More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0636 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  100 
 
 		 520 aa  1074    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12221  putative carotenoid isomerase  70.28 
 
 		 514 aa  743    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  59.8 
 
 		 506 aa  663    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  62.45 
 
 		 512 aa  697    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1423  carotenoid isomerase  67.77 
 
 		 518 aa  766    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1681  carotenoid isomerase  67.58 
 
 		 518 aa  754    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1126  putative carotenoid isomerase  70.22 
 
 		 514 aa  738    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.777729  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1246  carotene isomerase  63.58 
 
 		 504 aa  687    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  71.65 
 
 		 516 aa  792    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  58.88 
 
 		 508 aa  643    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  61.79 
 
 		 532 aa  669    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  62.45 
 
 		 512 aa  697    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  62.57 
 
 		 506 aa  699    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12211  putative carotenoid isomerase  69.88 
 
 		 514 aa  742    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12061  putative carotenoid isomerase  69.9 
 
 		 514 aa  739    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.809432  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  96.92 
 
 		 520 aa  1044    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10011  putative carotenoid isomerase  71.09 
 
 		 520 aa  798    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  42.13 
 
 		 507 aa  422  1e-117  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  42.57 
 
 		 503 aa  410  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  41.63 
 
 		 505 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  42.77 
 
 		 508 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  40.75 
 
 		 522 aa  404  1e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  41.19 
 
 		 503 aa  399  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  40.2 
 
 		 503 aa  396  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  34.66 
 
 		 502 aa  283  6.000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  34.21 
 
 		 506 aa  273  7e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2672  amine oxidase  32.1 
 
 		 513 aa  271  2.9999999999999997e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  32.95 
 
 		 515 aa  260  3e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2512  FAD dependent oxidoreductase  32.24 
 
 		 497 aa  253  6e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224928  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3602  FAD dependent oxidoreductase  32.24 
 
 		 497 aa  252  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  29.29 
 
 		 938 aa  246  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1841  FAD dependent oxidoreductase  32.11 
 
 		 512 aa  229  9e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4578  FAD dependent oxidoreductase  31.33 
 
 		 512 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32217  predicted protein  31.31 
 
 		 504 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.340213  normal  0.0518556 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12111  hypothetical protein  31.84 
 
 		 509 aa  215  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0489  hypothetical protein  31.43 
 
 		 509 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43564  predicted protein  30 
 
 		 554 aa  208  2e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.079373  normal  0.0235879 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03711  phytoene dehydrogenase  31.26 
 
 		 509 aa  203  6e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0871  amine oxidase  35.58 
 
 		 512 aa  201  3.9999999999999996e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598168  normal  0.0715769 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54842  carotenoid isomerase  29.87 
 
 		 595 aa  200  5e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03701  phytoene dehydrogenase  30.75 
 
 		 509 aa  200  7e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640229  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1898  hypothetical protein  30.46 
 
 		 511 aa  195  2e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.405447  normal  0.754346 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0345  phytoene dehydrogenase  30.64 
 
 		 509 aa  195  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03741  phytoene dehydrogenase  31.26 
 
 		 509 aa  190  7e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0761  hypothetical protein  31.21 
 
 		 510 aa  185  1.0000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45243  carotenoid isomerase  27.96 
 
 		 598 aa  185  2.0000000000000003e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0755538  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1723  carotene isomerase  31.34 
 
 		 516 aa  182  1e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39472  predicted protein  30.94 
 
 		 645 aa  180  4.999999999999999e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000845209  normal  0.555705 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4273  C-3',4' desaturase CrtD  29.86 
 
 		 499 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.938391 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_51868  carotenoid isomerase  29.82 
 
 		 633 aa  177  5e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1711  FAD dependent oxidoreductase  28.27 
 
 		 501 aa  169  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9210  CRTISO5 carotenoid isomerase 5,phytoene dehydrogenase-related protein  28.21 
 
 		 530 aa  159  9e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2342  amine oxidase  27.78 
 
