192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3180 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3180  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
478 aa  983    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2084  FAD dependent oxidoreductase  61.84 
 
 
477 aa  622  1e-177  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.424143 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0335  FAD dependent oxidoreductase  61.65 
 
 
476 aa  619  1e-176  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000674369  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0562  phytoene dehydrogenase  60.13 
 
 
476 aa  580  1e-164  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2736  FAD dependent oxidoreductase  59.75 
 
 
484 aa  575  1.0000000000000001e-163  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118695  hitchhiker  0.0000199916 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  53.53 
 
 
474 aa  500  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03260  putative dehydrogenase  49.58 
 
 
476 aa  496  1e-139  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  52.97 
 
 
474 aa  495  1e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  52.89 
 
 
470 aa  490  1e-137  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  52.13 
 
 
472 aa  475  1e-133  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2416  FAD dependent oxidoreductase  53.02 
 
 
487 aa  472  1e-132  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.28605  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4519  FAD dependent oxidoreductase  49.26 
 
 
506 aa  437  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0553  FAD dependent oxidoreductase  47.03 
 
 
472 aa  422  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3246  FAD dependent oxidoreductase  46.72 
 
 
515 aa  416  9.999999999999999e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1663  phytoene dehydrogenase, putative  48.49 
 
 
465 aa  414  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.638198  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0268  FAD dependent oxidoreductase  49.15 
 
 
466 aa  412  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4153  putative dehydrogenase  46.22 
 
 
479 aa  409  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0239  FAD dependent oxidoreductase  50.43 
 
 
505 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.771217 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0229  FAD dependent oxidoreductase  51.05 
 
 
474 aa  398  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1398  FAD dependent oxidoreductase  47.21 
 
 
469 aa  399  9.999999999999999e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.389386  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11461  dehydrogenase  45.94 
 
 
473 aa  395  1e-109  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2860  FAD dependent oxidoreductase  44.52 
 
 
468 aa  394  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0240  FAD dependent oxidoreductase  51.48 
 
 
474 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0251  FAD dependent oxidoreductase  52.11 
 
 
474 aa  391  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3691  FAD dependent oxidoreductase  44.44 
 
 
481 aa  382  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128787  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4109  FAD dependent oxidoreductase  45.47 
 
 
491 aa  373  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0668634  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3920  putative dehydrogenase  46.3 
 
 
482 aa  375  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26280  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  49.14 
 
 
477 aa  365  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3794  FAD dependent oxidoreductase  45.86 
 
 
484 aa  368  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17640  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  43.92 
 
 
499 aa  366  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.760158  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2057  FAD dependent oxidoreductase  43.4 
 
 
487 aa  363  3e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.548507  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31610  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  44.19 
 
 
503 aa  363  4e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.911892  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0818  dehydrogenase  41.41 
 
 
496 aa  351  2e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.486977 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  41.67 
 
 
524 aa  326  5e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0214  FAD dependent oxidoreductase  41.24 
 
 
491 aa  324  3e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.942451  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14190  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  43.04 
 
 
511 aa  323  6e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00208581  normal  0.0106814 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13012  hypothetical protein  39.41 
 
 
480 aa  320  3e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0101829  normal  0.587267 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2127  hypothetical protein  40.5 
 
 
482 aa  319  5e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255916  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15580  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  40.77 
 
 
469 aa  317  4e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0617882  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1909  hypothetical protein  38.27 
 
 
491 aa  316  7e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1955  hypothetical protein  38.27 
 
 
491 aa  316  7e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1889  hypothetical protein  38.27 
 
 
476 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247314  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4235  hypothetical protein  39.25 
 
 
482 aa  309  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0811417  normal  0.282669 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0214  FAD dependent oxidoreductase  45.59 
 
 
568 aa  259  1e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.646521  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0805  dehydrogenase  37.2 
 
 
437 aa  243  6e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  34.96 
 
 
545 aa  239  8e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  32.94 
 
 
531 aa  233  5e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  32.32 
 
 
534 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  31.2 
 
 
530 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  30.91 
 
 
530 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  30.91 
 
 
530 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  32.54 
 
 
560 aa  207  4e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  29.84 
 
 
526 aa  195  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  31.6 
 
 
528 aa  192  8e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  31.98 
 
 
534 aa  192  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1761  amine oxidase  33.4 
 
 
530 aa  188  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0378062  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  31.3 
 
 
528 aa  167  5e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4056  FAD dependent oxidoreductase  29.92 
 
 
580 aa  166  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  29.56 
 
 
523 aa  152  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  28.52 
 
 
524 aa  146  9e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 
528 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  27.51 
 
 
547 aa  137  4e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  24.44 
 
 
547 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  27.12 
 
 
522 aa  135  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  28.51 
 
 
531 aa  133  6.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  26.49 
 
 
537 aa  133  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  25.62 
 
 
535 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 
537 aa  128  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  26.25 
 
 
549 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  25.9 
 
 
533 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  26.23 
 
 
554 aa  125  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  25.09 
 
 
556 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  27.9 
 
 
531 aa  124  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  26.15 
 
 
554 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  22.47 
 
 
564 aa  121  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  26.44 
 
 
539 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  27.98 
 
 
523 aa  121  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  23.37 
 
 
563 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  23.99 
 
 
565 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  26.49 
 
 
547 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  27.85 
 
 
527 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  26.76 
 
 
523 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  25.28 
 
 
559 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  26.18 
 
 
555 aa  113  9e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  27.66 
 
 
536 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  25.33 
 
 
533 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  25.8 
 
 
510 aa  112  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  26.1 
 
 
510 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  26.54 
 
 
533 aa  111  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  27.44 
 
 
536 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  29.17 
 
 
536 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  25.25 
 
 
527 aa  108  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  26.73 
 
 
552 aa  107  6e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  24.57 
 
 
529 aa  105  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  28.91 
 
 
535 aa  104  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2744  FAD dependent oxidoreductase  28.83 
 
 
535 aa  102  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294261  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3030  FAD dependent oxidoreductase  27.66 
 
 
551 aa  102  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.788741  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  26.63 
 
 
514 aa  101  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  24.72 
 
 
556 aa  97.8  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  26.44 
 
 
532 aa  97.4  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>