More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3431 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  100 
 
 		 529 aa  1087    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  38.42 
 
 		 527 aa  334  2e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  33.71 
 
 		 528 aa  253  5.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  33.82 
 
 		 554 aa  240  4e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  33.15 
 
 		 554 aa  228  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  33.84 
 
 		 514 aa  228  3e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  34.27 
 
 		 559 aa  227  4e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  30.83 
 
 		 556 aa  217  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  30.18 
 
 		 547 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  31.28 
 
 		 547 aa  212  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  31.57 
 
 		 523 aa  211  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  31.82 
 
 		 524 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  30.6 
 
 		 556 aa  207  5e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  33.59 
 
 		 510 aa  203  6e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  31.35 
 
 		 510 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  29.54 
 
 		 563 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  29.39 
 
 		 565 aa  196  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  28.28 
 
 		 564 aa  191  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  28.52 
 
 		 561 aa  173  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  30.21 
 
 		 510 aa  172  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  29.68 
 
 		 530 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  29.64 
 
 		 530 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  29.64 
 
 		 530 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  28.96 
 
 		 555 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1063  FAD dependent oxidoreductase  30.09 
 
 		 545 aa  163  8.000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164132  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3290  amine oxidase  31.49 
 
 		 545 aa  161  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  28.08 
 
 		 523 aa  160  5e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2949  FAD dependent oxidoreductase  30.5 
 
 		 517 aa  152  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  27.34 
 
 		 531 aa  150  4e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3530  oxidoreductase  28.68 
 
 		 531 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  28.49 
 
 		 545 aa  147  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2838  FAD dependent oxidoreductase  29.12 
 
 		 531 aa  147  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3174  FAD dependent oxidoreductase  28.11 
 
 		 531 aa  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.919135 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  30.43 
 
 		 533 aa  144  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  30.9 
 
 		 527 aa  140  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  27.95 
 
 		 522 aa  140  7e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 		 537 aa  138  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  30.36 
 
 		 547 aa  137  6.0000000000000005e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  27.37 
 
 		 535 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  27.47 
 
 		 526 aa  136  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  26.68 
 
 		 530 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  29.03 
 
 		 536 aa  134  5e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  30.47 
 
 		 537 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  29.86 
 
 		 536 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  28.96 
 
 		 533 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  28.39 
 
 		 549 aa  130  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  27.38 
 
 		 534 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  30.27 
 
 		 536 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  28.04 
 
 		 518 aa  128  3e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2541  putative phytoene dehydrogenase  27.76 
 
 		 530 aa  128  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.553028 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  26.5 
 
 		 534 aa  127  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  26.69 
 
 		 560 aa  125  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  27.79 
 
 		 524 aa  124  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  28.23 
 
 		 539 aa  124  4e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  29.62 
 
 		 552 aa  123  8e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  27.76 
 
 		 516 aa  122  1.9999999999999998e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.470789 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3030  FAD dependent oxidoreductase  28.86 
 
 		 551 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.788741  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2659  beta-carotene ketolase  28.25 
 
 		 526 aa  120  7e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  30.19 
 
 		 535 aa  120  9e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0948  FAD dependent oxidoreductase  29.28 
 
 		 536 aa  119  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  27.76 
 
 		 528 aa  117  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0637  putative dehydrogenase  27.68 
 
 		 548 aa  117  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0715988 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  26.62 
 
 		 531 aa  113  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  27.64 
 
 		 530 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  28.93 
 
 		 474 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2744  FAD dependent oxidoreductase  30.37 
 
 		 535 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294261  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  27.1 
 
 		 523 aa  111  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0947  FAD dependent oxidoreductase  28.09 
 
 		 532 aa  110  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1935  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 		 521 aa  109  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790128  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  28.08 
 
 		 512 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  27.12 
 
 		 528 aa  108  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4519  FAD dependent oxidoreductase  27.18 
 
 		 506 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  28.04 
 
 		 474 aa  106  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3302  FAD dependent oxidoreductase  28.24 
 
 		 532 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31610  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  25.52 
 
 		 503 aa  106  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.911892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4056  FAD dependent oxidoreductase  27.5 
 
 		 580 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3180  FAD dependent oxidoreductase  24.57 
 
 		 478 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  28.15 
 
 		 507 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  28.91 
 
 		 532 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3691  FAD dependent oxidoreductase  26.54 
 
 		 481 aa  103  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  28.91 
 
 		 532 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0335  FAD dependent oxidoreductase  23.69 
 
 		 476 aa  100  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000674369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1663  phytoene dehydrogenase, putative  26.32 
 
 		 465 aa  100  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.638198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2416  FAD dependent oxidoreductase  25.24 
 
 		 487 aa  99  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.28605  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2084  FAD dependent oxidoreductase  25.52 
 
 		 477 aa  98.6  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.424143 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0562  phytoene dehydrogenase  22.67 
 
 		 476 aa  97.4  6e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  24.44 
 
 		 512 aa  96.7  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  24.34 
 
 		 512 aa  96.7  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2736  FAD dependent oxidoreductase  28.63 
 
 		 484 aa  96.3  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118695  hitchhiker  0.0000199916 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  29.89 
 
 		 470 aa  96.3  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  24.29 
 
 		 533 aa  96.3  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1398  FAD dependent oxidoreductase  25.8 
 
 		 469 aa  95.9  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.389386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1978  FAD dependent oxidoreductase  26.29 
 
 		 534 aa  95.1  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  26.71 
 
 		 511 aa  95.1  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45243  carotenoid isomerase  24.81 
 
 		 598 aa  94.4  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0755538  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  24.9 
 
 		 506 aa  94  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1712  phytoene desaturase  25.78 
 
 		 504 aa  94  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678565  normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  24.39 
 
 		 506 aa  93.6  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0239  FAD dependent oxidoreductase  26.52 
 
 		 505 aa  93.2  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.771217 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  26.05 
 
 		 531 aa  91.3  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>