162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3691 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3691  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 481 aa  929    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2416  FAD dependent oxidoreductase  55.46 
 
 		 487 aa  444  1e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.28605  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15580  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  55.04 
 
 		 469 aa  442  1e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0617882  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  50.74 
 
 		 474 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14190  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  57.65 
 
 		 511 aa  436  1e-121  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00208581  normal  0.0106814 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  50.11 
 
 		 474 aa  437  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  50.64 
 
 		 470 aa  425  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1663  phytoene dehydrogenase, putative  50 
 
 		 465 aa  424  1e-117  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.638198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2084  FAD dependent oxidoreductase  45.65 
 
 		 477 aa  409  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.424143 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2736  FAD dependent oxidoreductase  47.02 
 
 		 484 aa  408  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118695  hitchhiker  0.0000199916 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  49.26 
 
 		 472 aa  405  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0268  FAD dependent oxidoreductase  49.47 
 
 		 466 aa  405  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4519  FAD dependent oxidoreductase  49.26 
 
 		 506 aa  402  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2860  FAD dependent oxidoreductase  47.66 
 
 		 468 aa  403  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0562  phytoene dehydrogenase  44.26 
 
 		 476 aa  402  9.999999999999999e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0335  FAD dependent oxidoreductase  43.74 
 
 		 476 aa  401  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000674369  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03260  putative dehydrogenase  40.97 
 
 		 476 aa  396  1e-109  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11461  dehydrogenase  45.89 
 
 		 473 aa  391  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3180  FAD dependent oxidoreductase  44.44 
 
 		 478 aa  390  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3246  FAD dependent oxidoreductase  48.22 
 
 		 515 aa  386  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0239  FAD dependent oxidoreductase  52.54 
 
 		 505 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.771217 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3794  FAD dependent oxidoreductase  51.61 
 
 		 484 aa  378  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0553  FAD dependent oxidoreductase  43.5 
 
 		 472 aa  370  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0229  FAD dependent oxidoreductase  55.2 
 
 		 474 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4153  putative dehydrogenase  46.6 
 
 		 479 aa  371  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1398  FAD dependent oxidoreductase  48.09 
 
 		 469 aa  363  4e-99  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.389386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0240  FAD dependent oxidoreductase  55.2 
 
 		 474 aa  350  3e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0251  FAD dependent oxidoreductase  54.78 
 
 		 474 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3920  putative dehydrogenase  45.96 
 
 		 482 aa  347  2e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26280  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  49.06 
 
 		 477 aa  347  3e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17640  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  46.11 
 
 		 499 aa  345  1e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.760158  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0214  FAD dependent oxidoreductase  46.85 
 
 		 491 aa  338  9.999999999999999e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.942451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1889  hypothetical protein  45.42 
 
 		 476 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247314  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1909  hypothetical protein  45.42 
 
 		 491 aa  337  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1955  hypothetical protein  45.42 
 
 		 491 aa  337  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2127  hypothetical protein  45.17 
 
 		 482 aa  337  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0818  dehydrogenase  44.3 
 
 		 496 aa  330  3e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.486977 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2057  FAD dependent oxidoreductase  43.55 
 
 		 487 aa  326  6e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.548507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31610  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  43.51 
 
 		 503 aa  324  2e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.911892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13012  hypothetical protein  44.42 
 
 		 480 aa  316  5e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0101829  normal  0.587267 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4235  hypothetical protein  43.19 
 
 		 482 aa  315  8e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0811417  normal  0.282669 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  42.71 
 
 		 524 aa  308  2.0000000000000002e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4109  FAD dependent oxidoreductase  41.65 
 
 		 491 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0668634  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0805  dehydrogenase  42.37 
 
 		 437 aa  266  7e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  37.72 
 
 		 530 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  37.83 
 
 		 530 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  37.83 
 
 		 530 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  37.57 
 
 		 531 aa  248  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  36.73 
 
 		 545 aa  236  6e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  37.63 
 
 		 528 aa  231  2e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0214  FAD dependent oxidoreductase  47.6 
 
 		 568 aa  220  3.9999999999999997e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.646521  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  35.79 
 
 		 526 aa  218  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  35.83 
 
 		 534 aa  215  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  33.59 
 
 		 560 aa  212  1e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4056  FAD dependent oxidoreductase  36.57 
 
 		 580 aa  212  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  35.91 
 
 		 534 aa  201  3.9999999999999996e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  36.17 
 
 		 528 aa  196  6e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1761  amine oxidase  34.38 
 
 		 530 aa  186  7e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0378062  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  31.21 
 
 		 510 aa  153  7e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  28.79 
 
 		 533 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  29.58 
 
 		 554 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  28.54 
 
 		 535 aa  147  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  30.53 
 
 		 510 aa  147  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  29.3 
 
 		 559 aa  144  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  31.85 
 
 		 514 aa  139  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  28.97 
 
 		 556 aa  139  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  28.76 
 
 		 554 aa  136  9e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  28.74 
 
 		 531 aa  131  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  29.34 
 
 		 531 aa  130  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  28.82 
 
 		 523 aa  123  7e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  27.33 
 
 		 522 aa  122  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  26.48 
 
 		 524 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  28.24 
 
 		 528 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  25.55 
 
 		 547 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  26.65 
 
 		 547 aa  113  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  24.81 
 
 		 564 aa  112  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  28.94 
 
 		 547 aa  112  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  26.06 
 
 		 555 aa  111  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  28.27 
 
 		 523 aa  111  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  24.91 
 
 		 565 aa  109  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  30.96 
 
 		 536 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  28.89 
 
 		 533 aa  107  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  26.36 
 
 		 529 aa  106  8e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  27.52 
 
 		 523 aa  105  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  28.87 
 
 		 510 aa  105  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1063  FAD dependent oxidoreductase  29.57 
 
 		 545 aa  104  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164132  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  25.1 
 
 		 556 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  25.19 
 
 		 563 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  25.84 
 
 		 530 aa  100  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2659  beta-carotene ketolase  30.24 
 
 		 526 aa  100  8e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3030  FAD dependent oxidoreductase  29.32 
 
 		 551 aa  99.8  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.788741  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  27.68 
 
 		 536 aa  97.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  26.84 
 
 		 539 aa  96.7  9e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3290  amine oxidase  30.57 
 
 		 545 aa  95.9  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  29.53 
 
 		 527 aa  95.5  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  24.81 
 
 		 537 aa  94  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  26.79 
 
 		 549 aa  93.2  9e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0637  putative dehydrogenase  30.53 
 
 		 548 aa  91.3  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0715988 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0947  FAD dependent oxidoreductase  28.49 
 
 		 532 aa  91.3  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  24.72 
 
 		 561 aa  90.1  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.839972 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>