More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0006 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  100 
 
 
556 aa  1143    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  45.42 
 
 
554 aa  478  1e-133  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  43.35 
 
 
559 aa  468  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  41.86 
 
 
554 aa  456  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  41.81 
 
 
547 aa  431  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  37.83 
 
 
510 aa  354  2.9999999999999997e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  37.52 
 
 
547 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  37.19 
 
 
514 aa  335  9e-91  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  35.81 
 
 
510 aa  332  8e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  35.45 
 
 
564 aa  315  9.999999999999999e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  35.63 
 
 
563 aa  313  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  34.3 
 
 
556 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  35.44 
 
 
561 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  35.96 
 
 
565 aa  303  7.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3290  amine oxidase  35.98 
 
 
545 aa  299  7e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  34.16 
 
 
510 aa  293  6e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3030  FAD dependent oxidoreductase  36.24 
 
 
551 aa  285  2.0000000000000002e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.788741  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  35.85 
 
 
516 aa  279  8e-74  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.470789 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  33.46 
 
 
555 aa  274  3e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  32.96 
 
 
537 aa  272  1e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  34.59 
 
 
518 aa  271  2.9999999999999997e-71  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2659  beta-carotene ketolase  35.36 
 
 
526 aa  268  2e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  33.58 
 
 
530 aa  256  6e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  36.29 
 
 
536 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  33.52 
 
 
547 aa  253  6e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  33.58 
 
 
533 aa  251  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  32.52 
 
 
533 aa  251  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  33.15 
 
 
536 aa  247  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  33.21 
 
 
527 aa  243  5e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  32.02 
 
 
530 aa  241  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  31.93 
 
 
549 aa  241  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  32.8 
 
 
539 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  32.84 
 
 
552 aa  239  9e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  32.02 
 
 
537 aa  237  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1063  FAD dependent oxidoreductase  32.38 
 
 
545 aa  234  3e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164132  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  32.09 
 
 
536 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  33.96 
 
 
532 aa  229  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  33.77 
 
 
532 aa  229  1e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2541  putative phytoene dehydrogenase  32.71 
 
 
530 aa  224  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.553028 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3530  oxidoreductase  32.02 
 
 
531 aa  219  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3174  FAD dependent oxidoreductase  31.84 
 
 
531 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.919135 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2744  FAD dependent oxidoreductase  32.9 
 
 
535 aa  217  5e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294261  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3302  FAD dependent oxidoreductase  33.21 
 
 
532 aa  216  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2838  FAD dependent oxidoreductase  31.89 
 
 
531 aa  217  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  31.28 
 
 
535 aa  211  3e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  31.41 
 
 
529 aa  210  6e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0948  FAD dependent oxidoreductase  30.54 
 
 
536 aa  194  5e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  29.16 
 
 
528 aa  193  9e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1978  FAD dependent oxidoreductase  32.67 
 
 
534 aa  192  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413393  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2949  FAD dependent oxidoreductase  30.45 
 
 
517 aa  185  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0947  FAD dependent oxidoreductase  27.95 
 
 
532 aa  176  7e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  29.07 
 
 
527 aa  176  8e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  26.68 
 
 
524 aa  168  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 
530 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  26.25 
 
 
530 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  26.25 
 
 
530 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  28.35 
 
 
545 aa  160  4e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0637  putative dehydrogenase  29.66 
 
 
548 aa  160  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0715988 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  28.6 
 
 
526 aa  155  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 
560 aa  152  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  28.6 
 
 
523 aa  153  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  27 
 
 
528 aa  150  5e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  28.76 
 
 
474 aa  147  5e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  27.68 
 
 
531 aa  147  5e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1677  FAD dependent oxidoreductase  26.57 
 
 
519 aa  147  6e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1278  FAD dependent oxidoreductase  26.76 
 
 
523 aa  143  8e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  27.34 
 
 
524 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5076  FAD dependent oxidoreductase  25.32 
 
 
520 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4888  FAD dependent oxidoreductase  26.26 
 
 
520 aa  141  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.162383 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4505  FAD dependent oxidoreductase  26.26 
 
 
520 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4592  FAD dependent oxidoreductase  26.26 
 
 
520 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.593862 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  28.19 
 
 
507 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  28.23 
 
 
474 aa  139  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1331  FAD dependent oxidoreductase  27.36 
 
 
531 aa  139  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3691  FAD dependent oxidoreductase  28.6 
 
 
481 aa  137  7.000000000000001e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128787  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13863  dehydrogenase  27.5 
 
 
536 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  26.63 
 
 
535 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  25.52 
 
 
523 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0562  phytoene dehydrogenase  27.24 
 
 
476 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  26.32 
 
 
534 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1935  FAD dependent oxidoreductase  26.53 
 
 
521 aa  133  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790128  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  24.95 
 
 
533 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0335  FAD dependent oxidoreductase  26.34 
 
 
476 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000674369  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  25.69 
 
 
522 aa  130  7.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  25.91 
 
 
508 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3577  zeta-phytoene desaturase  25.43 
 
 
504 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557125  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  26.03 
 
 
498 aa  127  7e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  25.2 
 
 
534 aa  126  8.000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0988  FAD dependent oxidoreductase  26.43 
 
 
528 aa  126  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  26.59 
 
 
472 aa  125  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  25.83 
 
 
492 aa  125  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5197  phytoene desaturase  24.95 
 
 
525 aa  125  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  26.02 
 
 
528 aa  124  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  23.51 
 
 
531 aa  124  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0143  amine oxidase  26.09 
 
 
519 aa  124  5e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  25.93 
 
 
505 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  24.91 
 
 
493 aa  121  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  24.54 
 
 
523 aa  120  7e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  26.51 
 
 
511 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  25.95 
 
 
506 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>