More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1841 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013160  Cyan8802_4578  FAD dependent oxidoreductase  69.55 
 
 		 512 aa  736    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1841  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 512 aa  1057    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0871  amine oxidase  70.59 
 
 		 512 aa  743    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598168  normal  0.0715769 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  69.09 
 
 		 515 aa  761    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43564  predicted protein  52.65 
 
 		 554 aa  546  1e-154  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.079373  normal  0.0235879 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1898  hypothetical protein  47.06 
 
 		 511 aa  479  1e-134  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.405447  normal  0.754346 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54842  carotenoid isomerase  47.02 
 
 		 595 aa  478  1e-133  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0761  hypothetical protein  49.07 
 
 		 510 aa  475  1e-132  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12111  hypothetical protein  46.25 
 
 		 509 aa  474  1e-132  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0489  hypothetical protein  46.25 
 
 		 509 aa  471  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45243  carotenoid isomerase  45.61 
 
 		 598 aa  467  9.999999999999999e-131  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0755538  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1723  carotene isomerase  47.45 
 
 		 516 aa  464  1e-129  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03701  phytoene dehydrogenase  43.31 
 
 		 509 aa  456  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640229  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03711  phytoene dehydrogenase  43.11 
 
 		 509 aa  456  1e-127  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0345  phytoene dehydrogenase  42.91 
 
 		 509 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03741  phytoene dehydrogenase  43.47 
 
 		 509 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  47.46 
 
 		 502 aa  433  1e-120  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39472  predicted protein  44.98 
 
 		 645 aa  435  1e-120  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000845209  normal  0.555705 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3602  FAD dependent oxidoreductase  48.61 
 
 		 497 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2512  FAD dependent oxidoreductase  48.41 
 
 		 497 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224928  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  48.88 
 
 		 506 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2672  amine oxidase  46.89 
 
 		 513 aa  418  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9210  CRTISO5 carotenoid isomerase 5,phytoene dehydrogenase-related protein  40.3 
 
 		 530 aa  376  1e-103  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_51868  carotenoid isomerase  39.33 
 
 		 633 aa  367  1e-100  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32217  predicted protein  39.76 
 
 		 504 aa  317  4e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.340213  normal  0.0518556 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_54826  carotenoid isomerase  37.69 
 
 		 635 aa  312  7.999999999999999e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0698106  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  35.12 
 
 		 506 aa  272  8.000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  36.11 
 
 		 512 aa  272  9e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  35.91 
 
 		 512 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  34.64 
 
 		 532 aa  269  8e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  34.65 
 
 		 506 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  34.97 
 
 		 516 aa  263  8e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  34.54 
 
 		 508 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  33.72 
 
 		 507 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  33.07 
 
 		 508 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  33.33 
 
 		 522 aa  253  7e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  33.6 
 
 		 520 aa  251  3e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  33.2 
 
 		 503 aa  249  9e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10011  putative carotenoid isomerase  34.18 
 
 		 520 aa  249  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  33 
 
 		 520 aa  246  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  32.09 
 
 		 503 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1681  carotenoid isomerase  34.25 
 
 		 518 aa  238  2e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1246  carotene isomerase  33.07 
 
 		 504 aa  237  4e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12221  putative carotenoid isomerase  33.27 
 
 		 514 aa  236  8e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12211  putative carotenoid isomerase  33.81 
 
 		 514 aa  236  9e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1423  carotenoid isomerase  33.91 
 
 		 518 aa  232  1e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  31.3 
 
 		 503 aa  230  4e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12061  putative carotenoid isomerase  32.46 
 
 		 514 aa  230  6e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.809432  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1126  putative carotenoid isomerase  33.27 
 
 		 514 aa  229  8e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.777729  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  31.83 
 
 		 505 aa  228  1e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  26.76 
 
 		 938 aa  166  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1711  FAD dependent oxidoreductase  29.25 
 
 		 501 aa  143  9e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2342  amine oxidase  27.61 
 
 		 505 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4273  C-3',4' desaturase CrtD  26.7 
 
 		 499 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.938391 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  27.57 
 
 		 493 aa  130  7.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3330  C-3',4' desaturase CrtD  27.57 
 
 		 510 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3374  C-3',4' desaturase CrtD  27.55 
 
 		 499 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2737  C-3',4' desaturase CrtD  27.77 
 
 		 499 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000928862  unclonable  0.00000000408673 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0319  amine oxidase  26.61 
 
 		 489 aa  126  9e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.354274 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0970  phytoene dehydrogenase-like  28.57 
 
 		 523 aa  125  1e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.354104  normal  0.67541 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0706  FAD dependent oxidoreductase  28.33 
 
 		 717 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  26.28 
 
 		 547 aa  123  7e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0318  FAD dependent oxidoreductase  25.84 
 
 		 547 aa  120  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  25.6 
 
 		 554 aa  119  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1027  C-3',4' desaturase CrtD  27.04 
 
 		 504 aa  118  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  27.38 
 
 		 498 aa  118  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2065  FAD dependent oxidoreductase  26.28 
 
 		 484 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20111  phytoene dehydrogenase and related proteins  26.59 
 
 		 505 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.428487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  24.12 
 
 		 492 aa  114  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  25.15 
 
 		 507 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6289  FAD dependent oxidoreductase  27.45 
 
 		 510 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00968377  normal  0.473682 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3632  phytoene desaturase  24.44 
 
 		 512 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.109765  normal  0.0371662 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0405  amine oxidase  28.66 
 
 		 711 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0201487  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1137  UDP-galactopyranose mutase  27.7 
 
 		 505 aa  111  3e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7528  putative phytoene dehydrogenase and related proteins  28.37 
 
 		 708 aa  110  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3011  All-trans-retinol 13,14-reductase  26.63 
 
 		 544 aa  110  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  25.79 
 
 		 559 aa  110  8.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3745  phytoene desaturase  24.26 
 
 		 512 aa  109  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  23.88 
 
 		 511 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  25.61 
 
 		 554 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3436  phytoene desaturase  24.44 
 
 		 512 aa  108  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240701 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0096  FAD dependent oxidoreductase  27.05 
 
 		 722 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.490674 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5970  FAD dependent oxidoreductase  24.95 
 
 		 534 aa  108  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.633554  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3577  zeta-phytoene desaturase  24.71 
 
 		 504 aa  107  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4343  amine oxidase  26.07 
 
 		 517 aa  107  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5076  FAD dependent oxidoreductase  23.86 
 
 		 520 aa  107  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1677  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 		 519 aa  106  8e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  24.77 
 
 		 510 aa  106  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  25.19 
 
 		 547 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2211  phytoene desaturase  24.47 
 
 		 531 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  0.130578 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  24.95 
 
 		 563 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  26.91 
 
 		 510 aa  105  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5031  phytoene desaturase  24.95 
 
 		 509 aa  105  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1385  FAD dependent oxidoreductase  28.17 
 
 		 492 aa  104  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0115639 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  25 
 
 		 511 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  23.79 
 
 		 564 aa  102  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0493  phytoene desaturase  25.96 
 
 		 507 aa  102  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.145536  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  24.18 
 
 		 561 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1619  phytoene dehydrogenase-related protein  24.51 
 
 		 508 aa  102  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0845  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  25.66 
 
 		 740 aa  102  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>