More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2342 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014248  Aazo_1027  C-3',4' desaturase CrtD  83.43 
 
 		 504 aa  862    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2737  C-3',4' desaturase CrtD  71.92 
 
 		 499 aa  714    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000928862  unclonable  0.00000000408673 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2342  amine oxidase  100 
 
 		 505 aa  1041    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0970  phytoene dehydrogenase-like  64.59 
 
 		 523 aa  655    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.354104  normal  0.67541 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3374  C-3',4' desaturase CrtD  72.12 
 
 		 499 aa  714    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4273  C-3',4' desaturase CrtD  73.99 
 
 		 499 aa  744    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.938391 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3330  C-3',4' desaturase CrtD  72.37 
 
 		 510 aa  734    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4343  amine oxidase  74.61 
 
 		 517 aa  777    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1137  UDP-galactopyranose mutase  48.29 
 
 		 505 aa  456  1e-127  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20111  phytoene dehydrogenase and related proteins  48.09 
 
 		 505 aa  454  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.428487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22931  phytoene dehydrogenase  49.9 
 
 		 503 aa  448  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0386  phytoene dehydrogenase related enzyme  50.1 
 
 		 500 aa  438  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16851  phytoene dehydrogenase and related protein  46.04 
 
 		 503 aa  430  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1944  phytoene dehydrogenase related enzyme  49.08 
 
 		 495 aa  431  1e-119  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1658  UDP-galactopyranose mutase  45.09 
 
 		 501 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17531  phytoene dehydrogenase  44.09 
 
 		 501 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17731  phytoene dehydrogenase  45.27 
 
 		 501 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17571  phytoene dehydrogenase and related protein  44.47 
 
 		 501 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.274386  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1711  FAD dependent oxidoreductase  37.25 
 
 		 501 aa  274  3e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0319  amine oxidase  34.88 
 
 		 489 aa  227  4e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.354274 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0346  amine oxidase  36.49 
 
 		 494 aa  222  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  31.35 
 
 		 938 aa  178  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0245  amine oxidase  31.38 
 
 		 491 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  29.31 
 
 		 516 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  30.39 
 
 		 512 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  30.39 
 
 		 512 aa  168  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  29.19 
 
 		 532 aa  166  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  29.33 
 
 		 506 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  30.92 
 
 		 508 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2640  amine oxidase  32.92 
 
 		 495 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  27.78 
 
 		 520 aa  159  9e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  29.47 
 
 		 506 aa  159  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1423  carotenoid isomerase  27.55 
 
 		 518 aa  157  4e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  27.44 
 
 		 520 aa  157  4e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3446  phytoene dehydrogenase  26.12 
 
 		 489 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.503543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  28.21 
 
 		 503 aa  155  1e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1161  FAD dependent oxidoreductase  30.69 
 
 		 500 aa  153  5.9999999999999996e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0155951  normal  0.294938 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1681  carotenoid isomerase  27.65 
 
 		 518 aa  151  2e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  30.8 
 
 		 503 aa  150  7e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  28.8 
 
 		 503 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  28.22 
 
 		 522 aa  145  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10011  putative carotenoid isomerase  27.56 
 
 		 520 aa  144  5e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0305  amine oxidase  32.19 
 
 		 492 aa  144  5e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1246  carotene isomerase  29.76 
 
 		 504 aa  141  3e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  28.24 
 
 		 507 aa  139  1e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1385  FAD dependent oxidoreductase  31.1 
 
 		 492 aa  138  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0115639 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  27.69 
 
 		 508 aa  136  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12061  putative carotenoid isomerase  24.75 
 
 		 514 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.809432  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12211  putative carotenoid isomerase  25.05 
 
 		 514 aa  130  6e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0933  phytoene dehydrogenase and related proteins-like  23.97 
 
 		 474 aa  130  8.000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1126  putative carotenoid isomerase  24.21 
 
