254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_51868 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_51868  carotenoid isomerase  100 
 
 		 633 aa  1309    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  40.98 
 
 		 515 aa  395  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1841  FAD dependent oxidoreductase  39.33 
 
 		 512 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0871  amine oxidase  42.38 
 
 		 512 aa  367  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598168  normal  0.0715769 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4578  FAD dependent oxidoreductase  38.99 
 
 		 512 aa  350  4e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43564  predicted protein  39.93 
 
 		 554 aa  341  2e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.079373  normal  0.0235879 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45243  carotenoid isomerase  37.13 
 
 		 598 aa  323  6e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0755538  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54842  carotenoid isomerase  36.59 
 
 		 595 aa  322  1.9999999999999998e-86  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39472  predicted protein  37.39 
 
 		 645 aa  306  1.0000000000000001e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000845209  normal  0.555705 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1723  carotene isomerase  37.43 
 
 		 516 aa  300  5e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12111  hypothetical protein  36.79 
 
 		 509 aa  300  5e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  37.25 
 
 		 502 aa  300  7e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_54826  carotenoid isomerase  36.89 
 
 		 635 aa  298  2e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0698106  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0489  hypothetical protein  36.79 
 
 		 509 aa  298  3e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03711  phytoene dehydrogenase  33.52 
 
 		 509 aa  287  4e-76  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03741  phytoene dehydrogenase  34.73 
 
 		 509 aa  287  4e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2672  amine oxidase  38.38 
 
 		 513 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0761  hypothetical protein  36.94 
 
 		 510 aa  285  2.0000000000000002e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1898  hypothetical protein  36.12 
 
 		 511 aa  283  6.000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.405447  normal  0.754346 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0345  phytoene dehydrogenase  33.15 
 
 		 509 aa  282  1e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3602  FAD dependent oxidoreductase  37.82 
 
 		 497 aa  282  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03701  phytoene dehydrogenase  32.97 
 
 		 509 aa  282  1e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640229  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2512  FAD dependent oxidoreductase  38.75 
 
 		 497 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224928  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  37.27 
 
 		 506 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9210  CRTISO5 carotenoid isomerase 5,phytoene dehydrogenase-related protein  33.56 
 
 		 530 aa  247  6e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32217  predicted protein  32.66 
 
 		 504 aa  225  2e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.340213  normal  0.0518556 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10011  putative carotenoid isomerase  31.13 
 
 		 520 aa  203  7e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  31.81 
 
 		 512 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  31.63 
 
 		 512 aa  200  7e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  29.57 
 
 		 506 aa  193  8e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  30.32 
 
 		 520 aa  193  9e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  30.3 
 
 		 520 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  31.28 
 
 		 506 aa  190  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  30.73 
 
 		 508 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  28.27 
 
 		 516 aa  187  6e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  29.05 
 
 		 508 aa  183  8.000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  29.23 
 
 		 532 aa  179  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  27.74 
 
 		 503 aa  176  9e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  28.81 
 
 		 505 aa  176  9.999999999999999e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12211  putative carotenoid isomerase  27.53 
 
 		 514 aa  176  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12221  putative carotenoid isomerase  27.71 
 
 		 514 aa  175  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1423  carotenoid isomerase  27.94 
 
 		 518 aa  174  3.9999999999999995e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1246  carotene isomerase  29.28 
 
 		 504 aa  173  9e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  28.39 
 
 		 503 aa  171  3e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  27.66 
 
 		 522 aa  171  3e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1681  carotenoid isomerase  28.01 
 
 		 518 aa  170  7e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  28.62 
 
 		 507 aa  167  5.9999999999999996e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1126  putative carotenoid isomerase  27 
 
 		 514 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.777729  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  25.86 
 
 		 503 aa  155  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12061  putative carotenoid isomerase  26.27 
 
 		 514 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.809432  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  25.67 
 
 		 938 aa  122  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0319  amine oxidase  27.05 
 
 		 489 aa  120  7e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.354274 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2211  phytoene desaturase  26.61 
 
 		 531 aa  107  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  0.130578 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1711  FAD dependent oxidoreductase  26.41 
 
 		 501 aa  102  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4273  C-3',4' desaturase CrtD  26.02 
 
 		 499 aa  98.6  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.938391 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0405  amine oxidase  25.39 
 
 		 711 aa  94  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0201487  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0970  phytoene dehydrogenase-like  25.57 
 
 		 523 aa  88.2  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.354104  normal  0.67541 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  24.24 
 
 		 511 aa  87.8  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3577  zeta-phytoene desaturase  25.23 
 
 		 504 aa  86.7  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3330  C-3',4' desaturase CrtD  23.76 
 
 		 510 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  24.57 
 
 		 547 aa  85.9  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0706  FAD dependent oxidoreductase  25.18 
 
 		 717 aa  85.5  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5970  FAD dependent oxidoreductase  24.66 
 
 		 534 aa  85.5  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.633554  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  24.06 
 
 		 511 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4888  FAD dependent oxidoreductase  26.4 
 
 		 520 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.162383 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3374  C-3',4' desaturase CrtD  24.72 
 
 		 499 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4505  FAD dependent oxidoreductase  26.68 
 
 		 520 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4592  FAD dependent oxidoreductase  26.68 
 
 		 520 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.593862 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1027  C-3',4' desaturase CrtD  23.75 
 
 		 504 aa  82  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0096  FAD dependent oxidoreductase  26.63 
 
 		 722 aa  82  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.490674 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  23.31 
 
 		 492 aa  82  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  23.87 
 
 		 511 aa  81.3  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2737  C-3',4' desaturase CrtD  24.54 
 
 		 499 aa  81.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000928862  unclonable  0.00000000408673 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  25 
 
 		 511 aa  80.9  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5076  FAD dependent oxidoreductase  24.81 
 
 		 520 aa  80.9  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13830  phytoene desaturase  25 
 
 		 552 aa  80.1  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000359632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17531  phytoene dehydrogenase  22.98 
 
 		 501 aa  80.1  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  24.65 
 
 		 547 aa  79  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  24.59 
 
 		 512 aa  78.2  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0346  amine oxidase  25.65 
 
 		 494 aa  76.6  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  25.21 
 
 		 563 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  25.23 
 
 		 498 aa  75.9  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  25.27 
 
 		 507 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  24.83 
 
 		 564 aa  75.1  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  24.69 
 
 		 508 aa  74.7  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1677  FAD dependent oxidoreductase  25.14 
 
 		 519 aa  74.3  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  25.44 
 
 		 547 aa  74.3  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1137  UDP-galactopyranose mutase  23.66 
 
 		 505 aa  73.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13863  dehydrogenase  24.15 
 
 		 536 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7528  putative phytoene dehydrogenase and related proteins  25 
 
 		 708 aa  72.4  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1585  zeta-phytoene desaturase  22.54 
 
 		 492 aa  71.6  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20111  phytoene dehydrogenase and related proteins  23.32 
 
 		 505 aa  71.6  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.428487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1816  amine oxidase  23.72 
 
 		 492 aa  71.2  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1053  all-trans-retinol 13,14-reductase  25.81 
 
 		 501 aa  71.2  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  23.53 
 
 		 537 aa  70.9  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  24.53 
 
 		 533 aa  70.9  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4005  FAD dependent oxidoreductase  23.93 
 
 		 516 aa  70.1  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.665607  hitchhiker  0.00234507 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1024  phytoene dehydrogenase-related protein  22.58 
 
 		 518 aa  70.1  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  25.47 
 
 		 523 aa  70.5  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  22.4 
 
 		 493 aa  69.7  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>