168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1339 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1339  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 		 523 aa  1043    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.575389  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1160  FAD dependent oxidoreductase  59.19 
 
 		 516 aa  518  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2257  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  56.63 
 
 		 520 aa  510  1e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6398  amine oxidase  56.24 
 
 		 504 aa  504  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2146  FAD dependent oxidoreductase  54.3 
 
 		 505 aa  502  1e-141  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.220753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4868  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  55.83 
 
 		 517 aa  483  1e-135  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5019  hypothetical protein  52.76 
 
 		 516 aa  479  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579081 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8148  FAD dependent oxidoreductase  53.99 
 
 		 557 aa  481  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1434  FAD dependent oxidoreductase  54.1 
 
 		 522 aa  472  1e-132  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0263  FAD dependent oxidoreductase  51.53 
 
 		 513 aa  454  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0674  phytoene dehydrogenase  52.64 
 
 		 529 aa  451  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10916  oxidoreductase  51.69 
 
 		 535 aa  451  1e-125  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1732  hypothetical protein  51.42 
 
 		 520 aa  431  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4452  hypothetical protein  51.47 
 
 		 499 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.985838  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4539  hypothetical protein  51.47 
 
 		 499 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.773013  normal  0.693092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4834  hypothetical protein  51.47 
 
 		 499 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.18285 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1978  FAD dependent oxidoreductase  33 
 
 		 534 aa  165  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  29.27 
 
 		 555 aa  162  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  30.18 
 
 		 547 aa  158  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  28.67 
 
 		 537 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  32.18 
 
 		 536 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  32.79 
 
 		 536 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  27.52 
 
 		 518 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  28.62 
 
 		 537 aa  143  6e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  27.84 
 
 		 516 aa  143  7e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.470789 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  32.98 
 
 		 532 aa  143  8e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  32.98 
 
 		 532 aa  143  8e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  30.45 
 
 		 527 aa  139  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3302  FAD dependent oxidoreductase  32.62 
 
 		 532 aa  136  8e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2541  putative phytoene dehydrogenase  29.74 
 
 		 530 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.553028 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  29.51 
 
 		 533 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  31 
 
 		 552 aa  134  6e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1278  FAD dependent oxidoreductase  32.42 
 
 		 523 aa  130  6e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  30.34 
 
 		 535 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  30.09 
 
 		 536 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  29.08 
 
 		 549 aa  126  9e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1505  FAD dependent oxidoreductase  31.18 
 
 		 527 aa  124  4e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00846828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  28.34 
 
 		 533 aa  124  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1331  FAD dependent oxidoreductase  32.62 
 
 		 531 aa  124  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2744  FAD dependent oxidoreductase  30.63 
 
 		 535 aa  121  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294261  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  27.69 
 
 		 530 aa  120  6e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  28.11 
 
 		 539 aa  120  6e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2838  FAD dependent oxidoreductase  27.11 
 
 		 531 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0948  FAD dependent oxidoreductase  31.24 
 
 		 536 aa  115  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3174  FAD dependent oxidoreductase  26.85 
 
 		 531 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.919135 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  27.07 
 
 		 530 aa  110  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3530  oxidoreductase  26.65 
 
 		 531 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  29.25 
 
 		 528 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  25.36 
 
 		 554 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2949  FAD dependent oxidoreductase  28.8 
 
 		 517 aa  93.6  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  25.09 
 
 		 559 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2157  FAD dependent oxidoreductase  22.37 
 
 		 430 aa  89.7  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  25.27 
 
 		 556 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3290  amine oxidase  28.55 
 
 		 545 aa  88.2  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  25.81 
 
 		 554 aa  87.8  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  27.03 
 
 		 510 aa  87.4  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  26.77 
 
 		 510 aa  87  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  23.75 
 
 		 547 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  28.88 
 
 		 530 aa  85.1  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  24.22 
 
 		 563 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0947  FAD dependent oxidoreductase  26.7 
 
 		 532 aa  82.4  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 		 514 aa  82  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  32.31 
 
 		 530 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  32.31 
 
 		 530 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  24.01 
 
 		 556 aa  81.3  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  27.23 
 
 		 527 aa  79.7  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  29.74 
 
 		 523 aa  77.4  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  24.25 
 
 		 561 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  32.54 
 
 		 534 aa  76.6  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  24.04 
 
 		 547 aa  75.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  32.24 
 
 		 534 aa  73.6  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  28.12 
 
 		 529 aa  71.6  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0335  FAD dependent oxidoreductase  25.7 
 
 		 476 aa  71.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000674369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0637  putative dehydrogenase  28.01 
 
 		 548 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0715988 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  25.97 
 
 		 510 aa  68.6  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  29.44 
 
 		 531 aa  66.6  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  29.58 
 
 		 545 aa  65.9  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0562  phytoene dehydrogenase  24.95 
 
 		 476 aa  65.1  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  27.23 
 
 		 522 aa  64.3  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3030  FAD dependent oxidoreductase  26.61 
 
 		 551 aa  63.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.788741  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  24.29 
 
 		 565 aa  61.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  29.43 
 
 		 528 aa  60.8  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  25.81 
 
 		 470 aa  60.5  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  56.25 
 
 		 564 aa  59.7  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4888  FAD dependent oxidoreductase  24.24 
 
 		 520 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.162383 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0988  FAD dependent oxidoreductase  23.18 
 
 		 528 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0345  hypothetical protein  21.14 
 
 		 421 aa  58.9  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  32.67 
 
 		 526 aa  58.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2416  FAD dependent oxidoreductase  27.93 
 
 		 487 aa  57.8  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.28605  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1935  FAD dependent oxidoreductase  49.25 
 
 		 521 aa  57  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790128  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17640  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  29.01 
 
 		 499 aa  57  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.760158  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0345  phytoene dehydrogenase  21.9 
 
 		 509 aa  56.2  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1909  hypothetical protein  26.93 
 
 		 491 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210936  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4505  FAD dependent oxidoreductase  23.73 
 
 		 520 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1955  hypothetical protein  26.93 
 
 		 491 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4592  FAD dependent oxidoreductase  23.73 
 
 		 520 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.593862 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03701  phytoene dehydrogenase  22.3 
 
 		 509 aa  55.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640229  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  27.18 
 
 		 523 aa  55.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2736  FAD dependent oxidoreductase  26.18 
 
 		 484 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118695  hitchhiker  0.0000199916 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  32.84 
 
 		 523 aa  55.5  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>