180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0229 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0251  FAD dependent oxidoreductase  93.25 
 
 
474 aa  689    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0240  FAD dependent oxidoreductase  93.46 
 
 
474 aa  702    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0229  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
474 aa  889    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0239  FAD dependent oxidoreductase  74.47 
 
 
505 aa  597  1e-169  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.771217 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2416  FAD dependent oxidoreductase  61.54 
 
 
487 aa  505  9.999999999999999e-143  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.28605  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  56.69 
 
 
474 aa  503  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  56.17 
 
 
474 aa  499  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2084  FAD dependent oxidoreductase  52.78 
 
 
477 aa  491  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.424143 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2736  FAD dependent oxidoreductase  53 
 
 
484 aa  491  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118695  hitchhiker  0.0000199916 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0335  FAD dependent oxidoreductase  50.64 
 
 
476 aa  484  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000674369  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  57.63 
 
 
470 aa  482  1e-135  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3180  FAD dependent oxidoreductase  51.48 
 
 
478 aa  472  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3246  FAD dependent oxidoreductase  57.86 
 
 
515 aa  468  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1663  phytoene dehydrogenase, putative  54.29 
 
 
465 aa  459  9.999999999999999e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.638198  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0562  phytoene dehydrogenase  49.79 
 
 
476 aa  460  9.999999999999999e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  57.42 
 
 
472 aa  459  9.999999999999999e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4519  FAD dependent oxidoreductase  52.23 
 
 
506 aa  448  1e-125  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03260  putative dehydrogenase  43.62 
 
 
476 aa  440  9.999999999999999e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2860  FAD dependent oxidoreductase  49.79 
 
 
468 aa  431  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3691  FAD dependent oxidoreductase  55.2 
 
 
481 aa  427  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128787  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0553  FAD dependent oxidoreductase  49.15 
 
 
472 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1398  FAD dependent oxidoreductase  54.08 
 
 
469 aa  412  1e-114  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.389386  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0268  FAD dependent oxidoreductase  50.11 
 
 
466 aa  410  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4153  putative dehydrogenase  48.61 
 
 
479 aa  406  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11461  dehydrogenase  47.32 
 
 
473 aa  404  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3920  putative dehydrogenase  49.68 
 
 
482 aa  394  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3794  FAD dependent oxidoreductase  52.04 
 
 
484 aa  387  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31610  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  48.02 
 
 
503 aa  380  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.911892  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26280  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  51.61 
 
 
477 aa  369  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2057  FAD dependent oxidoreductase  47.87 
 
 
487 aa  370  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.548507  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0818  dehydrogenase  47.26 
 
 
496 aa  365  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.486977 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15580  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  50 
 
 
469 aa  358  8e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0617882  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14190  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  50.21 
 
 
511 aa  357  1.9999999999999998e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00208581  normal  0.0106814 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17640  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  48.12 
 
 
499 aa  352  7e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.760158  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0214  FAD dependent oxidoreductase  45.89 
 
 
491 aa  335  1e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.942451  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4109  FAD dependent oxidoreductase  44.59 
 
 
491 aa  332  8e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0668634  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  47.11 
 
 
524 aa  332  1e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2127  hypothetical protein  46.04 
 
 
482 aa  331  1e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255916  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1909  hypothetical protein  44.23 
 
 
491 aa  323  4e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1955  hypothetical protein  44.23 
 
 
491 aa  323  4e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1889  hypothetical protein  44.02 
 
 
476 aa  322  7e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247314  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4235  hypothetical protein  44.33 
 
 
482 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0811417  normal  0.282669 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13012  hypothetical protein  43.8 
 
 
480 aa  311  1e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0101829  normal  0.587267 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  40.83 
 
 
531 aa  290  6e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  41.06 
 
 
545 aa  287  2e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  40.45 
 
 
534 aa  267  2e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  40.36 
 
 
528 aa  265  2e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0805  dehydrogenase  43.59 
 
 
437 aa  264  3e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  37.87 
 
 
526 aa  261  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  37.6 
 
 
560 aa  259  6e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  37.45 
 
 
530 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4056  FAD dependent oxidoreductase  41.12 
 
 
580 aa  249  6e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  40.04 
 
 
534 aa  248  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  36.84 
 
 
530 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  36.84 
 
 
530 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0214  FAD dependent oxidoreductase  49.63 
 
 
568 aa  245  9.999999999999999e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.646521  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  40.51 
 
 
528 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1761  amine oxidase  39.5 
 
 
530 aa  229  9e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0378062  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  35.45 
 
 
523 aa  191  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  30.39 
 
 
533 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  31.65 
 
 
523 aa  169  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  32.15 
 
 
531 aa  162  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  32.81 
 
 
531 aa  158  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  30.65 
 
 
522 aa  150  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  29.13 
 
 
535 aa  147  5e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  31.17 
 
 
536 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 
549 aa  143  6e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  30.97 
 
 
510 aa  141  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  32.22 
 
 
536 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  31.68 
 
 
552 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  25.46 
 
 
556 aa  136  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  26.69 
 
 
547 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  31.05 
 
 
539 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  32.46 
 
 
527 aa  133  6e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  30.58 
 
 
528 aa  133  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  28.05 
 
 
554 aa  133  7.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  26.15 
 
 
563 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  24.36 
 
 
564 aa  132  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  30.19 
 
 
533 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  25.18 
 
 
565 aa  131  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  30.67 
 
 
537 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  33.58 
 
 
536 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  31.97 
 
 
535 aa  126  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  31.54 
 
 
533 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  30.09 
 
 
547 aa  124  4e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  28.6 
 
 
554 aa  123  6e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  27.11 
 
 
561 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  30.11 
 
 
523 aa  120  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  27.05 
 
 
559 aa  117  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  28.49 
 
 
547 aa  117  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2744  FAD dependent oxidoreductase  32.1 
 
 
535 aa  117  6e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294261  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  27.07 
 
 
537 aa  115  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0637  putative dehydrogenase  29.49 
 
 
548 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0715988 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  30.31 
 
 
514 aa  115  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  26.45 
 
 
555 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3302  FAD dependent oxidoreductase  34.32 
 
 
532 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  29.98 
 
 
510 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  26.06 
 
 
524 aa  111  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  34.09 
 
 
532 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  34.09 
 
 
532 aa  110  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>