116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2257 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2257  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 
520 aa  1001    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1339  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  56.63 
 
 
523 aa  462  1e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.575389  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8148  FAD dependent oxidoreductase  53.32 
 
 
557 aa  462  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4868  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  55.45 
 
 
517 aa  464  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2146  FAD dependent oxidoreductase  51.94 
 
 
505 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.220753  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1160  FAD dependent oxidoreductase  56.4 
 
 
516 aa  456  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6398  amine oxidase  54.26 
 
 
504 aa  442  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5019  hypothetical protein  49.62 
 
 
516 aa  433  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.579081 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1434  FAD dependent oxidoreductase  53.33 
 
 
522 aa  424  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0674  phytoene dehydrogenase  50.19 
 
 
529 aa  415  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10916  oxidoreductase  49.03 
 
 
535 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1732  hypothetical protein  50.38 
 
 
520 aa  395  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0263  FAD dependent oxidoreductase  47.99 
 
 
513 aa  397  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4452  hypothetical protein  48.64 
 
 
499 aa  350  5e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.985838  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4539  hypothetical protein  48.64 
 
 
499 aa  350  5e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.773013  normal  0.693092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4834  hypothetical protein  48.64 
 
 
499 aa  350  5e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.18285 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  29.64 
 
 
547 aa  160  8e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  28.36 
 
 
518 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1978  FAD dependent oxidoreductase  31.94 
 
 
534 aa  150  7e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413393  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  30.6 
 
 
533 aa  150  7e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  28.34 
 
 
537 aa  147  6e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  27.95 
 
 
555 aa  144  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  31.08 
 
 
537 aa  144  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  29.5 
 
 
533 aa  143  7e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  28.33 
 
 
516 aa  142  1.9999999999999998e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.470789 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  29.91 
 
 
536 aa  137  5e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  30.44 
 
 
527 aa  136  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  30.26 
 
 
536 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1278  FAD dependent oxidoreductase  32.18 
 
 
523 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  30.04 
 
 
552 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  28.8 
 
 
549 aa  130  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  28.08 
 
 
539 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1331  FAD dependent oxidoreductase  31.93 
 
 
531 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  33.92 
 
 
532 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  33.75 
 
 
532 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  30.83 
 
 
535 aa  126  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3302  FAD dependent oxidoreductase  33.27 
 
 
532 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  30.13 
 
 
536 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2744  FAD dependent oxidoreductase  30.67 
 
 
535 aa  120  6e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294261  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2541  putative phytoene dehydrogenase  29.78 
 
 
530 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.553028 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1505  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 
527 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00846828  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  28.18 
 
 
530 aa  114  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0948  FAD dependent oxidoreductase  29.02 
 
 
536 aa  107  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  25.15 
 
 
530 aa  94  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2157  FAD dependent oxidoreductase  23.39 
 
 
430 aa  86.3  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0947  FAD dependent oxidoreductase  29.29 
 
 
532 aa  84.3  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  26.76 
 
 
510 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  22.7 
 
 
547 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  27.12 
 
 
514 aa  78.6  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2838  FAD dependent oxidoreductase  25.2 
 
 
531 aa  78.2  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3530  oxidoreductase  25.8 
 
 
531 aa  77.8  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  32.12 
 
 
530 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  32.12 
 
 
530 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2949  FAD dependent oxidoreductase  30.54 
 
 
517 aa  76.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3174  FAD dependent oxidoreductase  25.4 
 
 
531 aa  75.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.919135 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  32.12 
 
 
530 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  24.35 
 
 
554 aa  72.8  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  27.88 
 
 
528 aa  70.5  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  24.09 
 
 
559 aa  65.9  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  23.86 
 
 
554 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  30.07 
 
 
523 aa  65.1  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3290  amine oxidase  27.9 
 
 
545 aa  64.7  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  24.3 
 
 
527 aa  64.7  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  23.65 
 
 
556 aa  64.3  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  23.26 
 
 
565 aa  63.5  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1063  FAD dependent oxidoreductase  27.76 
 
 
545 aa  63.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164132  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  22.38 
 
 
563 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  22.92 
 
 
556 aa  60.1  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  24.95 
 
 
510 aa  56.2  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0345  hypothetical protein  23.32 
 
 
421 aa  56.2  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5076  FAD dependent oxidoreductase  27.3 
 
 
520 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1677  FAD dependent oxidoreductase  26.01 
 
 
519 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0988  FAD dependent oxidoreductase  26.33 
 
 
528 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4888  FAD dependent oxidoreductase  25.96 
 
 
520 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.162383 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  28 
 
 
531 aa  54.3  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1363  FAD dependent oxidoreductase  21.86 
 
 
420 aa  54.3  0.000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00915  CrtI1  22.7 
 
 
488 aa  53.9  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4505  FAD dependent oxidoreductase  25.35 
 
 
520 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4592  FAD dependent oxidoreductase  25.35 
 
 
520 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.593862 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  59.52 
 
 
522 aa  52.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  26.19 
 
 
510 aa  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  23.01 
 
 
561 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  29.9 
 
 
545 aa  52.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  28.92 
 
 
523 aa  52  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  29 
 
 
528 aa  51.6  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1935  FAD dependent oxidoreductase  28.01 
 
 
521 aa  51.2  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790128  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  25 
 
 
529 aa  50.4  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0956  amine oxidase  26.07 
 
 
434 aa  50.4  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618507  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1684  phytoene desaturase  29.04 
 
 
506 aa  50.4  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127101  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  26.16 
 
 
524 aa  48.9  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  24.91 
 
 
547 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0637  putative dehydrogenase  26.6 
 
 
548 aa  48.5  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0715988 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  29.33 
 
 
524 aa  48.5  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2574  amine oxidase  29.06 
 
 
455 aa  48.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.278816  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  27.55 
 
 
528 aa  48.1  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  22.04 
 
 
564 aa  47.8  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0553  FAD dependent oxidoreductase  27.73 
 
 
472 aa  47.8  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3030  FAD dependent oxidoreductase  54.35 
 
 
551 aa  47.8  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.788741  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  29.25 
 
 
533 aa  47.4  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3180  FAD dependent oxidoreductase  28.68 
 
 
478 aa  47.4  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.882146 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>