151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3920 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_4153  putative dehydrogenase  71.28 
 
 
479 aa  700    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3920  putative dehydrogenase  100 
 
 
482 aa  966    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  52.44 
 
 
474 aa  457  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31610  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  52.16 
 
 
503 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.911892  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3794  FAD dependent oxidoreductase  56.17 
 
 
484 aa  448  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0818  dehydrogenase  50.31 
 
 
496 aa  451  1e-125  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.486977 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0214  FAD dependent oxidoreductase  52.62 
 
 
491 aa  448  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.942451  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  51.59 
 
 
474 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2057  FAD dependent oxidoreductase  50.52 
 
 
487 aa  429  1e-119  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.548507  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0335  FAD dependent oxidoreductase  46.32 
 
 
476 aa  412  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000674369  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  49.89 
 
 
470 aa  415  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17640  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  47.82 
 
 
499 aa  409  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.760158  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2084  FAD dependent oxidoreductase  46.95 
 
 
477 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.424143 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1909  hypothetical protein  49.28 
 
 
491 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1955  hypothetical protein  49.28 
 
 
491 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1889  hypothetical protein  49.28 
 
 
476 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247314  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2736  FAD dependent oxidoreductase  46.86 
 
 
484 aa  407  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118695  hitchhiker  0.0000199916 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  49.79 
 
 
472 aa  407  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2416  FAD dependent oxidoreductase  50.43 
 
 
487 aa  405  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.28605  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0562  phytoene dehydrogenase  47.02 
 
 
476 aa  402  1e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4235  hypothetical protein  49.27 
 
 
482 aa  394  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0811417  normal  0.282669 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3180  FAD dependent oxidoreductase  46.3 
 
 
478 aa  392  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2127  hypothetical protein  48.84 
 
 
482 aa  390  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255916  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3246  FAD dependent oxidoreductase  46.99 
 
 
515 aa  387  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13012  hypothetical protein  47.93 
 
 
480 aa  387  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0101829  normal  0.587267 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4109  FAD dependent oxidoreductase  48.1 
 
 
491 aa  371  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0668634  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0268  FAD dependent oxidoreductase  46.91 
 
 
466 aa  370  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1663  phytoene dehydrogenase, putative  44.87 
 
 
465 aa  366  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.638198  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3691  FAD dependent oxidoreductase  45.96 
 
 
481 aa  360  2e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128787  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03260  putative dehydrogenase  40.26 
 
 
476 aa  359  6e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0240  FAD dependent oxidoreductase  50.75 
 
 
474 aa  355  6.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0229  FAD dependent oxidoreductase  49.68 
 
 
474 aa  355  1e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0239  FAD dependent oxidoreductase  48.83 
 
 
505 aa  353  4e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.771217 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4519  FAD dependent oxidoreductase  44.07 
 
 
506 aa  349  6e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1398  FAD dependent oxidoreductase  45.11 
 
 
469 aa  346  4e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.389386  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2860  FAD dependent oxidoreductase  42.16 
 
 
468 aa  345  2e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0251  FAD dependent oxidoreductase  49.68 
 
 
474 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0553  FAD dependent oxidoreductase  40.08 
 
 
472 aa  333  4e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11461  dehydrogenase  41.67 
 
 
473 aa  332  1e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14190  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  45.55 
 
 
511 aa  311  2e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00208581  normal  0.0106814 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15580  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  42.52 
 
 
469 aa  306  5.0000000000000004e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0617882  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26280  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  42.55 
 
 
477 aa  294  2e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0214  FAD dependent oxidoreductase  53.26 
 
 
568 aa  284  3.0000000000000004e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.646521  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  40.91 
 
 
524 aa  273  5.000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0805  dehydrogenase  36.67 
 
 
437 aa  226  8e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  33.6 
 
 
531 aa  188  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  32.48 
 
 
560 aa  186  9e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  31.93 
 
 
545 aa  183  7e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  31.76 
 
 
530 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  31.27 
 
 
530 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  31.27 
 
 
530 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 
526 aa  171  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  33.13 
 
 
528 aa  168  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  31.3 
 
 
534 aa  168  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4056  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
580 aa  167  5e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1761  amine oxidase  33.74 
 
 
530 aa  160  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0378062  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  31.58 
 
 
534 aa  155  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  32.05 
 
 
528 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  27.27 
 
 
535 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  30.02 
 
 
510 aa  134  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  26.43 
 
 
533 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  24.72 
 
 
547 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  28.05 
 
 
522 aa  127  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  29.36 
 
 
531 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  28.71 
 
 
510 aa  116  7.999999999999999e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  26.17 
 
 
556 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 
531 aa  115  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  25.89 
 
 
555 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  27.1 
 
 
528 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  27.02 
 
 
533 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  29.78 
 
 
530 aa  113  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  26.92 
 
 
539 aa  111  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  23.7 
 
 
564 aa  110  4.0000000000000004e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  27.07 
 
 
536 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  23.66 
 
 
565 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  27.29 
 
 
523 aa  108  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  27.75 
 
 
552 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  27.48 
 
 
536 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  24.81 
 
 
561 aa  107  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  25.97 
 
 
547 aa  106  8e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  23.48 
 
 
563 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  27.43 
 
 
535 aa  105  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  27.46 
 
 
533 aa  104  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  27.67 
 
 
523 aa  101  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  27 
 
 
537 aa  100  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  27.59 
 
 
514 aa  99.8  9e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2744  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 
535 aa  99.4  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294261  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  30.77 
 
 
529 aa  99  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  24.55 
 
 
527 aa  96.7  9e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  24.95 
 
 
518 aa  95.9  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  25.33 
 
 
549 aa  95.9  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3030  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 
551 aa  95.5  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.788741  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  26.3 
 
 
523 aa  95.5  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  24.53 
 
 
554 aa  93.6  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  25.79 
 
 
554 aa  93.6  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  24.72 
 
 
559 aa  90.5  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  28 
 
 
536 aa  90.9  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  29.04 
 
 
527 aa  89.7  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  24.91 
 
 
556 aa  88.6  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  25.14 
 
 
537 aa  85.5  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>