162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0818 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0818  dehydrogenase  100 
 
 
496 aa  979    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.486977 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31610  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  62.86 
 
 
503 aa  585  1e-166  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.911892  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17640  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  61.35 
 
 
499 aa  569  1e-161  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.760158  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0214  FAD dependent oxidoreductase  64.11 
 
 
491 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.942451  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2057  FAD dependent oxidoreductase  60 
 
 
487 aa  553  1e-156  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.548507  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4235  hypothetical protein  53.63 
 
 
482 aa  481  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0811417  normal  0.282669 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13012  hypothetical protein  56.15 
 
 
480 aa  481  1e-134  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0101829  normal  0.587267 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2127  hypothetical protein  54.23 
 
 
482 aa  477  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255916  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4153  putative dehydrogenase  52.38 
 
 
479 aa  470  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1909  hypothetical protein  53.27 
 
 
491 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1955  hypothetical protein  53.27 
 
 
491 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1889  hypothetical protein  52.86 
 
 
476 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247314  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3794  FAD dependent oxidoreductase  57.17 
 
 
484 aa  458  1e-127  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3920  putative dehydrogenase  50.31 
 
 
482 aa  433  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  44.61 
 
 
470 aa  373  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2736  FAD dependent oxidoreductase  41.82 
 
 
484 aa  353  4e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118695  hitchhiker  0.0000199916 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  43.34 
 
 
472 aa  352  1e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3180  FAD dependent oxidoreductase  41.41 
 
 
478 aa  351  2e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0214  FAD dependent oxidoreductase  68.75 
 
 
568 aa  348  1e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.646521  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11461  dehydrogenase  43.22 
 
 
473 aa  347  2e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2084  FAD dependent oxidoreductase  39.34 
 
 
477 aa  345  7e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.424143 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  41.2 
 
 
474 aa  343  4e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2416  FAD dependent oxidoreductase  43.64 
 
 
487 aa  343  5.999999999999999e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.28605  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0335  FAD dependent oxidoreductase  38.02 
 
 
476 aa  342  8e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000674369  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  41.6 
 
 
474 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4109  FAD dependent oxidoreductase  44.67 
 
 
491 aa  336  5e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0668634  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0268  FAD dependent oxidoreductase  41.95 
 
 
466 aa  335  1e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3246  FAD dependent oxidoreductase  42.75 
 
 
515 aa  329  8e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1663  phytoene dehydrogenase, putative  42.07 
 
 
465 aa  323  3e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.638198  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0562  phytoene dehydrogenase  38.81 
 
 
476 aa  324  3e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3691  FAD dependent oxidoreductase  44.3 
 
 
481 aa  322  9.999999999999999e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128787  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4519  FAD dependent oxidoreductase  40.37 
 
 
506 aa  322  9.999999999999999e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2860  FAD dependent oxidoreductase  39.75 
 
 
468 aa  320  3.9999999999999996e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03260  putative dehydrogenase  35.2 
 
 
476 aa  312  7.999999999999999e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0239  FAD dependent oxidoreductase  45.05 
 
 
505 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.771217 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0553  FAD dependent oxidoreductase  38.54 
 
 
472 aa  307  3e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0229  FAD dependent oxidoreductase  47.26 
 
 
474 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26280  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  44.28 
 
 
477 aa  300  5e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1398  FAD dependent oxidoreductase  39.79 
 
 
469 aa  298  1e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.389386  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0240  FAD dependent oxidoreductase  46.84 
 
 
474 aa  288  2e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0251  FAD dependent oxidoreductase  46.41 
 
 
474 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15580  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  40.51 
 
 
469 aa  275  2.0000000000000002e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0617882  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14190  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  41.99 
 
 
511 aa  273  4.0000000000000004e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00208581  normal  0.0106814 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  37.37 
 
 
524 aa  240  4e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0805  dehydrogenase  38.66 
 
 
437 aa  233  4.0000000000000004e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  32.36 
 
 
531 aa  193  5e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  32.23 
 
 
560 aa  168  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  30.26 
 
 
526 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  30.74 
 
 
545 aa  164  4.0000000000000004e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  30.66 
 
 
530 aa  163  7e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  30.44 
 
 
528 aa  162  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  30.16 
 
 
530 aa  159  9e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  30.16 
 
 
530 aa  159  9e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  30.58 
 
 
534 aa  155  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  30.57 
 
 
534 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  29.96 
 
 
528 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4056  FAD dependent oxidoreductase  28.6 
 
 
580 aa  130  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1761  amine oxidase  30.64 
 
 
530 aa  118  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0378062  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  26.92 
 
 
523 aa  108  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  26.06 
 
 
533 aa  104  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  25.89 
 
 
531 aa  96.7  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  25.38 
 
 
522 aa  94  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  25.87 
 
 
535 aa  92  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  21.6 
 
 
564 aa  89.7  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  26.44 
 
 
531 aa  89.7  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  27.12 
 
 
510 aa  87  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  24.72 
 
 
547 aa  87  8e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  24.43 
 
 
529 aa  86.7  8e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  22.67 
 
 
547 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  22.6 
 
 
563 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  26.4 
 
 
528 aa  84.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  25.52 
 
 
523 aa  84.3  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3290  amine oxidase  28.36 
 
 
545 aa  81.6  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  33.06 
 
 
523 aa  81.3  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  22.08 
 
 
565 aa  81.3  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  24.44 
 
 
556 aa  79.7  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  23.79 
 
 
555 aa  77.4  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  25.38 
 
 
554 aa  74.7  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  26.25 
 
 
510 aa  73.2  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0637  putative dehydrogenase  25.75 
 
 
548 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0715988 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  27.7 
 
 
536 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  24.62 
 
 
554 aa  71.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  24.66 
 
 
530 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  21.98 
 
 
556 aa  71.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  26.28 
 
 
527 aa  71.2  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  26.33 
 
 
552 aa  69.7  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  25.41 
 
 
536 aa  69.7  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  23.71 
 
 
559 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0948  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 
536 aa  68.9  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3030  FAD dependent oxidoreductase  26.13 
 
 
551 aa  68.6  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.788741  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1978  FAD dependent oxidoreductase  26.07 
 
 
534 aa  67.4  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413393  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  24.64 
 
 
549 aa  65.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  22.51 
 
 
527 aa  64.7  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  28.09 
 
 
524 aa  64.7  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  22.56 
 
 
561 aa  64.3  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0947  FAD dependent oxidoreductase  25.85 
 
 
532 aa  62.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  25.38 
 
 
510 aa  62.8  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2659  beta-carotene ketolase  25.19 
 
 
526 aa  58.5  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  31.07 
 
 
532 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  31.07 
 
 
532 aa  57.4  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>