More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2310 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  69.61 
 
 
510 aa  686    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
514 aa  1020    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  70.22 
 
 
510 aa  715    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  62.11 
 
 
510 aa  600  1e-170  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  47.45 
 
 
554 aa  463  1e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  45.19 
 
 
547 aa  432  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  45.04 
 
 
554 aa  431  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  44.27 
 
 
559 aa  427  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3290  amine oxidase  43.1 
 
 
545 aa  344  2e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  37.19 
 
 
556 aa  331  2e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2659  beta-carotene ketolase  41.73 
 
 
526 aa  327  3e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3030  FAD dependent oxidoreductase  40.42 
 
 
551 aa  315  8e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.788741  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  32.9 
 
 
547 aa  289  7e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  34.69 
 
 
556 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  34.38 
 
 
561 aa  270  5e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  31 
 
 
564 aa  269  8e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  31.11 
 
 
565 aa  258  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  30.93 
 
 
563 aa  252  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  35.12 
 
 
516 aa  243  5e-63  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.470789 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
518 aa  241  2e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  32.11 
 
 
555 aa  236  9e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  33.84 
 
 
529 aa  228  3e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  32.17 
 
 
547 aa  215  9.999999999999999e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  34.87 
 
 
539 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1063  FAD dependent oxidoreductase  34.44 
 
 
545 aa  210  5e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164132  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  33.21 
 
 
549 aa  209  7e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  32.53 
 
 
533 aa  206  7e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  34.39 
 
 
536 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  30.84 
 
 
530 aa  201  3e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  30.78 
 
 
537 aa  200  5e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  32.89 
 
 
527 aa  199  7e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  32.4 
 
 
533 aa  194  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2838  FAD dependent oxidoreductase  32.2 
 
 
531 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  30.45 
 
 
537 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3530  oxidoreductase  31.82 
 
 
531 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  36.18 
 
 
532 aa  189  9e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  36 
 
 
532 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3174  FAD dependent oxidoreductase  31.44 
 
 
531 aa  189  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.919135 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  31.52 
 
 
536 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  32.47 
 
 
524 aa  187  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  34.39 
 
 
530 aa  184  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  31.14 
 
 
552 aa  183  7e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3302  FAD dependent oxidoreductase  35.47 
 
 
532 aa  182  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  31.4 
 
 
536 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2541  putative phytoene dehydrogenase  32.2 
 
 
530 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.553028 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  32.41 
 
 
535 aa  179  8e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2744  FAD dependent oxidoreductase  31.96 
 
 
535 aa  176  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294261  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  34.03 
 
 
528 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1978  FAD dependent oxidoreductase  31.99 
 
 
534 aa  172  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413393  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2949  FAD dependent oxidoreductase  32.05 
 
 
517 aa  167  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  31.4 
 
 
530 aa  163  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  32.14 
 
 
523 aa  161  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  29.25 
 
 
527 aa  159  1e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  30.98 
 
 
530 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  30.98 
 
 
530 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  31.79 
 
 
523 aa  157  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0948  FAD dependent oxidoreductase  30.62 
 
 
536 aa  149  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  29.24 
 
 
533 aa  146  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4888  FAD dependent oxidoreductase  28.98 
 
 
520 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.162383 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  31.46 
 
 
528 aa  143  8e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1935  FAD dependent oxidoreductase  28.48 
 
 
521 aa  143  9e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790128  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4505  FAD dependent oxidoreductase  28.98 
 
 
520 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4592  FAD dependent oxidoreductase  28.98 
 
 
520 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.593862 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  32.11 
 
 
531 aa  142  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0947  FAD dependent oxidoreductase  29.83 
 
 
532 aa  137  6.0000000000000005e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3691  FAD dependent oxidoreductase  31.38 
 
 
481 aa  135  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128787  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  31.52 
 
 
523 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 
522 aa  130  8.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5076  FAD dependent oxidoreductase  25.86 
 
 
520 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  30.4 
 
 
535 aa  127  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  31.94 
 
 
524 aa  126  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  28.43 
 
 
526 aa  124  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2416  FAD dependent oxidoreductase  31.7 
 
 
487 aa  122  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.28605  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 
534 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0637  putative dehydrogenase  27.68 
 
 
548 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0715988 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  28.54 
 
 
528 aa  120  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  28.52 
 
 
474 aa  119  9e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2742  phytoene desaturase  26.14 
 
 
553 aa  120  9e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  29.53 
 
 
545 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  29.94 
 
 
534 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  28.85 
 
 
560 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1677  FAD dependent oxidoreductase  25.58 
 
 
519 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  28.68 
 
 
531 aa  117  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  28.88 
 
 
474 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  26.89 
 
 
506 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4519  FAD dependent oxidoreductase  29.04 
 
 
506 aa  114  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5197  phytoene desaturase  28.74 
 
 
525 aa  114  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  29.41 
 
 
470 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13863  dehydrogenase  25.67 
 
 
536 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  27.37 
 
 
503 aa  110  8.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1278  FAD dependent oxidoreductase  27.99 
 
 
523 aa  110  8.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1663  phytoene dehydrogenase, putative  28.71 
 
 
465 aa  109  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.638198  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1505  FAD dependent oxidoreductase  27.97 
 
 
527 aa  108  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00846828  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  26.21 
 
 
512 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3794  FAD dependent oxidoreductase  30.47 
 
 
484 aa  108  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  26.02 
 
 
512 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  28.82 
 
 
472 aa  107  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  28.79 
 
 
531 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0335  FAD dependent oxidoreductase  25.58 
 
 
476 aa  104  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000674369  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  25.29 
 
 
516 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>