More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1723 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1723  carotene isomerase  100 
 
 		 516 aa  1040    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1898  hypothetical protein  61.1 
 
 		 511 aa  593  1e-168  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.405447  normal  0.754346 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0761  hypothetical protein  58.12 
 
 		 510 aa  565  1e-160  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12111  hypothetical protein  52.07 
 
 		 509 aa  563  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0489  hypothetical protein  52.27 
 
 		 509 aa  560  1e-158  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03711  phytoene dehydrogenase  45.1 
 
 		 509 aa  521  1e-147  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03701  phytoene dehydrogenase  45.29 
 
 		 509 aa  519  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640229  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0345  phytoene dehydrogenase  45.69 
 
 		 509 aa  521  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  49.51 
 
 		 515 aa  502  1e-141  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03741  phytoene dehydrogenase  48.51 
 
 		 509 aa  503  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0871  amine oxidase  49.5 
 
 		 512 aa  483  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598168  normal  0.0715769 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1841  FAD dependent oxidoreductase  46.99 
 
 		 512 aa  480  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4578  FAD dependent oxidoreductase  46.67 
 
 		 512 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43564  predicted protein  44.02 
 
 		 554 aa  420  1e-116  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.079373  normal  0.0235879 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54842  carotenoid isomerase  41.22 
 
 		 595 aa  378  1e-103  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  42.27 
 
 		 502 aa  372  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2672  amine oxidase  43.06 
 
 		 513 aa  366  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45243  carotenoid isomerase  39.89 
 
 		 598 aa  362  1e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0755538  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  42.26 
 
 		 506 aa  358  9e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39472  predicted protein  38.08 
 
 		 645 aa  344  2e-93  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000845209  normal  0.555705 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2512  FAD dependent oxidoreductase  40.4 
 
 		 497 aa  342  7e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224928  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3602  FAD dependent oxidoreductase  40.2 
 
 		 497 aa  341  2e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9210  CRTISO5 carotenoid isomerase 5,phytoene dehydrogenase-related protein  37.13 
 
 		 530 aa  326  8.000000000000001e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_51868  carotenoid isomerase  36.99 
 
 		 633 aa  317  3e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32217  predicted protein  35.39 
 
 		 504 aa  270  5e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.340213  normal  0.0518556 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_54826  carotenoid isomerase  35.52 
 
 		 635 aa  248  1e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0698106  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1681  carotenoid isomerase  34.56 
 
 		 518 aa  243  5e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1423  carotenoid isomerase  33.66 
 
 		 518 aa  241  2e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10011  putative carotenoid isomerase  33.33 
 
 		 520 aa  242  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  33.79 
 
 		 512 aa  236  9e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  33.59 
 
 		 512 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  32.55 
 
 		 506 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  31.96 
 
 		 516 aa  228  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  34.34 
 
 		 508 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 506 aa  222  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  30.97 
 
 		 532 aa  220  3.9999999999999997e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  31.56 
 
 		 520 aa  220  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1246  carotene isomerase  33.14 
 
 		 504 aa  218  2e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  31.36 
 
 		 520 aa  215  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  31.07 
 
 		 522 aa  213  7.999999999999999e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12061  putative carotenoid isomerase  31.6 
 
 		 514 aa  210  4e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.809432  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  31.85 
 
 		 508 aa  210  5e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  30.89 
 
 		 505 aa  208  2e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  30.65 
 
 		 503 aa  207  4e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12211  putative carotenoid isomerase  29.37 
 
 		 514 aa  202  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12221  putative carotenoid isomerase  29.64 
 
 		 514 aa  201  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1126  putative carotenoid isomerase  29.12 
 
 		 514 aa  199  7.999999999999999e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.777729  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  32.28 
 
 		 507 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  30.08 
 
 		 503 aa  196  9e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  29.42 
 
 		 503 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  28.29 
 
 		 493 aa  144  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  26.08 
 
 		 938 aa  127  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  24.61 
 
 		 492 aa  119  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  26.08 
 
 		 511 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  26.11 
 
 		 511 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4273  C-3',4' desaturase CrtD  28.29 
 
