More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0874 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  70.97 
 
 
522 aa  759    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  68.39 
 
 
503 aa  728    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  65 
 
 
507 aa  687    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  67.86 
 
 
505 aa  722    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  71.63 
 
 
508 aa  756    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  100 
 
 
503 aa  1035    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  68.59 
 
 
503 aa  738    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  44.89 
 
 
506 aa  444  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  44.69 
 
 
512 aa  440  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  44.69 
 
 
512 aa  440  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1423  carotenoid isomerase  44.12 
 
 
518 aa  432  1e-120  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1681  carotenoid isomerase  44.51 
 
 
518 aa  434  1e-120  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157771  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  43.86 
 
 
532 aa  432  1e-120  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  44.29 
 
 
506 aa  426  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1246  carotene isomerase  44.67 
 
 
504 aa  428  1e-118  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176287  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12061  putative carotenoid isomerase  43.03 
 
 
514 aa  425  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.809432  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1126  putative carotenoid isomerase  43.64 
 
 
514 aa  418  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.777729  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12221  putative carotenoid isomerase  42.63 
 
 
514 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12211  putative carotenoid isomerase  43.03 
 
 
514 aa  418  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  43.23 
 
 
508 aa  415  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  42.57 
 
 
520 aa  413  1e-114  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10011  putative carotenoid isomerase  43.37 
 
 
520 aa  414  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  42.57 
 
 
520 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  41.78 
 
 
516 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  34.39 
 
 
502 aa  273  6e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  34.86 
 
 
506 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2672  amine oxidase  32.86 
 
 
513 aa  244  3e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  31.82 
 
 
515 aa  244  3.9999999999999997e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3602  FAD dependent oxidoreductase  31.49 
 
 
497 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2512  FAD dependent oxidoreductase  33 
 
 
497 aa  240  5e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224928  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4578  FAD dependent oxidoreductase  31.46 
 
 
512 aa  223  8e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  30.81 
 
 
938 aa  221  3e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1841  FAD dependent oxidoreductase  30.18 
 
 
512 aa  210  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0871  amine oxidase  29.22 
 
 
512 aa  206  8e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598168  normal  0.0715769 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39472  predicted protein  30.08 
 
 
645 aa  206  1e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000845209  normal  0.555705 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32217  predicted protein  30.18 
 
 
504 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.340213  normal  0.0518556 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43564  predicted protein  29.11 
 
 
554 aa  196  6e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.079373  normal  0.0235879 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12111  hypothetical protein  30.84 
 
 
509 aa  195  1e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1898  hypothetical protein  30.66 
 
 
511 aa  192  1e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.405447  normal  0.754346 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0489  hypothetical protein  29.8 
 
 
509 aa  188  2e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03741  phytoene dehydrogenase  30.43 
 
 
509 aa  186  6e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0345  phytoene dehydrogenase  28.83 
 
 
509 aa  186  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03711  phytoene dehydrogenase  27.98 
 
 
509 aa  183  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1723  carotene isomerase  29.9 
 
 
516 aa  182  1e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03701  phytoene dehydrogenase  28.29 
 
 
509 aa  181  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640229  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9210  CRTISO5 carotenoid isomerase 5,phytoene dehydrogenase-related protein  31.68 
 
 
530 aa  180  5.999999999999999e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45243  carotenoid isomerase  28.74 
 
 
598 aa  177  4e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0755538  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54842  carotenoid isomerase  27.8 
 
 
595 aa  164  4.0000000000000004e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0761  hypothetical protein  29 
 
 
510 aa  160  4e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0706  FAD dependent oxidoreductase  31.15 
 
 
717 aa  154  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0346  amine oxidase  28.54 
 
 
494 aa  153  8.999999999999999e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2737  C-3',4' desaturase CrtD  28.65 
 
 
499 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000928862  unclonable  0.00000000408673 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3374  C-3',4' desaturase CrtD  28.46 
 
 
499 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1027  C-3',4' desaturase CrtD  29.88 
 
 
504 aa  150  6e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2342  amine oxidase  30.8 
 
 
505 aa  150  7e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1711  FAD dependent oxidoreductase  27.65 
 
 
501 aa  149  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4273  C-3',4' desaturase CrtD  29.4 
 
 
499 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.938391 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0245  amine oxidase  29.01 
 
 
491 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0319  amine oxidase  29.43 
 
 
489 aa  145  1e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.354274 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1000  phytoene desaturase  29.06 
 
 
549 aa  139  8.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0970  phytoene dehydrogenase-like  28.21 
 
 
523 aa  138  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.354104  normal  0.67541 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  27.88 
 
 
512 aa  138  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1161  FAD dependent oxidoreductase  27.49 
 
 
500 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0155951  normal  0.294938 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_51868  carotenoid isomerase  25.46 
 
 
633 aa  137  5e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0096  FAD dependent oxidoreductase  30.11 
 
 
722 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.490674 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2640  amine oxidase  28.24 
 
 
495 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0405  amine oxidase  29.49 
 
 
711 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0201487  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3330  C-3',4' desaturase CrtD  29.72 
 
 
510 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0305  amine oxidase  27.61 
 
 
492 aa  134  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1024  phytoene dehydrogenase-related protein  26.62 
 
 
518 aa  133  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  27.52 
 
 
511 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3011  All-trans-retinol 13,14-reductase  27.74 
 
 
544 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  29.46 
 
 
507 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2710  phytoene desaturase  27.55 
 
 
546 aa  130  4.0000000000000003e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.487747 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1053  all-trans-retinol 13,14-reductase  29.12 
 
 
501 aa  130  7.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2065  FAD dependent oxidoreductase  24.57 
 
 
484 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  25.82 
 
 
511 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7528  putative phytoene dehydrogenase and related proteins  29.83 
 
 
708 aa  127  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3577  zeta-phytoene desaturase  27.85 
 
 
504 aa  125  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557125  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3200  phytoene desaturase  28.46 
 
 
508 aa  124  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177165  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  25.68 
 
 
511 aa  123  9e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  25.44 
 
 
511 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0845  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.86 
 
 
740 aa  122  1.9999999999999998e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  27.84 
 
 
508 aa  120  7e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1385  FAD dependent oxidoreductase  27.1 
 
 
492 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0115639 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  24.02 
 
 
493 aa  118  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0271  phytoene dehydrogenase  27.48 
 
 
518 aa  117  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1914  phytoene dehydrogenase-related protein  27.48 
 
 
518 aa  117  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.603026 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3726  phytoene dehydrogenase and related proteins-like  26.23 
 
 
586 aa  115  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1069  FAD dependent oxidoreductase  25.6 
 
 
496 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.302171  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0318  FAD dependent oxidoreductase  28.84 
 
 
547 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_54826  carotenoid isomerase  26.88 
 
 
635 aa  114  4.0000000000000004e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0698106  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3632  phytoene desaturase  24.19 
 
 
512 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.109765  normal  0.0371662 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4343  amine oxidase  26 
 
 
517 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2211  phytoene desaturase  25.15 
 
 
531 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  0.130578 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  24.95 
 
 
492 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5031  phytoene desaturase  25.96 
 
 
509 aa  111  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  27.37 
 
 
514 aa  110  8.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3134  amine oxidase  23.68 
 
 
492 aa  109  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.954476  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3436  phytoene desaturase  24.43 
 
 
512 aa  109  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.240701 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>