293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5076 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4505  FAD dependent oxidoreductase  79.92 
 
 
520 aa  863    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1677  FAD dependent oxidoreductase  89.6 
 
 
519 aa  965    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4592  FAD dependent oxidoreductase  79.92 
 
 
520 aa  863    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.593862 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0988  FAD dependent oxidoreductase  60.96 
 
 
528 aa  665    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5076  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
520 aa  1060    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13863  dehydrogenase  70.29 
 
 
536 aa  774    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4888  FAD dependent oxidoreductase  79.92 
 
 
520 aa  865    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.162383 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  30.77 
 
 
547 aa  192  1e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 
537 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  27.54 
 
 
555 aa  184  4.0000000000000006e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3530  oxidoreductase  28.94 
 
 
531 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  30.07 
 
 
552 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  27.48 
 
 
518 aa  179  1e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  29.68 
 
 
536 aa  177  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3174  FAD dependent oxidoreductase  28.78 
 
 
531 aa  177  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.919135 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  29.25 
 
 
536 aa  177  6e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2838  FAD dependent oxidoreductase  28.73 
 
 
531 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  28.13 
 
 
537 aa  174  2.9999999999999996e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  30.16 
 
 
527 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  28.62 
 
 
549 aa  174  5e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  29.8 
 
 
533 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2744  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 
535 aa  172  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294261  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  29.43 
 
 
535 aa  170  7e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2541  putative phytoene dehydrogenase  28.76 
 
 
530 aa  170  7e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.553028 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  28.25 
 
 
559 aa  169  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  28.25 
 
 
554 aa  168  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  27.6 
 
 
530 aa  167  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1978  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 
534 aa  166  6.9999999999999995e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413393  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  29.29 
 
 
533 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  28.2 
 
 
547 aa  162  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  26.49 
 
 
516 aa  159  1e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.470789 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  28.17 
 
 
554 aa  155  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0948  FAD dependent oxidoreductase  29.89 
 
 
536 aa  153  8.999999999999999e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  26.19 
 
 
564 aa  152  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  28.09 
 
 
530 aa  152  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0947  FAD dependent oxidoreductase  29.25 
 
 
532 aa  152  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  31.41 
 
 
539 aa  151  3e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  26.02 
 
 
565 aa  144  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  31.01 
 
 
536 aa  143  9e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  27.19 
 
 
556 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  25.4 
 
 
547 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 
563 aa  136  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  24.81 
 
 
556 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  26.57 
 
 
510 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  30.58 
 
 
532 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3302  FAD dependent oxidoreductase  30.3 
 
 
532 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  25.86 
 
 
514 aa  129  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  30.3 
 
 
532 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  26.34 
 
 
510 aa  126  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2949  FAD dependent oxidoreductase  27.12 
 
 
517 aa  124  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  26.07 
 
 
510 aa  122  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1278  FAD dependent oxidoreductase  26.29 
 
 
523 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  26.59 
 
 
528 aa  116  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  23.72 
 
 
533 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1505  FAD dependent oxidoreductase  27.43 
 
 
527 aa  114  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00846828  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3030  FAD dependent oxidoreductase  28.49 
 
 
551 aa  109  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.788741  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  30.13 
 
 
561 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1331  FAD dependent oxidoreductase  25.9 
 
 
531 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3290  amine oxidase  29.1 
 
 
545 aa  108  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  23.06 
 
 
512 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  22.85 
 
 
512 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1063  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 
545 aa  105  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164132  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  23.19 
 
 
506 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  22.61 
 
 
506 aa  103  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  24.24 
 
 
506 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  26.79 
 
 
531 aa  100  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1935  FAD dependent oxidoreductase  26.16 
 
 
521 aa  99.8  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790128  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1841  FAD dependent oxidoreductase  26.95 
 
 
512 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2659  beta-carotene ketolase  25.9 
 
 
526 aa  99  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03741  phytoene dehydrogenase  21.9 
 
 
509 aa  98.2  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2157  FAD dependent oxidoreductase  23.36 
 
 
430 aa  97.4  5e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 
531 aa  96.7  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  24.76 
 
 
505 aa  94.7  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  24.32 
 
 
522 aa  94.4  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  21.68 
 
 
532 aa  94.4  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  24.74 
 
 
515 aa  94.4  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  25.83 
 
 
508 aa  93.6  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3602  FAD dependent oxidoreductase  23.86 
 
 
497 aa  93.6  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  25.54 
 
 
508 aa  93.2  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  25.98 
 
 
498 aa  92.8  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  24.23 
 
 
503 aa  92  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 
530 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2512  FAD dependent oxidoreductase  23.64 
 
 
497 aa  91.3  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224928  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  23.16 
 
 
520 aa  90.9  5e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  24.4 
 
 
503 aa  90.1  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  24.64 
 
 
503 aa  88.6  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9210  CRTISO5 carotenoid isomerase 5,phytoene dehydrogenase-related protein  22.76 
 
 
530 aa  87.4  5e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4578  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 
512 aa  87  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  22.22 
 
 
520 aa  86.7  8e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  26.63 
 
 
470 aa  86.7  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  22.47 
 
 
516 aa  86.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  26.02 
 
 
530 aa  86.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  26.02 
 
 
530 aa  86.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  24.82 
 
 
535 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12111  hypothetical protein  22.58 
 
 
509 aa  85.1  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1069  FAD dependent oxidoreductase  25.24 
 
 
496 aa  84.7  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.302171  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  25.2 
 
 
527 aa  84.3  0.000000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  24.91 
 
 
523 aa  84.7  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2672  amine oxidase  24.78 
 
 
513 aa  83.6  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3577  zeta-phytoene desaturase  25.93 
 
 
504 aa  82.8  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557125  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>