More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3650 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  72.07 
 
 
565 aa  842    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  68.89 
 
 
561 aa  792    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  72.12 
 
 
564 aa  840    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  71.51 
 
 
563 aa  828    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
547 aa  1127    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  64.63 
 
 
556 aa  754    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  41.13 
 
 
554 aa  400  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  39.34 
 
 
554 aa  364  2e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  38.6 
 
 
559 aa  355  8.999999999999999e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  37.91 
 
 
556 aa  337  5e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  35.09 
 
 
547 aa  322  8e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  34.25 
 
 
510 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  33.64 
 
 
510 aa  293  4e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  32.9 
 
 
514 aa  289  8e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  34.85 
 
 
555 aa  283  7.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  34.26 
 
 
510 aa  268  2e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1063  FAD dependent oxidoreductase  33.4 
 
 
545 aa  268  2e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164132  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  33.16 
 
 
533 aa  262  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  33.09 
 
 
518 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  34.59 
 
 
530 aa  252  1e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  33.22 
 
 
535 aa  245  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  33.8 
 
 
537 aa  245  1.9999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  31.74 
 
 
537 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  34.65 
 
 
536 aa  243  5e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  34.84 
 
 
532 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  34.84 
 
 
532 aa  242  2e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  31.96 
 
 
533 aa  240  5e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  32.86 
 
 
536 aa  239  8e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2744  FAD dependent oxidoreductase  33.75 
 
 
535 aa  239  1e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294261  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  32.37 
 
 
539 aa  239  1e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  31.72 
 
 
547 aa  237  5.0000000000000005e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  32.21 
 
 
552 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3290  amine oxidase  30.69 
 
 
545 aa  233  5e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  31.52 
 
 
527 aa  233  9e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3302  FAD dependent oxidoreductase  34.84 
 
 
532 aa  233  9e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  31.32 
 
 
549 aa  232  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  30.63 
 
 
530 aa  231  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  31.94 
 
 
516 aa  230  5e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.470789 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3530  oxidoreductase  33.93 
 
 
531 aa  229  1e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  31.74 
 
 
536 aa  229  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2659  beta-carotene ketolase  30.95 
 
 
526 aa  228  2e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2838  FAD dependent oxidoreductase  33.81 
 
 
531 aa  227  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  30.42 
 
 
527 aa  226  6e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3174  FAD dependent oxidoreductase  33.75 
 
 
531 aa  226  7e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.919135 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2541  putative phytoene dehydrogenase  31.75 
 
 
530 aa  226  9e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.553028 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3030  FAD dependent oxidoreductase  30.87 
 
 
551 aa  223  9e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.788741  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  28.96 
 
 
528 aa  216  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  30.18 
 
 
529 aa  212  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  29.44 
 
 
524 aa  209  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1978  FAD dependent oxidoreductase  31.02 
 
 
534 aa  208  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413393  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  29.64 
 
 
523 aa  201  3e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  30.38 
 
 
531 aa  198  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0637  putative dehydrogenase  30.97 
 
 
548 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0715988 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0947  FAD dependent oxidoreductase  28.97 
 
 
532 aa  191  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  28.49 
 
 
523 aa  190  5.999999999999999e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  26.99 
 
 
530 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  26.72 
 
 
530 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  26.72 
 
 
530 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2949  FAD dependent oxidoreductase  29.83 
 
 
517 aa  184  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0948  FAD dependent oxidoreductase  30.9 
 
 
536 aa  177  5e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  29.25 
 
 
531 aa  177  5e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  27.31 
 
 
528 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  28.17 
 
 
560 aa  173  7.999999999999999e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  28.18 
 
 
523 aa  168  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  27.06 
 
 
533 aa  167  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  26.77 
 
 
545 aa  167  5.9999999999999996e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  27.24 
 
 
534 aa  166  8e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  27.43 
 
 
534 aa  164  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  27.44 
 
 
531 aa  162  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  27.58 
 
 
524 aa  161  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  26.84 
 
 
526 aa  160  8e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  27.52 
 
 
522 aa  159  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  26.04 
 
 
528 aa  152  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0562  phytoene dehydrogenase  25.56 
 
 
476 aa  145  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1935  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 
521 aa  144  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790128  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  27.93 
 
 
506 aa  144  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0335  FAD dependent oxidoreductase  26.06 
 
 
476 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000674369  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2736  FAD dependent oxidoreductase  26.15 
 
 
484 aa  142  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118695  hitchhiker  0.0000199916 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  25.37 
 
 
474 aa  140  7e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  25.56 
 
 
474 aa  140  7e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13863  dehydrogenase  27.08 
 
 
536 aa  139  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  26.77 
 
 
535 aa  139  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5076  FAD dependent oxidoreductase  25.4 
 
 
520 aa  137  5e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1677  FAD dependent oxidoreductase  26.02 
 
 
519 aa  137  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4888  FAD dependent oxidoreductase  26.75 
 
 
520 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.162383 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3180  FAD dependent oxidoreductase  24.44 
 
 
478 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4153  putative dehydrogenase  24.16 
 
 
479 aa  133  7.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4505  FAD dependent oxidoreductase  26.75 
 
 
520 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1761  amine oxidase  26.92 
 
 
530 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0378062  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4592  FAD dependent oxidoreductase  26.75 
 
 
520 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.593862 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  27.59 
 
 
512 aa  131  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1663  phytoene dehydrogenase, putative  24.67 
 
 
465 aa  130  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.638198  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  27.59 
 
 
512 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  26.01 
 
 
511 aa  130  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4056  FAD dependent oxidoreductase  25.99 
 
 
580 aa  127  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2084  FAD dependent oxidoreductase  25.14 
 
 
477 aa  127  6e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.424143 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  26.2 
 
 
492 aa  127  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  25.79 
 
 
511 aa  127  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1278  FAD dependent oxidoreductase  27.81 
 
 
523 aa  125  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3794  FAD dependent oxidoreductase  27.64 
 
 
484 aa  125  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>