251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0965 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
528 aa  1036    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  59.81 
 
 
526 aa  556  1e-157  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  49.9 
 
 
530 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  49.61 
 
 
530 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  49.61 
 
 
530 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  52.1 
 
 
545 aa  471  1.0000000000000001e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  49.81 
 
 
531 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  49.21 
 
 
560 aa  431  1e-119  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  47.7 
 
 
534 aa  420  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  49.21 
 
 
528 aa  415  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  47.9 
 
 
534 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4056  FAD dependent oxidoreductase  48.88 
 
 
580 aa  390  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1761  amine oxidase  50.1 
 
 
530 aa  389  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0378062  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  44.69 
 
 
524 aa  322  8e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2416  FAD dependent oxidoreductase  40.61 
 
 
487 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.28605  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3246  FAD dependent oxidoreductase  37.75 
 
 
515 aa  259  1e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  36.17 
 
 
474 aa  258  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  36.29 
 
 
470 aa  257  4e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  35.02 
 
 
474 aa  246  9e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4519  FAD dependent oxidoreductase  35.65 
 
 
506 aa  238  3e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  35.15 
 
 
472 aa  234  3e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0553  FAD dependent oxidoreductase  33.59 
 
 
472 aa  230  6e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0562  phytoene dehydrogenase  31.87 
 
 
476 aa  228  1e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0335  FAD dependent oxidoreductase  30.95 
 
 
476 aa  223  7e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000674369  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2084  FAD dependent oxidoreductase  32.76 
 
 
477 aa  223  8e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.424143 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1398  FAD dependent oxidoreductase  37.3 
 
 
469 aa  223  8e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.389386  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0239  FAD dependent oxidoreductase  38.87 
 
 
505 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.771217 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1663  phytoene dehydrogenase, putative  35.49 
 
 
465 aa  221  3e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.638198  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3691  FAD dependent oxidoreductase  36.38 
 
 
481 aa  217  2.9999999999999998e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128787  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0268  FAD dependent oxidoreductase  35.98 
 
 
466 aa  211  2e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  34.49 
 
 
523 aa  210  4e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2736  FAD dependent oxidoreductase  32.38 
 
 
484 aa  209  9e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118695  hitchhiker  0.0000199916 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0229  FAD dependent oxidoreductase  41.36 
 
 
474 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15580  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  35.78 
 
 
469 aa  206  6e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0617882  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  33.14 
 
 
523 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3180  FAD dependent oxidoreductase  30.98 
 
 
478 aa  205  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0240  FAD dependent oxidoreductase  41.13 
 
 
474 aa  204  5e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0251  FAD dependent oxidoreductase  41.91 
 
 
474 aa  203  5e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14190  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  37.6 
 
 
511 aa  202  9.999999999999999e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00208581  normal  0.0106814 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03260  putative dehydrogenase  28.43 
 
 
476 aa  201  3e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3794  FAD dependent oxidoreductase  35.05 
 
 
484 aa  199  7e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11461  dehydrogenase  32.57 
 
 
473 aa  199  7.999999999999999e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  27.76 
 
 
564 aa  195  2e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  27.74 
 
 
547 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17640  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  34.93 
 
 
499 aa  189  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.760158  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2860  FAD dependent oxidoreductase  33.07 
 
 
468 aa  187  4e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  28.33 
 
 
556 aa  187  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  27.41 
 
 
565 aa  186  6e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  28.68 
 
 
563 aa  186  7e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4109  FAD dependent oxidoreductase  33.65 
 
 
491 aa  183  7e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0668634  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  29 
 
 
533 aa  180  7e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31610  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  31.62 
 
 
503 aa  180  7e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.911892  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  31.02 
 
 
535 aa  177  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4153  putative dehydrogenase  31.18 
 
 
479 aa  176  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  30.37 
 
 
531 aa  173  7.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  29.5 
 
 
554 aa  169  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  30.65 
 
 
531 aa  167  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0214  FAD dependent oxidoreductase  33.9 
 
 
491 aa  167  5.9999999999999996e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.942451  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3920  putative dehydrogenase  32.44 
 
 
482 aa  164  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  29.15 
 
 
559 aa  164  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0818  dehydrogenase  30.77 
 
 
496 aa  163  8.000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.486977 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  27.52 
 
 
561 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26280  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  34.42 
 
 
477 aa  161  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2057  FAD dependent oxidoreductase  31.72 
 
 
487 aa  161  3e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.548507  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  28.44 
 
 
522 aa  160  8e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  28.78 
 
 
554 aa  159  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2127  hypothetical protein  31.72 
 
 
482 aa  159  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255916  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1889  hypothetical protein  31.49 
 
 
476 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247314  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13012  hypothetical protein  31.75 
 
 
480 aa  158  3e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0101829  normal  0.587267 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1909  hypothetical protein  31.3 
 
 
491 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1955  hypothetical protein  31.3 
 
 
491 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  27.2 
 
 
556 aa  156  7e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  28.9 
 
 
510 aa  154  5e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0805  dehydrogenase  31.52 
 
 
437 aa  146  8.000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4235  hypothetical protein  31.11 
 
 
482 aa  146  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0811417  normal  0.282669 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  30.02 
 
 
549 aa  145  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  30.81 
 
 
539 aa  145  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  30.2 
 
 
533 aa  143  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1063  FAD dependent oxidoreductase  31.05 
 
 
545 aa  142  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164132  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1978  FAD dependent oxidoreductase  30.2 
 
 
534 aa  140  7e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413393  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  28.05 
 
 
528 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  27.05 
 
 
547 aa  139  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  28.39 
 
 
530 aa  138  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  29.14 
 
 
514 aa  138  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  28.15 
 
 
537 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  30.42 
 
 
536 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  30.33 
 
 
536 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3530  oxidoreductase  30.95 
 
 
531 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  24.76 
 
 
524 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  27.95 
 
 
537 aa  131  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2838  FAD dependent oxidoreductase  30.59 
 
 
531 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  33.15 
 
 
536 aa  130  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  26.39 
 
 
555 aa  130  8.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  29.34 
 
 
533 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  32.23 
 
 
527 aa  129  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  28.2 
 
 
510 aa  129  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  29.69 
 
 
547 aa  127  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  30.22 
 
 
552 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3174  FAD dependent oxidoreductase  30.04 
 
 
531 aa  126  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.919135 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2541  putative phytoene dehydrogenase  29.45 
 
 
530 aa  124  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.553028 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>