128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0268 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0268  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
466 aa  920    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11461  dehydrogenase  59.02 
 
 
473 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2860  FAD dependent oxidoreductase  53.3 
 
 
468 aa  493  9.999999999999999e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26280  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  58 
 
 
477 aa  460  9.999999999999999e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2084  FAD dependent oxidoreductase  46.57 
 
 
477 aa  420  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.424143 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2416  FAD dependent oxidoreductase  53.35 
 
 
487 aa  416  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.28605  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2736  FAD dependent oxidoreductase  47.53 
 
 
484 aa  418  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118695  hitchhiker  0.0000199916 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  49.25 
 
 
474 aa  412  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3180  FAD dependent oxidoreductase  49.15 
 
 
478 aa  412  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  48.51 
 
 
474 aa  409  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0335  FAD dependent oxidoreductase  46.14 
 
 
476 aa  409  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000674369  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  49.68 
 
 
470 aa  399  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0562  phytoene dehydrogenase  45.51 
 
 
476 aa  397  1e-109  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3691  FAD dependent oxidoreductase  49.47 
 
 
481 aa  389  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128787  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4519  FAD dependent oxidoreductase  48.71 
 
 
506 aa  389  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  48.5 
 
 
472 aa  385  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0239  FAD dependent oxidoreductase  50.64 
 
 
505 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.771217 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4153  putative dehydrogenase  47.23 
 
 
479 aa  377  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3246  FAD dependent oxidoreductase  47.98 
 
 
515 aa  375  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31610  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  47.05 
 
 
503 aa  369  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.911892  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14190  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  51.37 
 
 
511 aa  369  1e-101  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00208581  normal  0.0106814 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1663  phytoene dehydrogenase, putative  44.99 
 
 
465 aa  368  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.638198  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03260  putative dehydrogenase  40.34 
 
 
476 aa  360  3e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15580  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  46.06 
 
 
469 aa  357  2.9999999999999997e-97  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0617882  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17640  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  46.6 
 
 
499 aa  353  2.9999999999999997e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.760158  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1398  FAD dependent oxidoreductase  46.45 
 
 
469 aa  352  1e-95  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.389386  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3920  putative dehydrogenase  46.91 
 
 
482 aa  350  4e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4109  FAD dependent oxidoreductase  46.27 
 
 
491 aa  345  8.999999999999999e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0668634  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0229  FAD dependent oxidoreductase  49.04 
 
 
474 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0251  FAD dependent oxidoreductase  49.89 
 
 
474 aa  341  2e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0553  FAD dependent oxidoreductase  41.76 
 
 
472 aa  340  4e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0240  FAD dependent oxidoreductase  49.68 
 
 
474 aa  340  4e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0818  dehydrogenase  41.95 
 
 
496 aa  335  9e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.486977 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3794  FAD dependent oxidoreductase  46.67 
 
 
484 aa  335  1e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2057  FAD dependent oxidoreductase  43.8 
 
 
487 aa  328  1.0000000000000001e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.548507  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2127  hypothetical protein  44.61 
 
 
482 aa  324  2e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255916  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0214  FAD dependent oxidoreductase  43.95 
 
 
491 aa  318  1e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.942451  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4235  hypothetical protein  43.01 
 
 
482 aa  316  7e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0811417  normal  0.282669 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0805  dehydrogenase  46.38 
 
 
437 aa  312  7.999999999999999e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1909  hypothetical protein  43.53 
 
 
491 aa  308  9e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1955  hypothetical protein  43.53 
 
 
491 aa  308  9e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1889  hypothetical protein  43.32 
 
 
476 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247314  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13012  hypothetical protein  41.94 
 
 
480 aa  301  2e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0101829  normal  0.587267 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  39.46 
 
 
524 aa  269  8.999999999999999e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  36.2 
 
 
531 aa  238  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0214  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 
568 aa  235  2.0000000000000002e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.646521  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  35.94 
 
 
545 aa  223  6e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  34.13 
 
 
560 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  32.94 
 
 
530 aa  209  7e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  34.99 
 
 
534 aa  206  9e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  32.47 
 
 
530 aa  203  7e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  32.47 
 
 
530 aa  203  7e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  34.54 
 
 
528 aa  196  7e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  34.19 
 
 
534 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  35.17 
 
 
528 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  33.6 
 
 
526 aa  179  8e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1761  amine oxidase  33.89 
 
 
530 aa  177  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0378062  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4056  FAD dependent oxidoreductase  31.85 
 
 
580 aa  162  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  28.35 
 
 
523 aa  132  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  27.59 
 
 
535 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  28.49 
 
 
528 aa  117  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  26.8 
 
 
522 aa  117  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  23.46 
 
 
547 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  29.37 
 
 
523 aa  104  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  26.84 
 
 
531 aa  103  9e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  25.52 
 
 
533 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  27.36 
 
 
523 aa  100  8e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 
531 aa  94.7  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  24.44 
 
 
556 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  26.51 
 
 
510 aa  92.8  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  25.85 
 
 
554 aa  92.8  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  26.18 
 
 
549 aa  84.7  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  25.05 
 
 
556 aa  84.7  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  26.29 
 
 
539 aa  83.6  0.000000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  22.86 
 
 
565 aa  80.9  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  22.41 
 
 
564 aa  80.1  0.00000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  23.9 
 
 
559 aa  80.1  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  24.18 
 
 
554 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2949  FAD dependent oxidoreductase  25.81 
 
 
517 aa  79  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  24.72 
 
 
537 aa  78.2  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  22.2 
 
 
529 aa  78.6  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  26.09 
 
 
555 aa  77.8  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  26.42 
 
 
510 aa  77.8  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  25.09 
 
 
533 aa  77.4  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  21.72 
 
 
563 aa  77.4  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  26.73 
 
 
514 aa  76.6  0.0000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1063  FAD dependent oxidoreductase  27.07 
 
 
545 aa  75.5  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164132  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  23.38 
 
 
561 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  26.91 
 
 
533 aa  73.9  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  26.2 
 
 
537 aa  73.6  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  31.03 
 
 
532 aa  73.2  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  32 
 
 
532 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1278  FAD dependent oxidoreductase  28.31 
 
 
523 aa  72.4  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  42.42 
 
 
527 aa  72.4  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  20.26 
 
 
518 aa  70.9  0.00000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  23.26 
 
 
516 aa  70.1  0.00000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.470789 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3302  FAD dependent oxidoreductase  33.14 
 
 
532 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  24.53 
 
 
547 aa  68.9  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  21.97 
 
 
530 aa  67.8  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3290  amine oxidase  26.74 
 
 
545 aa  67.4  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>