172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_17640 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_17640  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  100 
 
 
499 aa  966    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.760158  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0818  dehydrogenase  61.35 
 
 
496 aa  569  1e-161  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.486977 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0214  FAD dependent oxidoreductase  62.5 
 
 
491 aa  535  1e-151  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.942451  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2057  FAD dependent oxidoreductase  58.81 
 
 
487 aa  525  1e-148  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.548507  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31610  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  58.4 
 
 
503 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.911892  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2127  hypothetical protein  54.4 
 
 
482 aa  458  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255916  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4235  hypothetical protein  53.99 
 
 
482 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0811417  normal  0.282669 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1909  hypothetical protein  53.07 
 
 
491 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1955  hypothetical protein  53.07 
 
 
491 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1889  hypothetical protein  52.66 
 
 
476 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247314  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13012  hypothetical protein  53.7 
 
 
480 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0101829  normal  0.587267 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4153  putative dehydrogenase  49.79 
 
 
479 aa  436  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3794  FAD dependent oxidoreductase  51.88 
 
 
484 aa  402  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3920  putative dehydrogenase  47.82 
 
 
482 aa  391  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3180  FAD dependent oxidoreductase  43.92 
 
 
478 aa  366  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0268  FAD dependent oxidoreductase  46.6 
 
 
466 aa  353  2.9999999999999997e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0335  FAD dependent oxidoreductase  40.12 
 
 
476 aa  351  2e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000674369  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11461  dehydrogenase  44.26 
 
 
473 aa  348  2e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  44.19 
 
 
470 aa  342  1e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2736  FAD dependent oxidoreductase  40.82 
 
 
484 aa  341  2e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118695  hitchhiker  0.0000199916 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  42.98 
 
 
472 aa  341  2e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2860  FAD dependent oxidoreductase  43.52 
 
 
468 aa  340  4e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3691  FAD dependent oxidoreductase  46.11 
 
 
481 aa  335  7.999999999999999e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128787  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2084  FAD dependent oxidoreductase  39.26 
 
 
477 aa  333  3e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.424143 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  41.81 
 
 
474 aa  330  3e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2416  FAD dependent oxidoreductase  45.68 
 
 
487 aa  327  3e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.28605  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  41.6 
 
 
474 aa  327  3e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4109  FAD dependent oxidoreductase  43.9 
 
 
491 aa  323  5e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0668634  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0214  FAD dependent oxidoreductase  62.37 
 
 
568 aa  322  9.000000000000001e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.646521  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1398  FAD dependent oxidoreductase  42.65 
 
 
469 aa  321  1.9999999999999998e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.389386  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0562  phytoene dehydrogenase  40 
 
 
476 aa  320  5e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4519  FAD dependent oxidoreductase  40.58 
 
 
506 aa  320  6e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15580  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  44.33 
 
 
469 aa  319  7.999999999999999e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0617882  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1663  phytoene dehydrogenase, putative  41.49 
 
 
465 aa  307  3e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.638198  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26280  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  45.7 
 
 
477 aa  302  1e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0229  FAD dependent oxidoreductase  47.48 
 
 
474 aa  296  7e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0553  FAD dependent oxidoreductase  38.57 
 
 
472 aa  295  1e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03260  putative dehydrogenase  34.45 
 
 
476 aa  294  3e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3246  FAD dependent oxidoreductase  40.47 
 
 
515 aa  293  5e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0239  FAD dependent oxidoreductase  43.61 
 
 
505 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.771217 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0240  FAD dependent oxidoreductase  46.84 
 
 
474 aa  279  1e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0251  FAD dependent oxidoreductase  47.05 
 
 
474 aa  273  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14190  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  43.01 
 
 
511 aa  272  1e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00208581  normal  0.0106814 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0805  dehydrogenase  41.12 
 
 
437 aa  252  9.000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  37.42 
 
 
524 aa  225  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  32.3 
 
 
530 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  31.72 
 
 
545 aa  181  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  32.06 
 
 
530 aa  179  8e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  33.14 
 
 
560 aa  179  8e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  32.06 
 
 
530 aa  179  8e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  32.27 
 
 
531 aa  176  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  33.8 
 
 
528 aa  176  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  32.46 
 
 
534 aa  161  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  31.51 
 
 
526 aa  159  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  34.51 
 
 
528 aa  157  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  33.27 
 
 
534 aa  155  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1761  amine oxidase  34.5 
 
 
530 aa  152  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0378062  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  27.05 
 
 
533 aa  123  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  30.11 
 
 
523 aa  121  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  27.15 
 
 
522 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  28.63 
 
 
510 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4056  FAD dependent oxidoreductase  30.66 
 
 
580 aa  109  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  26.99 
 
 
535 aa  108  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  27.41 
 
 
531 aa  107  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  27.81 
 
 
523 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  28.2 
 
 
528 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 
531 aa  95.1  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3290  amine oxidase  29.22 
 
 
545 aa  94.4  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  28.27 
 
 
523 aa  91.7  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  22.98 
 
 
547 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  26.34 
 
 
549 aa  87  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  27 
 
 
510 aa  86.3  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  25.14 
 
 
556 aa  85.1  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  25.97 
 
 
539 aa  84.3  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  25.28 
 
 
537 aa  84  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  25.27 
 
 
547 aa  83.6  0.000000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  27.72 
 
 
514 aa  83.2  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  26.84 
 
 
533 aa  82.8  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  21.98 
 
 
564 aa  82  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3030  FAD dependent oxidoreductase  28.17 
 
 
551 aa  82  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.788741  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  21.92 
 
 
563 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  22.92 
 
 
565 aa  79  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  24.13 
 
 
556 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  25.14 
 
 
554 aa  77.4  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  25.27 
 
 
554 aa  76.6  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2146  FAD dependent oxidoreductase  28.09 
 
 
505 aa  75.5  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.220753  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  25.23 
 
 
533 aa  75.9  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  22.12 
 
 
518 aa  75.1  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  23.35 
 
 
547 aa  74.7  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  22.31 
 
 
555 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  24.63 
 
 
559 aa  73.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  26.78 
 
 
527 aa  70.9  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0637  putative dehydrogenase  26.06 
 
 
548 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0715988 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  27.12 
 
 
535 aa  68.9  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  24.36 
 
 
561 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  26.07 
 
 
536 aa  68.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1978  FAD dependent oxidoreductase  25.56 
 
 
534 aa  68.6  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413393  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  24.3 
 
 
552 aa  66.6  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  26.44 
 
 
529 aa  66.6  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1063  FAD dependent oxidoreductase  28.16 
 
 
545 aa  65.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164132  normal  0.870572 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>