More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3934 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  69.79 
 
 		 533 aa  728    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  67.54 
 
 		 537 aa  730    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  69.14 
 
 		 539 aa  716    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  63.48 
 
 		 547 aa  663    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 549 aa  1122    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  59.51 
 
 		 533 aa  627  1e-178  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  58.91 
 
 		 537 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  58.54 
 
 		 527 aa  605  9.999999999999999e-173  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  59.29 
 
 		 535 aa  595  1e-169  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  59.85 
 
 		 536 aa  597  1e-169  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  59.29 
 
 		 536 aa  594  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2744  FAD dependent oxidoreductase  59.66 
 
 		 535 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294261  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  57.99 
 
 		 552 aa  579  1e-164  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  44.96 
 
 		 555 aa  446  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  44.42 
 
 		 536 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  39.58 
 
 		 518 aa  397  1e-109  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  40.26 
 
 		 516 aa  379  1e-104  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.470789 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  43.31 
 
 		 532 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  43.5 
 
 		 532 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3302  FAD dependent oxidoreductase  43.5 
 
 		 532 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2541  putative phytoene dehydrogenase  39.7 
 
 		 530 aa  337  5e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.553028 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  38.3 
 
 		 530 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1978  FAD dependent oxidoreductase  37.85 
 
 		 534 aa  313  2.9999999999999996e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3530  oxidoreductase  37.36 
 
 		 531 aa  296  6e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  33.71 
 
 		 530 aa  294  3e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3174  FAD dependent oxidoreductase  36.99 
 
 		 531 aa  294  4e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.919135 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2838  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 		 531 aa  292  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  36.58 
 
 		 554 aa  291  2e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  35.8 
 
 		 554 aa  290  6e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  35.66 
 
 		 559 aa  280  5e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  33.58 
 
 		 547 aa  258  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0948  FAD dependent oxidoreductase  35.07 
 
 		 536 aa  253  8.000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  31.74 
 
 		 556 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  31.32 
 
 		 547 aa  232  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  31.08 
 
 		 561 aa  221  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  30.04 
 
 		 563 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  33.89 
 
 		 523 aa  217  5e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  30.59 
 
 		 556 aa  216  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  33.21 
 
 		 514 aa  209  8e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  28.34 
 
 		 564 aa  208  2e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  28.7 
 
 		 565 aa  200  6e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  30.3 
 
 		 510 aa  199  1.0000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0947  FAD dependent oxidoreductase  31.05 
 
 		 532 aa  198  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1505  FAD dependent oxidoreductase  32.41 
 
 		 527 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00846828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  29.25 
 
 		 510 aa  191  4e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1278  FAD dependent oxidoreductase  30.6 
 
 		 523 aa  190  5e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1331  FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 		 531 aa  189  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3290  amine oxidase  32.47 
 
 		 545 aa  188  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  29.31 
 
 		 528 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5076  FAD dependent oxidoreductase  28.62 
 
 		 520 aa  174  5e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  29.23 
 
 		 510 aa  172  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1677  FAD dependent oxidoreductase  27.44 
 
 		 519 aa  168  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2949  FAD dependent oxidoreductase  31.05 
 
 		 517 aa  167  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  29.68 
 
 		 533 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13863  dehydrogenase  27.42 
 
 		 536 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  30.13 
 
 		 531 aa  156  7e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4888  FAD dependent oxidoreductase  27.22 
 
 		 520 aa  153  8e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.162383 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4505  FAD dependent oxidoreductase  27.34 
 
 		 520 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4592  FAD dependent oxidoreductase  27.34 
 
 		 520 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.593862 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2659  beta-carotene ketolase  29.23 
 
 		 526 aa  152  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  29.86 
 
 		 524 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3030  FAD dependent oxidoreductase  29.66 
 
 		 551 aa  147  6e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.788741  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2146  FAD dependent oxidoreductase  30.66 
 
 		 505 aa  145  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.220753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  29.78 
 
 		 474 aa  145  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0637  putative dehydrogenase  29.55 
 
 		 548 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0715988 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  27.99 
 
 		 530 aa  143  9e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  29.13 
 
 		 523 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1063  FAD dependent oxidoreductase  29.13 
 
 		 545 aa  142  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164132  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0988  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 		 528 aa  141  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  28.54 
 
 		 545 aa  140  7e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  27.74 
 
 		 530 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  28.55 
 
 		 474 aa  139  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  27.74 
 
 		 530 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  30.65 
 
 		 524 aa  138  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  26.68 
 
 		 527 aa  134  5e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  28.32 
 
 		 535 aa  133  6e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2157  FAD dependent oxidoreductase  26.78 
 
 		 430 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  28.39 
 
 		 529 aa  130  5.0000000000000004e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0553  FAD dependent oxidoreductase  26.65 
 
 		 472 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6398  amine oxidase  31.23 
 
 		 504 aa  129  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3180  FAD dependent oxidoreductase  26.25 
 
 		 478 aa  128  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2416  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 		 487 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.28605  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  29.02 
 
 		 531 aa  126  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2257  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.56 
 
 		 520 aa  123  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8148  FAD dependent oxidoreductase  28.73 
 
 		 557 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  28.73 
 
 		 531 aa  121  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  28.49 
 
 		 560 aa  121  3.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1935  FAD dependent oxidoreductase  28.96 
 
 		 521 aa  119  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790128  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  29.6 
 
 		 528 aa  118  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5019  hypothetical protein  29.03 
 
 		 516 aa  118  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579081 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0562  phytoene dehydrogenase  24.63 
 
 		 476 aa  117  6e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0335  FAD dependent oxidoreductase  26.03 
 
 		 476 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000674369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  26.88 
 
 		 528 aa  115  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1663  phytoene dehydrogenase, putative  25.32 
 
 		 465 aa  114  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.638198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  25.14 
 
 		 523 aa  114  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1732  hypothetical protein  28.29 
 
 		 520 aa  114  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2084  FAD dependent oxidoreductase  25.46 
 
 		 477 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.424143 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1160  FAD dependent oxidoreductase  27.71 
 
 		 516 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  27.17 
 
 		 470 aa  111  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2736  FAD dependent oxidoreductase  26.3 
 
 		 484 aa  110  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118695  hitchhiker  0.0000199916 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>