 		 514 aa  127  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.777729  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12221  putative carotenoid isomerase  24.44 
 
 		 514 aa  127  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3602  FAD dependent oxidoreductase  27.49 
 
 		 497 aa  123  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2512  FAD dependent oxidoreductase  27.7 
 
 		 497 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224928  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2672  amine oxidase  27.66 
 
 		 513 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  26.26 
 
 		 505 aa  121  3e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2816  FAD dependent oxidoreductase  26.32 
 
 		 530 aa  117  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 		 502 aa  117  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1841  FAD dependent oxidoreductase  27 
 
 		 512 aa  117  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39472  predicted protein  27.32 
 
 		 645 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000845209  normal  0.555705 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  26.52 
 
 		 506 aa  114  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  25.68 
 
 		 515 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0577  All-trans-retinol 13,14-reductase  24.3 
 
 		 542 aa  109  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9210  CRTISO5 carotenoid isomerase 5,phytoene dehydrogenase-related protein  27.12 
 
 		 530 aa  109  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0845  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  25.19 
 
 		 740 aa  108  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1046  phytoene dehydrogenase  25.24 
 
 		 494 aa  100  7e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0345  phytoene dehydrogenase  24.61 
 
 		 509 aa  99  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03711  phytoene dehydrogenase  23.76 
 
 		 509 aa  99  2e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03701  phytoene dehydrogenase  23.6 
 
 		 509 aa  96.3  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640229  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  27.02 
 
 		 512 aa  95.1  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0871  amine oxidase  25.1 
 
 		 512 aa  94  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598168  normal  0.0715769 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1053  all-trans-retinol 13,14-reductase  26.19 
 
 		 501 aa  93.2  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09643  hypothetical protein  23.64 
 
 		 535 aa  93.2  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0783431  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54842  carotenoid isomerase  26.65 
 
 		 595 aa  92  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4578  FAD dependent oxidoreductase  26.1 
 
 		 512 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  26.27 
 
 		 508 aa  91.3  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43564  predicted protein  25.1 
 
 		 554 aa  90.5  7e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.079373  normal  0.0235879 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1024  phytoene dehydrogenase-related protein  26.1 
 
 		 518 aa  89.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3011  All-trans-retinol 13,14-reductase  25.28 
 
 		 544 aa  89  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5031  phytoene desaturase  24.51 
 
 		 509 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  25.14 
 
 		 547 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03741  phytoene dehydrogenase  23.62 
 
 		 509 aa  83.2  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1209  conserved hypothetical protein, FAD-binding domain protein  23.3 
 
 		 502 aa  82.4  0.00000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1914  phytoene dehydrogenase-related protein  25.43 
 
 		 518 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.603026 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0271  phytoene dehydrogenase  25.43 
 
 		 518 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1995  All-trans-retinol 13,14-reductase  24.32 
 
 		 499 aa  82.4  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1684  phytoene desaturase  24.61 
 
 		 506 aa  82.4  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127101  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45243  carotenoid isomerase  24.41 
 
 		 598 aa  82.4  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0755538  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  26.59 
 
 		 507 aa  80.9  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2268  phytoene desaturase  24.33 
 
 		 497 aa  80.5  0.00000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  24.02 
 
 		 498 aa  80.1  0.00000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0143  amine oxidase  25.19 
 
 		 519 aa  79.3  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  25.4 
 
 		 511 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02162  phytoene dehydrogenase  25.34 
 
 		 537 aa  79.7  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2211  phytoene desaturase  24.16 
 
 		 531 aa  78.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  0.130578 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2032  FAD dependent oxidoreductase  23.8 
 
 		 520 aa  79  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.756687 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  25.05 
 
 		 492 aa  79  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  24.41 
 
 		 563 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  23.35 
 
 		 564 aa  78.6  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3248  phytoene dehydrogenase-related protein  25.14 
 
 		 495 aa  77.8  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.242639  normal  0.13988 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>