More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0970 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014248  Aazo_1027  C-3',4' desaturase CrtD  62.75 
 
 		 504 aa  651    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2342  amine oxidase  64.59 
 
 		 505 aa  667    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4273  C-3',4' desaturase CrtD  63.71 
 
 		 499 aa  640    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.938391 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0970  phytoene dehydrogenase-like  100 
 
 		 523 aa  1060    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.354104  normal  0.67541 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2737  C-3',4' desaturase CrtD  66.06 
 
 		 499 aa  654    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000928862  unclonable  0.00000000408673 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3330  C-3',4' desaturase CrtD  65.03 
 
 		 510 aa  653    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3374  C-3',4' desaturase CrtD  65.66 
 
 		 499 aa  649    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4343  amine oxidase  61.12 
 
 		 517 aa  628  1e-179  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1137  UDP-galactopyranose mutase  47 
 
 		 505 aa  439  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20111  phytoene dehydrogenase and related proteins  46.2 
 
 		 505 aa  435  1e-121  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.428487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22931  phytoene dehydrogenase  47.97 
 
 		 503 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1944  phytoene dehydrogenase related enzyme  48.82 
 
 		 495 aa  418  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16851  phytoene dehydrogenase and related protein  45.33 
 
 		 503 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0386  phytoene dehydrogenase related enzyme  48.8 
 
 		 500 aa  407  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17531  phytoene dehydrogenase  43.17 
 
 		 501 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1658  UDP-galactopyranose mutase  41.85 
 
 		 501 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17731  phytoene dehydrogenase  42.86 
 
 		 501 aa  375  1e-102  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17571  phytoene dehydrogenase and related protein  41.45 
 
 		 501 aa  371  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.274386  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1711  FAD dependent oxidoreductase  40.47 
 
 		 501 aa  281  3e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0319  amine oxidase  37.63 
 
 		 489 aa  219  1e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.354274 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0346  amine oxidase  35.59 
 
 		 494 aa  216  7e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0245  amine oxidase  33.6 
 
 		 491 aa  190  5.999999999999999e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2640  amine oxidase  32.33 
 
 		 495 aa  184  3e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3446  phytoene dehydrogenase  25.41 
 
 		 489 aa  170  6e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.503543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  28.07 
 
 		 516 aa  167  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1681  carotenoid isomerase  30.04 
 
 		 518 aa  165  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  30.22 
 
 		 938 aa  166  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  27.68 
 
 		 520 aa  164  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  27.06 
 
 		 520 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1423  carotenoid isomerase  30.11 
 
 		 518 aa  161  3e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  29.89 
 
 		 503 aa  160  4e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1161  FAD dependent oxidoreductase  30.87 
 
 		 500 aa  159  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0155951  normal  0.294938 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  28.54 
 
 		 503 aa  158  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0305  amine oxidase  32.52 
 
 		 492 aa  157  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  28.91 
 
 		 512 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0933  phytoene dehydrogenase and related proteins-like  25.05 
 
 		 474 aa  155  2e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  30.38 
 
 		 508 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  28.91 
 
 		 512 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  29.26 
 
 		 522 aa  154  4e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  31.09 
 
 		 507 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  28.29 
 
 		 506 aa  153  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  29.88 
 
 		 506 aa  152  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10011  putative carotenoid isomerase  28.26 
 
 		 520 aa  152  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  26.44 
 
 		 532 aa  146  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  28.21 
 
 		 503 aa  145  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  28.1 
 
 		 508 aa  141  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1385  FAD dependent oxidoreductase  32.36 
 
 		 492 aa  140  6e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0115639 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12061  putative carotenoid isomerase  25.35 
 
 		 514 aa  140  7e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.809432  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  28.35 
 
 		 505 aa  139  1e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12211  putative carotenoid isomerase  24.56 
 
 		 514 aa  136  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1126  putative carotenoid isomerase  24.61 
 
 		 514 aa  132  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.777729  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1246  carotene isomerase  28.68 
 