 		 499 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.938391 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  25.25 
 
 		 511 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0706  FAD dependent oxidoreductase  27.68 
 
 		 717 aa  110  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1024  phytoene dehydrogenase-related protein  27.1 
 
 		 518 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1585  zeta-phytoene desaturase  26.28 
 
 		 492 aa  109  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2710  phytoene desaturase  26.86 
 
 		 546 aa  108  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.487747 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2032  FAD dependent oxidoreductase  26.27 
 
 		 520 aa  106  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.756687 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3577  zeta-phytoene desaturase  27.41 
 
 		 504 aa  106  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7528  putative phytoene dehydrogenase and related proteins  29.5 
 
 		 708 aa  103  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0405  amine oxidase  27.08 
 
 		 711 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0201487  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  24.6 
 
 		 512 aa  102  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3011  All-trans-retinol 13,14-reductase  27.45 
 
 		 544 aa  101  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  23.54 
 
 		 511 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1684  phytoene desaturase  27 
 
 		 506 aa  100  5e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127101  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  25.69 
 
 		 508 aa  100  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1174  All-trans-retinol 13,14-reductase  26.37 
 
 		 522 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  25.47 
 
 		 498 aa  100  6e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0319  amine oxidase  25.89 
 
 		 489 aa  99.8  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.354274 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0970  phytoene dehydrogenase-like  28.63 
 
 		 523 aa  98.6  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.354104  normal  0.67541 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2211  phytoene desaturase  23.33 
 
 		 531 aa  98.6  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  0.130578 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0143  amine oxidase  24.56 
 
 		 519 aa  98.6  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0943  phytoene dehydrogenase-related protein  24.55 
 
 		 495 aa  97.8  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.988075 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1000  phytoene desaturase  24.91 
 
 		 549 aa  97.4  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3488  zeta-phytoene desaturase  25.62 
 
 		 552 aa  97.4  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0845  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  25.94 
 
 		 740 aa  97.1  7e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1046  phytoene dehydrogenase  23.09 
 
 		 494 aa  97.1  8e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3632  phytoene desaturase  27.27 
 
 		 512 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.109765  normal  0.0371662 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3134  amine oxidase  23.99 
 
 		 492 aa  95.9  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.954476  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2155  phytoene dehydrogenase-related protein  26.21 
 
 		 553 aa  95.1  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.774687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0493  phytoene desaturase  25.59 
 
 		 507 aa  94.4  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.145536  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  27.36 
 
 		 505 aa  94  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3200  phytoene desaturase  25.84 
 
 		 508 aa  94  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0346  amine oxidase  26.41 
 
 		 494 aa  94  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1027  C-3',4' desaturase CrtD  25.88 
 
 		 504 aa  92.8  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2065  FAD dependent oxidoreductase  23.87 
 
 		 484 aa  91.3  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3573  phytoene desaturase  25.85 
 
 		 509 aa  91.3  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1619  phytoene dehydrogenase-related protein  24.18 
 
 		 508 aa  91.3  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2502  phytoene desaturase  28.2 
 
 		 494 aa  90.9  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000691138  hitchhiker  0.00865975 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1816  amine oxidase  23.4 
 
 		 492 aa  90.1  9e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0096  FAD dependent oxidoreductase  27.53 
 
 		 722 aa  89.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.490674 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_54800  carotenoid isomerase-like protein  24.69 
 
 		 923 aa  89.4  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0759229  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09643  hypothetical protein  23.05 
 
 		 535 aa  89  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0783431  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1810  phytoene dehydrogenase family protein  21.91 
 
 		 499 aa  88.2  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.149228  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  26.28 
 
 		 507 aa  88.2  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1914  phytoene dehydrogenase-related protein  26.25 
 
 		 518 aa  88.2  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.603026 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>