284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1935 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1935  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 521 aa  1049    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790128  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0637  putative dehydrogenase  41.27 
 
 		 548 aa  382  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0715988 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2949  FAD dependent oxidoreductase  35.21 
 
 		 517 aa  266  8.999999999999999e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  30.67 
 
 		 554 aa  204  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  29.62 
 
 		 554 aa  196  7e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  29.81 
 
 		 559 aa  193  6e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  28.15 
 
 		 547 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 		 556 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  28.49 
 
 		 563 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  30.2 
 
 		 527 aa  169  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  29.22 
 
 		 514 aa  167  2.9999999999999998e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  27.26 
 
 		 564 aa  167  4e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  28.55 
 
 		 561 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  26.94 
 
 		 565 aa  162  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  28.22 
 
 		 547 aa  162  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  28.41 
 
 		 537 aa  162  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  27.92 
 
 		 510 aa  161  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  29.93 
 
 		 549 aa  160  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  27.65 
 
 		 556 aa  159  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  27.7 
 
 		 518 aa  155  2e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  24.86 
 
 		 555 aa  150  5e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  27.15 
 
 		 516 aa  150  6e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.470789 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  30.47 
 
 		 533 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  29.44 
 
 		 533 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  27.34 
 
 		 510 aa  147  6e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  27.59 
 
 		 530 aa  145  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  27.48 
 
 		 547 aa  145  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2541  putative phytoene dehydrogenase  29.66 
 
 		 530 aa  139  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.553028 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  27.94 
 
 		 539 aa  139  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0948  FAD dependent oxidoreductase  29.48 
 
 		 536 aa  135  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2659  beta-carotene ketolase  30.34 
 
 		 526 aa  135  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  27.53 
 
 		 527 aa  134  3.9999999999999996e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  27.8 
 
 		 537 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  28.89 
 
 		 536 aa  133  9e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  28.04 
 
 		 528 aa  131  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  27.41 
 
 		 529 aa  130  5.0000000000000004e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3030  FAD dependent oxidoreductase  27.42 
 
 		 551 aa  124  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.788741  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  29.48 
 
 		 532 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  29.48 
 
 		 532 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3290  amine oxidase  28.86 
 
 		 545 aa  124  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3302  FAD dependent oxidoreductase  28.94 
 
 		 532 aa  124  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  29.12 
 
 		 536 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  29.01 
 
 		 530 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  28.28 
 
 		 536 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0947  FAD dependent oxidoreductase  27.77 
 
 		 532 aa  121  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  29.96 
 
 		 531 aa  120  6e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  29.7 
 
 		 552 aa  118  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  27.36 
 
 		 510 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  27.82 
 
 		 530 aa  114  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  27.82 
 
 		 530 aa  114  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5076  FAD dependent oxidoreductase  25.41 
 
 		 520 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1978  FAD dependent oxidoreductase  28.1 
 
 		 534 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 		 530 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  28.49 
 
 		 535 aa  110  9.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2838  FAD dependent oxidoreductase  26.25 
 
 		 531 aa  108  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  28.33 
 
 		 526 aa  107  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  25.14 
 
 		 511 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2744  FAD dependent oxidoreductase  28.97 
 
 		 535 aa  106  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294261  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1677  FAD dependent oxidoreductase  24.82 
 
 		 519 aa  103  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3530  oxidoreductase  25.45 
 
 		 531 aa  103  6e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3174  FAD dependent oxidoreductase  25.05 
 
 		 531 aa  101  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.919135 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0988  FAD dependent oxidoreductase  26.87 
 
 		 528 aa  99.4  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  26.54 
 
 		 560 aa  98.2  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4505  FAD dependent oxidoreductase  24.72 
 
 		 520 aa  97.4  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4592  FAD dependent oxidoreductase  24.72 
 
 		 520 aa  97.4  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.593862 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  25.37 
 
 		 511 aa  97.1  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  25.09 
 
 		 511 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  28.54 
 
 		 534 aa  96.3  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4888  FAD dependent oxidoreductase  24.53 
 
 		 520 aa  96.7  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.162383 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  25.09 
 
 		 511 aa  95.9  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  27.65 
 
 		 534 aa  95.5  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  26.94 
 
 		 528 aa  95.1  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  25.56 
 
 		 533 aa  94  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13863  dehydrogenase  25.28 
 
 		 536 aa  94  6e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  24.91 
 
 		 524 aa  93.2  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  24.95 
 
 		 502 aa  92.4  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  26.27 
 
 		 523 aa  91.7  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  27.77 
 
 		 512 aa  90.5  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1063  FAD dependent oxidoreductase  26 
 
 		 545 aa  90.5  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164132  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  28.02 
 
 		 524 aa  89.7  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1505  FAD dependent oxidoreductase  25.56 
 
 		 527 aa  89.7  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00846828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  25.23 
 
 		 507 aa  88.6  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  26.27 
 
 		 545 aa  88.2  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  26.08 
 
 		 474 aa  88.2  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  26.43 
 
 		 531 aa  87.8  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  25.84 
 
 		 523 aa  87  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14190  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  28.79 
 
 		 511 aa  86.7  9e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00208581  normal  0.0106814 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1331  FAD dependent oxidoreductase  25.18 
 
 		 531 aa  85.5  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2512  FAD dependent oxidoreductase  26.16 
 
 		 497 aa  85.1  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224928  normal  0.507466 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2157  FAD dependent oxidoreductase  23.59 
 
 		 430 aa  82.4  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1278  FAD dependent oxidoreductase  25.97 
 
 		 523 aa  82  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  23.51 
 
 		 493 aa  81.6  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02162  phytoene dehydrogenase  22.05 
 
 		 537 aa  81.6  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  26.74 
 
 		 523 aa  80.9  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  25.64 
 
 		 474 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 		 528 aa  80.5  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  25.41 
 
 		 506 aa  80.5  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3602  FAD dependent oxidoreductase  25.69 
 
 		 497 aa  80.1  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0493  phytoene desaturase  24.3 
 
 		 507 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.145536  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0609  zeta-phytoene desaturase  23.6 
 
 		 495 aa  78.6  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.392694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>