 544 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0577  All-trans-retinol 13,14-reductase  25.71 
 
 		 542 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  27.59 
 
 		 547 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  26.88 
 
 		 493 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  27.01 
 
 		 554 aa  130  8.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  27.41 
 
 		 508 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1024  phytoene dehydrogenase-related protein  26.4 
 
 		 518 aa  128  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  28.05 
 
 		 505 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_54826  carotenoid isomerase  27.59 
 
 		 635 aa  127  5e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0698106  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  26.63 
 
 		 564 aa  126  9e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2742  phytoene desaturase  28.32 
 
 		 553 aa  126  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2640  amine oxidase  26.84 
 
 		 495 aa  124  3e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3228  Zeta-phytoene desaturase  25.97 
 
 		 519 aa  123  7e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285222  normal  0.0185992 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1209  conserved hypothetical protein, FAD-binding domain protein  24.95 
 
 		 502 aa  123  8e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  26.65 
 
 		 492 aa  120  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  25.66 
 
 		 556 aa  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2710  phytoene desaturase  27.22 
 
 		 546 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.487747 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1161  FAD dependent oxidoreductase  26.35 
 
 		 500 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0155951  normal  0.294938 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3200  phytoene desaturase  27.04 
 
 		 508 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3281  FAD dependent oxidoreductase  26.4 
 
 		 479 aa  119  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.463065  normal  0.0612809 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1385  FAD dependent oxidoreductase  27.6 
 
 		 492 aa  119  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0115639 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0245  amine oxidase  26.02 
 
 		 491 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09643  hypothetical protein  24.76 
 
 		 535 aa  118  3e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0783431  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3488  zeta-phytoene desaturase  24.82 
 
 		 552 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1000  phytoene desaturase  26.19 
 
 		 549 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4888  FAD dependent oxidoreductase  24.77 
 
 		 520 aa  117  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.162383 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  25.7 
 
 		 511 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  26.21 
 
 		 510 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0271  phytoene dehydrogenase  26.19 
 
 		 518 aa  114  5e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>