 		 504 aa  132  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12221  putative carotenoid isomerase  24.17 
 
 		 514 aa  132  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  27.66 
 
 		 502 aa  123  6e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2672  amine oxidase  28.8 
 
 		 513 aa  121  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3602  FAD dependent oxidoreductase  27.72 
 
 		 497 aa  121  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  28.39 
 
 		 515 aa  120  6e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2816  FAD dependent oxidoreductase  26.46 
 
 		 530 aa  120  7e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1841  FAD dependent oxidoreductase  28.14 
 
 		 512 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2512  FAD dependent oxidoreductase  27.33 
 
 		 497 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224928  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0845  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  25.73 
 
 		 740 aa  110  5e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2065  FAD dependent oxidoreductase  27.14 
 
 		 484 aa  106  8e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0345  phytoene dehydrogenase  25.53 
 
 		 509 aa  106  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0577  All-trans-retinol 13,14-reductase  24.54 
 
 		 542 aa  105  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4578  FAD dependent oxidoreductase  28.08 
 
 		 512 aa  103  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39472  predicted protein  27.26 
 
 		 645 aa  103  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000845209  normal  0.555705 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  26.13 
 
 		 506 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1053  all-trans-retinol 13,14-reductase  28.33 
 
 		 501 aa  101  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43564  predicted protein  24.95 
 
 		 554 aa  100  6e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.079373  normal  0.0235879 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0871  amine oxidase  26.92 
 
 		 512 aa  100  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598168  normal  0.0715769 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54842  carotenoid isomerase  26.67 
 
 		 595 aa  99.8  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0143  amine oxidase  25.18 
 
 		 519 aa  99  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1209  conserved hypothetical protein, FAD-binding domain protein  23.95 
 
 		 502 aa  97.1  6e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03711  phytoene dehydrogenase  24.71 
 
 		 509 aa  97.1  8e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3745  phytoene desaturase  25.64 
 
 		 512 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  28.25 
 
 		 508 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3632  phytoene desaturase  25.1 
 
 		 512 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.109765  normal  0.0371662 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5031  phytoene desaturase  25.49 
 
 		 509 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03701  phytoene dehydrogenase  24.28 
 
 		 509 aa  94.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640229  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3011  All-trans-retinol 13,14-reductase  25.97 
 
 		 544 aa  94.7  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3436  phytoene desaturase  25.64 
 
 		 512 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240701 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1024  phytoene dehydrogenase-related protein  25.87 
 
 		 518 aa  92.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0761  hypothetical protein  28.39 
 
 		 510 aa  90.9  6e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9210  CRTISO5 carotenoid isomerase 5,phytoene dehydrogenase-related protein  24.81 
 
 		 530 aa  89  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4146  All-trans-retinol 13,14-reductase  27.73 
 
 		 562 aa  89.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.559453  decreased coverage  0.00452261 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1723  carotene isomerase  28.43 
 
 		 516 aa  88.2  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1684  phytoene desaturase  25.38 
 
 		 506 aa  88.2  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127101  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2640  zeta-phytoene desaturase  24.01 
 
 		 497 aa  87  8e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2586  zeta-phytoene desaturase  24.01 
 
 		 497 aa  87  8e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0116  phytoene dehydrogenase-related protein  26.12 
 
 		 491 aa  86.3  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  25.19 
 
 		 512 aa  85.5  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0493  phytoene desaturase  24.81 
 
 		 507 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.145536  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0489  hypothetical protein  25.87 
 
 		 509 aa  84.3  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0271  phytoene dehydrogenase  25.97 
 
 		 518 aa  84.3  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1914  phytoene dehydrogenase-related protein  25.97 
 
 		 518 aa  84.3  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.603026 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12111  hypothetical protein  25.73 
 
 		 509 aa  84.3  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2211  phytoene desaturase  25.33 
 
 		 531 aa  84  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  0.130578 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  25.29 
 
 		 492 aa  83.6  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  27.01 
 
 		 507 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1046  phytoene dehydrogenase  21.4 
 
 		 494 aa  82.8  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>