More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_3166 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  68.84 
 
 
537 aa  743    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
539 aa  1095    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  73.73 
 
 
533 aa  770    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  69.14 
 
 
549 aa  735    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  60.53 
 
 
547 aa  626  1e-178  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  60.38 
 
 
527 aa  620  1e-176  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  58.02 
 
 
533 aa  609  1e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  59.11 
 
 
536 aa  609  1e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  58.92 
 
 
536 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  59.55 
 
 
535 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  58.32 
 
 
537 aa  605  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  58.07 
 
 
552 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2744  FAD dependent oxidoreductase  59.37 
 
 
535 aa  592  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294261  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  42.13 
 
 
555 aa  412  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  44.89 
 
 
536 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  38.72 
 
 
518 aa  382  1e-104  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  41.83 
 
 
516 aa  380  1e-104  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.470789 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  44.53 
 
 
532 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  44.34 
 
 
532 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3302  FAD dependent oxidoreductase  43.96 
 
 
532 aa  353  5e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  40.93 
 
 
530 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1978  FAD dependent oxidoreductase  39.77 
 
 
534 aa  335  1e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413393  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2541  putative phytoene dehydrogenase  41.93 
 
 
530 aa  332  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.553028 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3530  oxidoreductase  39.96 
 
 
531 aa  312  1e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3174  FAD dependent oxidoreductase  39.59 
 
 
531 aa  309  6.999999999999999e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.919135 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2838  FAD dependent oxidoreductase  39.96 
 
 
531 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  34.02 
 
 
530 aa  294  2e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  34.9 
 
 
554 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  35.96 
 
 
554 aa  274  4.0000000000000004e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  35.58 
 
 
559 aa  266  5e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  32.9 
 
 
547 aa  248  1e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0948  FAD dependent oxidoreductase  33.71 
 
 
536 aa  248  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  32.37 
 
 
547 aa  244  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  32.62 
 
 
556 aa  239  1e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  33.15 
 
 
510 aa  221  3e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  30.62 
 
 
565 aa  219  8.999999999999998e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  29.32 
 
 
564 aa  219  1e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  30.13 
 
 
556 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  30.07 
 
 
561 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  29.17 
 
 
563 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  34.87 
 
 
514 aa  213  7e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  32.69 
 
 
528 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0947  FAD dependent oxidoreductase  32.56 
 
 
532 aa  210  6e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  35.96 
 
 
523 aa  210  7e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1331  FAD dependent oxidoreductase  32.07 
 
 
531 aa  203  8e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1278  FAD dependent oxidoreductase  33.09 
 
 
523 aa  200  7e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  31.39 
 
 
510 aa  199  9e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1505  FAD dependent oxidoreductase  32.35 
 
 
527 aa  191  2e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00846828  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3290  amine oxidase  33.87 
 
 
545 aa  181  4e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  30.41 
 
 
510 aa  174  3.9999999999999995e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  30.34 
 
 
531 aa  163  7e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  31.26 
 
 
530 aa  163  7e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  29.73 
 
 
533 aa  161  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0988  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 
528 aa  160  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13863  dehydrogenase  28.06 
 
 
536 aa  160  5e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2949  FAD dependent oxidoreductase  28.84 
 
 
517 aa  158  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  31.44 
 
 
530 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  31.44 
 
 
530 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3030  FAD dependent oxidoreductase  29.01 
 
 
551 aa  157  4e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.788741  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2157  FAD dependent oxidoreductase  26.97 
 
 
430 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  31.37 
 
 
545 aa  157  6e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2146  FAD dependent oxidoreductase  30.81 
 
 
505 aa  155  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.220753  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1063  FAD dependent oxidoreductase  29.56 
 
 
545 aa  153  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164132  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5076  FAD dependent oxidoreductase  31.41 
 
 
520 aa  150  5e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1677  FAD dependent oxidoreductase  30.81 
 
 
519 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  27.82 
 
 
527 aa  147  7.0000000000000006e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  29.05 
 
 
474 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  29.03 
 
 
474 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2659  beta-carotene ketolase  29.51 
 
 
526 aa  139  8.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  28.33 
 
 
523 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  27.87 
 
 
524 aa  138  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  29.64 
 
 
531 aa  135  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  29.76 
 
 
531 aa  134  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6398  amine oxidase  32.11 
 
 
504 aa  133  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4888  FAD dependent oxidoreductase  30.19 
 
 
520 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.162383 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  28.01 
 
 
526 aa  131  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2257  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.08 
 
 
520 aa  129  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  28.23 
 
 
529 aa  128  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  28.65 
 
 
535 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0553  FAD dependent oxidoreductase  27.95 
 
 
472 aa  127  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4505  FAD dependent oxidoreductase  29.65 
 
 
520 aa  127  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4592  FAD dependent oxidoreductase  29.65 
 
 
520 aa  127  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.593862 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3180  FAD dependent oxidoreductase  26.63 
 
 
478 aa  127  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  30.61 
 
 
524 aa  127  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  31.07 
 
 
528 aa  126  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  27.26 
 
 
522 aa  123  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  26.35 
 
 
523 aa  123  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  28.89 
 
 
560 aa  121  3e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  28.9 
 
 
528 aa  119  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2084  FAD dependent oxidoreductase  26.79 
 
 
477 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.424143 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0637  putative dehydrogenase  27.24 
 
 
548 aa  118  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0715988 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0562  phytoene dehydrogenase  26.01 
 
 
476 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  29.25 
 
 
534 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0263  FAD dependent oxidoreductase  27.41 
 
 
513 aa  113  8.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  28.52 
 
 
472 aa  113  9e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03260  putative dehydrogenase  25.23 
 
 
476 aa  112  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0335  FAD dependent oxidoreductase  25.41 
 
 
476 aa  110  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000674369  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  26.64 
 
 
470 aa  109  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1761  amine oxidase  31.53 
 
 
530 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0378062  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2416  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 
487 aa  108  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.28605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>