254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0789 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  83.08 
 
 		 472 aa  764    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  100 
 
 		 470 aa  939    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2416  FAD dependent oxidoreductase  60.13 
 
 		 487 aa  525  1e-148  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.28605  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  55.79 
 
 		 474 aa  523  1e-147  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  56.44 
 
 		 474 aa  524  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0335  FAD dependent oxidoreductase  52.46 
 
 		 476 aa  504  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000674369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2084  FAD dependent oxidoreductase  53.32 
 
 		 477 aa  503  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.424143 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0562  phytoene dehydrogenase  52.56 
 
 		 476 aa  493  9.999999999999999e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3180  FAD dependent oxidoreductase  52.89 
 
 		 478 aa  490  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2736  FAD dependent oxidoreductase  52.46 
 
 		 484 aa  489  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118695  hitchhiker  0.0000199916 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03260  putative dehydrogenase  46.24 
 
 		 476 aa  465  9.999999999999999e-131  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1663  phytoene dehydrogenase, putative  53.35 
 
 		 465 aa  467  9.999999999999999e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.638198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3246  FAD dependent oxidoreductase  52.11 
 
 		 515 aa  446  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4519  FAD dependent oxidoreductase  51.07 
 
 		 506 aa  435  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1398  FAD dependent oxidoreductase  53.76 
 
 		 469 aa  430  1e-119  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.389386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0239  FAD dependent oxidoreductase  55.36 
 
 		 505 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.771217 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0553  FAD dependent oxidoreductase  47 
 
 		 472 aa  426  1e-118  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4153  putative dehydrogenase  48.61 
 
 		 479 aa  422  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3691  FAD dependent oxidoreductase  50.64 
 
 		 481 aa  419  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3794  FAD dependent oxidoreductase  53.13 
 
 		 484 aa  414  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0229  FAD dependent oxidoreductase  57.63 
 
 		 474 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11461  dehydrogenase  47.32 
 
 		 473 aa  405  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0268  FAD dependent oxidoreductase  49.68 
 
 		 466 aa  399  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0240  FAD dependent oxidoreductase  57.57 
 
 		 474 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4109  FAD dependent oxidoreductase  49.47 
 
 		 491 aa  397  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0668634  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3920  putative dehydrogenase  49.89 
 
 		 482 aa  393  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0251  FAD dependent oxidoreductase  56.72 
 
 		 474 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14190  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  49.56 
 
 		 511 aa  382  1e-105  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00208581  normal  0.0106814 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2860  FAD dependent oxidoreductase  45.42 
 
 		 468 aa  380  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15580  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  48.18 
 
 		 469 aa  376  1e-103  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0617882  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0818  dehydrogenase  44.61 
 
 		 496 aa  373  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.486977 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31610  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  44.58 
 
 		 503 aa  360  3e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.911892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2057  FAD dependent oxidoreductase  43.13 
 
 		 487 aa  344  2e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.548507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  44.62 
 
 		 524 aa  342  9e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17640  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  44.19 
 
 		 499 aa  342  1e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.760158  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0214  FAD dependent oxidoreductase  43.22 
 
 		 491 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.942451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26280  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  45.82 
 
 		 477 aa  325  1e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2127  hypothetical protein  41.85 
 
 		 482 aa  316  5e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1909  hypothetical protein  41.33 
 
 		 491 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1955  hypothetical protein  41.33 
 
 		 491 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1889  hypothetical protein  41.33 
 
 		 476 aa  307  3e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247314  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13012  hypothetical protein  40.69 
 
 		 480 aa  298  2e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0101829  normal  0.587267 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4235  hypothetical protein  40.34 
 
 		 482 aa  295  1e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0811417  normal  0.282669 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  37.48 
 
 		 531 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  37.76 
 
 		 545 aa  267  2.9999999999999995e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0214  FAD dependent oxidoreductase  51.89 
 
 		 568 aa  261  2e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.646521  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0805  dehydrogenase  39.61 
 
 		 437 aa  258  1e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  38.98 
 
 		 534 aa  251  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  34.12 
 
 		 530 aa  246  6e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  36.06 
 
 		 526 aa  241  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  34.58 
 
 		 560 aa  237  3e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  34.12 
 
 		 530 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  34.12 
 
 		 530 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  37.76 
 
 		 534 aa  234  3e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  35.62 
 
 		 528 aa  219  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  34.83 
 
 		 528 aa  217  4e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4056  FAD dependent oxidoreductase  33.87 
 
 		 580 aa  203  6e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1761  amine oxidase  33.68 
 
 		 530 aa  179  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0378062  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  28.54 
 
 		 533 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  31.63 
 
 		 523 aa  162  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  29.09 
 
 		 523 aa  158  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  30.77 
 
 		 531 aa  154  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  30.34 
 
 		 531 aa  152  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  28.09 
 
 		 537 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  27.46 
 
 		 535 aa  137  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  30.1 
 
 		 510 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  28.52 
 
 		 527 aa  133  5e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  28.36 
 
 		 547 aa  132  9e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  28.3 
 
 		 559 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  28.9 
 
 		 554 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  26.86 
 
 		 528 aa  129  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  28.01 
 
 		 554 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  27.77 
 
 		 533 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  27.74 
 
 		 536 aa  124  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  27.31 
 
 		 556 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  26.92 
 
 		 522 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  28.54 
 
 		 510 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  27.82 
 
 		 552 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  27.66 
 
 		 536 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  28.22 
 
 		 530 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  25.32 
 
 		 563 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 		 547 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  25.9 
 
 		 555 aa  114  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  23.44 
 
 		 527 aa  114  5e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  24.22 
 
 		 565 aa  113  8.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  24.18 
 
 		 547 aa  113  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 		 514 aa  112  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  29.09 
 
 		 536 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  27.17 
 
 		 549 aa  111  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  23.96 
 
 		 556 aa  110  8.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  23.01 
 
 		 564 aa  109  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1063  FAD dependent oxidoreductase  27.69 
 
 		 545 aa  109  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164132  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  26.79 
 
 		 533 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  26.64 
 
 		 539 aa  108  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  28.07 
 
 		 535 aa  105  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  25.85 
 
 		 537 aa  106  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  24.81 
 
 		 524 aa  103  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0637  putative dehydrogenase  28.52 
 
 		 548 aa  101  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0715988 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  24.77 
 
 		 561 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1978  FAD dependent oxidoreductase  26.61 
 
 		 534 aa  100  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413393  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>