177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_31610 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_31610  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  100 
 
 		 503 aa  980    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.911892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0818  dehydrogenase  62.86 
 
 		 496 aa  585  1e-166  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.486977 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2057  FAD dependent oxidoreductase  61.15 
 
 		 487 aa  563  1.0000000000000001e-159  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.548507  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0214  FAD dependent oxidoreductase  64.73 
 
 		 491 aa  556  1e-157  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.942451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17640  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  58.4 
 
 		 499 aa  516  1.0000000000000001e-145  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.760158  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4153  putative dehydrogenase  54.13 
 
 		 479 aa  483  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2127  hypothetical protein  55.21 
 
 		 482 aa  472  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4235  hypothetical protein  54.19 
 
 		 482 aa  474  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0811417  normal  0.282669 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1909  hypothetical protein  53.56 
 
 		 491 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1955  hypothetical protein  53.56 
 
 		 491 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1889  hypothetical protein  53.37 
 
 		 476 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247314  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13012  hypothetical protein  52.34 
 
 		 480 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0101829  normal  0.587267 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3920  putative dehydrogenase  52.16 
 
 		 482 aa  434  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3794  FAD dependent oxidoreductase  55.17 
 
 		 484 aa  431  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2416  FAD dependent oxidoreductase  47.49 
 
 		 487 aa  379  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.28605  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11461  dehydrogenase  45.72 
 
 		 473 aa  377  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2736  FAD dependent oxidoreductase  42.71 
 
 		 484 aa  373  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118695  hitchhiker  0.0000199916 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0268  FAD dependent oxidoreductase  47.05 
 
 		 466 aa  369  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2084  FAD dependent oxidoreductase  43.24 
 
 		 477 aa  369  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.424143 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  44.83 
 
 		 472 aa  368  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3180  FAD dependent oxidoreductase  44.19 
 
 		 478 aa  363  4e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4519  FAD dependent oxidoreductase  44.65 
 
 		 506 aa  361  2e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  44.58 
 
 		 470 aa  360  3e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0335  FAD dependent oxidoreductase  40.33 
 
 		 476 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000674369  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2860  FAD dependent oxidoreductase  43.16 
 
 		 468 aa  355  6.999999999999999e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  43.66 
 
 		 474 aa  355  2e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  43.51 
 
 		 474 aa  353  5e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0214  FAD dependent oxidoreductase  66.05 
 
 		 568 aa  352  7e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.646521  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0562  phytoene dehydrogenase  41.96 
 
 		 476 aa  344  2e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03260  putative dehydrogenase  37.47 
 
 		 476 aa  338  9.999999999999999e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3246  FAD dependent oxidoreductase  44.01 
 
 		 515 aa  337  3.9999999999999995e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1663  phytoene dehydrogenase, putative  43.54 
 
 		 465 aa  337  3.9999999999999995e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.638198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26280  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  46.53 
 
 		 477 aa  332  1e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1398  FAD dependent oxidoreductase  43.54 
 
 		 469 aa  327  3e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.389386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4109  FAD dependent oxidoreductase  44.38 
 
 		 491 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0668634  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0239  FAD dependent oxidoreductase  46.88 
 
 		 505 aa  327  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.771217 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0229  FAD dependent oxidoreductase  48.02 
 
 		 474 aa  319  7.999999999999999e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3691  FAD dependent oxidoreductase  43.51 
 
 		 481 aa  316  5e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0553  FAD dependent oxidoreductase  39.46 
 
 		 472 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0240  FAD dependent oxidoreductase  48.54 
 
 		 474 aa  312  1e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0251  FAD dependent oxidoreductase  48.75 
 
 		 474 aa  309  8e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15580  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  42.23 
 
 		 469 aa  307  3e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0617882  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14190  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  43.09 
 
 		 511 aa  278  1e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00208581  normal  0.0106814 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  39.23 
 
 		 524 aa  252  9.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0805  dehydrogenase  39.33 
 
 		 437 aa  239  1e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  34.7 
 
 		 531 aa  213  9e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  33.46 
 
 		 530 aa  199  7e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  33.4 
 
 		 530 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  33.4 
 
 		 530 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  32.67 
 
 		 528 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  34.88 
 
 		 534 aa  182  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  32.87 
 
 		 545 aa  179  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  31.62 
 
 		 560 aa  177  3e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  34.47 
 
 		 534 aa  171  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  31.52 
 
 		 526 aa  168  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  31.31 
 
 		 528 aa  153  7e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1761  amine oxidase  32.43 
 
 		 530 aa  143  9e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0378062  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  29.14 
 
 		 523 aa  120  4.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  24.69 
 
 		 547 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  29.85 
 
 		 510 aa  117  5e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4056  FAD dependent oxidoreductase  29.03 
 
 		 580 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  27.93 
 
 		 535 aa  111  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  22.63 
 
 		 564 aa  106  8e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  26.35 
 
 		 554 aa  106  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  25.52 
 
 		 529 aa  106  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  24.43 
 
 		 563 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  26.57 
 
 		 522 aa  103  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  27.29 
 
 		 547 aa  103  6e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  24.36 
 
 		 565 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  29.68 
 
 		 514 aa  100  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 556 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  28.14 
 
 		 531 aa  99  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  24.54 
 
 		 533 aa  97.1  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  27.79 
 
 		 556 aa  95.9  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  27.27 
 
 		 510 aa  94.7  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  24.09 
 
 		 555 aa  92.4  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  26.57 
 
 		 554 aa  91.7  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  27.37 
 
 		 530 aa  90.9  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  27.82 
 
 		 536 aa  90.5  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3030  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 		 551 aa  88.6  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.788741  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  27.08 
 
 		 528 aa  86.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  27.29 
 
 		 523 aa  85.9  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  24.11 
 
 		 561 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  25.56 
 
 		 559 aa  83.2  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  27.97 
 
 		 536 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  24.35 
 
 		 530 aa  81.6  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  24.86 
 
 		 549 aa  81.6  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  26.54 
 
 		 527 aa  81.3  0.00000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0637  putative dehydrogenase  26.59 
 
 		 548 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0715988 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 		 523 aa  80.5  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1978  FAD dependent oxidoreductase  27.87 
 
 		 534 aa  80.5  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  26.41 
 
 		 537 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  27.73 
 
 		 535 aa  77.8  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  26.53 
 
 		 531 aa  77  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2744  FAD dependent oxidoreductase  27.06 
 
 		 535 aa  76.6  0.0000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294261  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  30.53 
 
 		 524 aa  76.6  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  26.1 
 
 		 547 aa  76.3  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 		 552 aa  74.7  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  26.38 
 
 		 533 aa  74.3  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  25.42 
 
 		 533 aa  74.7  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>