 		 505 aa  159  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0970  phytoene dehydrogenase-like  27.68 
 
 		 523 aa  157  4e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.354104  normal  0.67541 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1027  C-3',4' desaturase CrtD  27.65 
 
 		 504 aa  157  6e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_54826  carotenoid isomerase  27.98 
 
 		 635 aa  147  4.0000000000000006e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0698106  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2737  C-3',4' desaturase CrtD  27.63 
 
 		 499 aa  146  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000928862  unclonable  0.00000000408673 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3374  C-3',4' desaturase CrtD  27.63 
 
 		 499 aa  146  9e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3330  C-3',4' desaturase CrtD  27.27 
 
 		 510 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0845  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  25.42 
 
 		 740 aa  145  2e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4343  amine oxidase  27.64 
 
 		 517 aa  142  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0405  amine oxidase  27.86 
 
 		 711 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0201487  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0706  FAD dependent oxidoreductase  27.74 
 
 		 717 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0096  FAD dependent oxidoreductase  27.64 
 
 		 722 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.490674 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0319  amine oxidase  26.15 
 
 		 489 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.354274 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7528  putative phytoene dehydrogenase and related proteins  25.87 
 
 		 708 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  26.22 
 
 		 511 aa  118  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0577  All-trans-retinol 13,14-reductase  27.05 
 
 		 542 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1161  FAD dependent oxidoreductase  24.22 
 
 		 500 aa  117  5e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0155951  normal  0.294938 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0933  phytoene dehydrogenase and related proteins-like  24.65 
 
 		 474 aa  116  8.999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1209  conserved hypothetical protein, FAD-binding domain protein  25.76 
 
 		 502 aa  116  1.0000000000000001e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0245  amine oxidase  26.98 
 
 		 491 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09643  hypothetical protein  25.59 
 
 		 535 aa  112  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0783431  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0318  FAD dependent oxidoreductase  25.47 
 
 		 547 aa  112  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  23.49 
 
 		 507 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1024  phytoene dehydrogenase-related protein  23.31 
 
 		 518 aa  111  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17531  phytoene dehydrogenase  23.48 
 
 		 501 aa  111  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0493  phytoene desaturase  25.85 
 
 		 507 aa  110  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.145536  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1000  phytoene desaturase  24.19 
 
 		 549 aa  110  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  26.6 
 
 		 547 aa  110  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1053  all-trans-retinol 13,14-reductase  26.04 
 
 		 501 aa  110  8.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2065  FAD dependent oxidoreductase  24.65 
 
 		 484 aa  109  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  23.6 
 
 		 508 aa  109  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6289  FAD dependent oxidoreductase  24.64 
 
 		 510 aa  109  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00968377  normal  0.473682 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2640  amine oxidase  25.31 
 
 		 495 aa  108  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  24.71 
 
 		 492 aa  107  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2816  FAD dependent oxidoreductase  21.38 
 
 		 530 aa  107  6e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3011  All-trans-retinol 13,14-reductase  26.51 
 
 		 544 aa  106  9e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1578  phytoene dehydrogenase-related protein  22.81 
 
 		 504 aa  106  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475016 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0346  amine oxidase  24.86 
 
 		 494 aa  105  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20111  phytoene dehydrogenase and related proteins  23.77 
 
 		 505 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.428487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  23.4 
 
 		 493 aa  104  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1137  UDP-galactopyranose mutase  24.17 
 
 		 505 aa  104  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  24.95 
 
 		 512 aa  104  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  24.25 
 
 		 511 aa  103  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2211  phytoene desaturase  23.15 
 
 		 531 aa  103  8e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  0.130578 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1069  FAD dependent oxidoreductase  21.49 
 
 		 496 aa  103  8e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.302171  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16851  phytoene dehydrogenase and related protein  24.11 
 
 		 503 aa  103  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3134  amine oxidase  21.54 
 
 		 492 aa  102  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.954476  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4146  All-trans-retinol 13,14-reductase  24.76 
 
 		 562 aa  103  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.559453  decreased coverage  0.00452261 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>