126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1889 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1909  hypothetical protein  99.37 
 
 		 491 aa  941    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1955  hypothetical protein  99.37 
 
 		 491 aa  941    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2127  hypothetical protein  73.74 
 
 		 482 aa  714    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1889  hypothetical protein  100 
 
 		 476 aa  944    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247314  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4235  hypothetical protein  72.06 
 
 		 482 aa  697    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0811417  normal  0.282669 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13012  hypothetical protein  69.41 
 
 		 480 aa  644    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0101829  normal  0.587267 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31610  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  53.37 
 
 		 503 aa  464  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.911892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2057  FAD dependent oxidoreductase  54.21 
 
 		 487 aa  462  1e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.548507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0818  dehydrogenase  52.86 
 
 		 496 aa  461  9.999999999999999e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.486977 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0214  FAD dependent oxidoreductase  53.85 
 
 		 491 aa  441  9.999999999999999e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.942451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17640  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  52.66 
 
 		 499 aa  441  9.999999999999999e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.760158  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4153  putative dehydrogenase  49.9 
 
 		 479 aa  424  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3920  putative dehydrogenase  49.28 
 
 		 482 aa  389  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3794  FAD dependent oxidoreductase  49.37 
 
 		 484 aa  379  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  43.71 
 
 		 474 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  43.92 
 
 		 474 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3246  FAD dependent oxidoreductase  44.07 
 
 		 515 aa  337  3.9999999999999995e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0335  FAD dependent oxidoreductase  39.62 
 
 		 476 aa  336  7e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000674369  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2860  FAD dependent oxidoreductase  40.86 
 
 		 468 aa  331  2e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2416  FAD dependent oxidoreductase  44.52 
 
 		 487 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.28605  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11461  dehydrogenase  41.16 
 
 		 473 aa  327  3e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3691  FAD dependent oxidoreductase  45.42 
 
 		 481 aa  325  9e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2736  FAD dependent oxidoreductase  40.59 
 
 		 484 aa  322  9.999999999999999e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118695  hitchhiker  0.0000199916 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4519  FAD dependent oxidoreductase  40.72 
 
 		 506 aa  321  1.9999999999999998e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3180  FAD dependent oxidoreductase  38.27 
 
 		 478 aa  315  9.999999999999999e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4109  FAD dependent oxidoreductase  43.74 
 
 		 491 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0668634  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2084  FAD dependent oxidoreductase  39.62 
 
 		 477 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.424143 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0268  FAD dependent oxidoreductase  43.32 
 
 		 466 aa  308  2.0000000000000002e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  41.33 
 
 		 470 aa  307  3e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1398  FAD dependent oxidoreductase  43.59 
 
 		 469 aa  305  1.0000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.389386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15580  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  43.35 
 
 		 469 aa  305  1.0000000000000001e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0617882  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0562  phytoene dehydrogenase  37.26 
 
 		 476 aa  303  6.000000000000001e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  39.7 
 
 		 472 aa  297  3e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03260  putative dehydrogenase  35.12 
 
 		 476 aa  294  2e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26280  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  42.83 
 
 		 477 aa  292  8e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0239  FAD dependent oxidoreductase  43.62 
 
 		 505 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.771217 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0214  FAD dependent oxidoreductase  54.61 
 
 		 568 aa  289  6e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.646521  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1663  phytoene dehydrogenase, putative  38.68 
 
 		 465 aa  284  3.0000000000000004e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.638198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0553  FAD dependent oxidoreductase  37.68 
 
 		 472 aa  276  7e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0229  FAD dependent oxidoreductase  44.02 
 
 		 474 aa  269  8.999999999999999e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14190  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  41.83 
 
 		 511 aa  264  2e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00208581  normal  0.0106814 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0240  FAD dependent oxidoreductase  44.44 
 
 		 474 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0251  FAD dependent oxidoreductase  44.23 
 
 		 474 aa  254  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0805  dehydrogenase  38.41 
 
 		 437 aa  227  3e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  35.92 
 
 		 524 aa  221  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  32.35 
 
 		 530 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  32.88 
 
 		 560 aa  184  4.0000000000000006e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  32.26 
 
 		 530 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  32.26 
 
 		 530 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  33.06 
 
 		 528 aa  174  2.9999999999999996e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  30.31 
 
 		 531 aa  155  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  32.33 
 
 		 534 aa  152  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  30.24 
 
 		 545 aa  143  6e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  32.66 
 
 		 534 aa  143  8e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  30.2 
 
 		 526 aa  134  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  31.2 
 
 		 528 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1761  amine oxidase  30.17 
 
 		 530 aa  117  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0378062  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4056  FAD dependent oxidoreductase  29.29 
 
 		 580 aa  114  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  27.24 
 
 		 522 aa  100  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  28.38 
 
 		 523 aa  98.6  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  25.42 
 
 		 533 aa  97.4  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  25.88 
 
 		 535 aa  95.9  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  25.92 
 
 		 554 aa  93.2  9e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  24.91 
 
 		 554 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  22.26 
 
 		 547 aa  89.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  26.69 
 
 		 523 aa  86.7  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  24.52 
 
 		 510 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  25.53 
 
 		 528 aa  84.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  26.21 
 
 		 510 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  22.68 
 
 		 556 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  24.24 
 
 		 559 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  25.88 
 
 		 514 aa  78.6  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  26.24 
 
 		 549 aa  78.6  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  29.5 
 
 		 547 aa  77.4  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  25.38 
 
 		 539 aa  77.4  0.0000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  22.54 
 
 		 524 aa  75.9  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  19.82 
 
 		 564 aa  72.4  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  28.03 
 
 		 556 aa  71.6  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  22.88 
 
 		 555 aa  70.5  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  27.27 
 
 		 529 aa  70.1  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  21.83 
 
 		 563 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  25.93 
 
 		 537 aa  69.3  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  25.09 
 
 		 547 aa  68.9  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  21.17 
 
 		 565 aa  65.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  24.62 
 
 		 523 aa  65.9  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  22.98 
 
 		 527 aa  65.1  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2146  FAD dependent oxidoreductase  25.68 
 
 		 505 aa  64.7  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.220753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  23.71 
 
 		 510 aa  63.2  0.000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  24.73 
 
 		 533 aa  63.2  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  24.8 
 
 		 531 aa  62.4  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0637  putative dehydrogenase  24.86 
 
 		 548 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0715988 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1160  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 		 516 aa  60.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  25.41 
 
 		 537 aa  60.5  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3030  FAD dependent oxidoreductase  30.94 
 
 		 551 aa  60.1  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.788741  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3302  FAD dependent oxidoreductase  27.51 
 
 		 532 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  24.16 
 
 		 533 aa  59.7  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  26.17 
 
 		 531 aa  58.9  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  29.79 
 
 		 536 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  28.27 
 
 		 532 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  32.43 
 
 		 561 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.839972 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>