123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10916 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5019  hypothetical protein  66.28 
 
 		 516 aa  666    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579081 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10916  oxidoreductase  100 
 
 		 535 aa  1071    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1732  hypothetical protein  66.47 
 
 		 520 aa  624  1e-177  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4452  hypothetical protein  65.35 
 
 		 499 aa  590  1e-167  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.985838  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4539  hypothetical protein  65.35 
 
 		 499 aa  590  1e-167  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.773013  normal  0.693092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4834  hypothetical protein  65.35 
 
 		 499 aa  590  1e-167  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.18285 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0674  phytoene dehydrogenase  59.85 
 
 		 529 aa  553  1e-156  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2146  FAD dependent oxidoreductase  51.63 
 
 		 505 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.220753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6398  amine oxidase  53.15 
 
 		 504 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1160  FAD dependent oxidoreductase  49.91 
 
 		 516 aa  415  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4868  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  50.09 
 
 		 517 aa  411  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2257  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  49.62 
 
 		 520 aa  411  1e-113  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1339  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  51.12 
 
 		 523 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.575389  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8148  FAD dependent oxidoreductase  47.86 
 
 		 557 aa  404  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0263  FAD dependent oxidoreductase  47.89 
 
 		 513 aa  400  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1434  FAD dependent oxidoreductase  43 
 
 		 522 aa  342  9e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  31.64 
 
 		 536 aa  140  6e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1978  FAD dependent oxidoreductase  30.74 
 
 		 534 aa  139  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  28.14 
 
 		 547 aa  137  5e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  29.34 
 
 		 537 aa  133  9e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  27.98 
 
 		 555 aa  127  7e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  27.47 
 
 		 533 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1278  FAD dependent oxidoreductase  29.37 
 
 		 523 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1331  FAD dependent oxidoreductase  30.16 
 
 		 531 aa  120  7.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  32.03 
 
 		 532 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  27.69 
 
 		 527 aa  117  5e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  28.62 
 
 		 536 aa  117  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  32.03 
 
 		 532 aa  117  6e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  26.56 
 
 		 549 aa  116  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  29.54 
 
 		 552 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1505  FAD dependent oxidoreductase  30.31 
 
 		 527 aa  115  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00846828  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  24.91 
 
 		 518 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  28.72 
 
 		 536 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2541  putative phytoene dehydrogenase  27.98 
 
 		 530 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.553028 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  28.88 
 
 		 535 aa  110  7.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  26.85 
 
 		 533 aa  110  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3302  FAD dependent oxidoreductase  31.67 
 
 		 532 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  25.98 
 
 		 516 aa  109  1e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.470789 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2744  FAD dependent oxidoreductase  29.68 
 
 		 535 aa  103  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294261  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  24.64 
 
 		 539 aa  94.7  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  30.42 
 
 		 537 aa  92.8  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  25.66 
 
 		 530 aa  89  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  24.46 
 
 		 530 aa  87.4  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3174  FAD dependent oxidoreductase  25.7 
 
 		 531 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.919135 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3530  oxidoreductase  25.7 
 
 		 531 aa  84  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2838  FAD dependent oxidoreductase  26.09 
 
 		 531 aa  83.6  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0948  FAD dependent oxidoreductase  27.75 
 
 		 536 aa  80.5  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  23.58 
 
 		 554 aa  75.9  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  25.6 
 
 		 528 aa  67.4  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  22.97 
 
 		 556 aa  65.5  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0345  hypothetical protein  22.46 
 
 		 421 aa  62.8  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2157  FAD dependent oxidoreductase  43.66 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3290  amine oxidase  46.75 
 
 		 545 aa  59.3  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 514 aa  58.5  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4505  FAD dependent oxidoreductase  51.85 
 
 		 520 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4592  FAD dependent oxidoreductase  51.85 
 
 		 520 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.593862 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4888  FAD dependent oxidoreductase  51.85 
 
 		 520 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.162383 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1363  FAD dependent oxidoreductase  24.32 
 
 		 420 aa  57.8  0.0000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  52.83 
 
 		 510 aa  55.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5076  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 		 520 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  40.28 
 
 		 559 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0947  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 		 532 aa  55.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  26.99 
 
 		 530 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  40.28 
 
 		 554 aa  55.5  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2860  FAD dependent oxidoreductase  25.77 
 
 		 468 aa  55.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  51.06 
 
 		 547 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 		 547 aa  53.9  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  28.8 
 
 		 530 aa  53.9  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  28.8 
 
 		 530 aa  53.9  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1677  FAD dependent oxidoreductase  48.15 
 
 		 519 aa  53.5  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3030  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 		 551 aa  53.5  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.788741  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  58.14 
 
 		 561 aa  53.9  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2127  hypothetical protein  26.18 
 
 		 482 aa  53.5  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31610  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  25.72 
 
 		 503 aa  53.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.911892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0988  FAD dependent oxidoreductase  44.44 
 
 		 528 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  51.06 
 
 		 563 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  55.81 
 
 		 565 aa  52.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  55.81 
 
 		 564 aa  52.8  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0818  dehydrogenase  27.09 
 
 		 496 aa  52.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.486977 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1935  FAD dependent oxidoreductase  60.98 
 
 		 521 aa  52  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790128  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  62.79 
 
 		 510 aa  51.6  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3691  FAD dependent oxidoreductase  25.45 
 
 		 481 aa  50.8  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4235  hypothetical protein  25.32 
 
 		 482 aa  50.4  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0811417  normal  0.282669 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  25.53 
 
 		 523 aa  50.4  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 		 523 aa  50.1  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13863  dehydrogenase  43.4 
 
 		 536 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  59.46 
 
 		 529 aa  48.9  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  42.25 
 
 		 510 aa  48.9  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0637  putative dehydrogenase  62.5 
 
 		 548 aa  48.5  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0715988 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  56.76 
 
 		 527 aa  48.1  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17640  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  27.72 
 
 		 499 aa  48.5  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.760158  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2057  FAD dependent oxidoreductase  25.23 
 
 		 487 aa  48.5  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.548507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3148  amine oxidase  48.21 
 
 		 527 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0719859  normal  0.0908383 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1684  phytoene desaturase  46.97 
 
 		 506 aa  48.1  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127101  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  62.16 
 
 		 522 aa  47.8  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  26.48 
 
 		 470 aa  47.4  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13012  hypothetical protein  23.99 
 
 		 480 aa  47  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0101829  normal  0.587267 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  53.66 
 
 		 556 aa  47  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2284  hypothetical protein  46.67 
 
 		 436 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2659  beta-carotene ketolase  40 
 
 		 526 aa  46.6  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>