223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0335 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0335  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 476 aa  981    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000674369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2736  FAD dependent oxidoreductase  64.06 
 
 		 484 aa  634    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118695  hitchhiker  0.0000199916 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2084  FAD dependent oxidoreductase  67.3 
 
 		 477 aa  701    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.424143 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0562  phytoene dehydrogenase  64.33 
 
 		 476 aa  631  1e-180  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3180  FAD dependent oxidoreductase  61.65 
 
 		 478 aa  619  1e-176  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  54.39 
 
 		 474 aa  531  1e-150  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  53.75 
 
 		 474 aa  526  1e-148  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2416  FAD dependent oxidoreductase  54.29 
 
 		 487 aa  509  1e-143  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.28605  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  52.46 
 
 		 470 aa  504  9.999999999999999e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03260  putative dehydrogenase  49.79 
 
 		 476 aa  496  1e-139  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  52.03 
 
 		 472 aa  490  1e-137  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1663  phytoene dehydrogenase, putative  48.92 
 
 		 465 aa  445  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.638198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0239  FAD dependent oxidoreductase  50.53 
 
 		 505 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.771217 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4519  FAD dependent oxidoreductase  46.01 
 
 		 506 aa  439  9.999999999999999e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3246  FAD dependent oxidoreductase  47.4 
 
 		 515 aa  436  1e-121  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0553  FAD dependent oxidoreductase  44.47 
 
 		 472 aa  422  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11461  dehydrogenase  45.04 
 
 		 473 aa  423  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0229  FAD dependent oxidoreductase  50.43 
 
 		 474 aa  418  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3794  FAD dependent oxidoreductase  46.38 
 
 		 484 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0268  FAD dependent oxidoreductase  46.14 
 
 		 466 aa  409  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0240  FAD dependent oxidoreductase  51.28 
 
 		 474 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4153  putative dehydrogenase  43.55 
 
 		 479 aa  412  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0251  FAD dependent oxidoreductase  50.53 
 
 		 474 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1398  FAD dependent oxidoreductase  46.9 
 
 		 469 aa  407  1.0000000000000001e-112  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.389386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4109  FAD dependent oxidoreductase  46.56 
 
 		 491 aa  403  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0668634  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3920  putative dehydrogenase  46.32 
 
 		 482 aa  396  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3691  FAD dependent oxidoreductase  43.74 
 
 		 481 aa  391  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128787  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2860  FAD dependent oxidoreductase  42.67 
 
 		 468 aa  389  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31610  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  40.33 
 
 		 503 aa  358  9.999999999999999e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.911892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17640  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  40.12 
 
 		 499 aa  351  2e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.760158  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26280  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  45.26 
 
 		 477 aa  349  7e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0818  dehydrogenase  38.02 
 
 		 496 aa  342  8e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.486977 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14190  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  42.62 
 
 		 511 aa  340  2.9999999999999998e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00208581  normal  0.0106814 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2127  hypothetical protein  39.87 
 
 		 482 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2057  FAD dependent oxidoreductase  39.5 
 
 		 487 aa  337  2.9999999999999997e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.548507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1889  hypothetical protein  39.62 
 
 		 476 aa  336  7e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247314  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1909  hypothetical protein  39.62 
 
 		 491 aa  335  9e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1955  hypothetical protein  39.62 
 
 		 491 aa  335  9e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15580  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  40.56 
 
 		 469 aa  326  5e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0617882  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0214  FAD dependent oxidoreductase  38.33 
 
 		 491 aa  325  8.000000000000001e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.942451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4235  hypothetical protein  38.75 
 
 		 482 aa  323  3e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0811417  normal  0.282669 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  38.6 
 
 		 524 aa  313  2.9999999999999996e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13012  hypothetical protein  36.23 
 
 		 480 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0101829  normal  0.587267 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0805  dehydrogenase  36.46 
 
 		 437 aa  243  6e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0214  FAD dependent oxidoreductase  41.91 
 
 		 568 aa  239  5.999999999999999e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.646521  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  33.6 
 
 		 545 aa  236  7e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  33.01 
 
 		 530 aa  233  5e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  31.89 
 
 		 531 aa  232  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  32.61 
 
 		 530 aa  227  3e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  32.61 
 
 		 530 aa  227  3e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  31.3 
 
 		 534 aa  212  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  30.89 
 
 		 526 aa  203  6e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  30.08 
 
 		 560 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  31.71 
 
 		 534 aa  199  7e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  31.58 
 
 		 528 aa  197  5.000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1761  amine oxidase  32.78 
 
 		 530 aa  194  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0378062  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  30.65 
 
 		 528 aa  189  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4056  FAD dependent oxidoreductase  30.57 
 
 		 580 aa  182  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  27.88 
 
 		 528 aa  156  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  26.4 
 
 		 523 aa  143  8e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  26.06 
 
 		 547 aa  142  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  26.18 
 
 		 535 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  27.26 
 
 		 522 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  29.54 
 
 		 510 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  26.15 
 
 		 565 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  24.66 
 
 		 533 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  26.23 
 
 		 556 aa  126  8.000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  26.83 
 
 		 555 aa  126  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  27.46 
 
 		 531 aa  123  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  24.86 
 
 		 564 aa  123  8e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  24.42 
 
 		 524 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  25.05 
 
 		 556 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  28.54 
 
 		 547 aa  121  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  25.64 
 
 		 523 aa  120  7e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  24.76 
 
 		 554 aa  120  7e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  23.79 
 
 		 563 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  25.81 
 
 		 523 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  26.31 
 
 		 533 aa  117  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  26.02 
 
 		 531 aa  116  6.9999999999999995e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  26.03 
 
 		 549 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  25.41 
 
 		 530 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  27.34 
 
 		 547 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  25.28 
 
 		 537 aa  115  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  23.37 
 
 		 527 aa  114  3e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  25.84 
 
 		 537 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  25.74 
 
 		 527 aa  106  7e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  27.95 
 
 		 535 aa  106  8e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  25.41 
 
 		 539 aa  106  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  26.59 
 
 		 536 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  25.58 
 
 		 514 aa  104  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  27.07 
 
 		 552 aa  104  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  26.32 
 
 		 533 aa  104  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  25.59 
 
 		 510 aa  103  7e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  26.87 
 
 		 536 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  25.89 
 
 		 536 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  24.77 
 
 		 561 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  23.69 
 
 		 529 aa  100  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2744  FAD dependent oxidoreductase  26.48 
 
 		 535 aa  97.1  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294261  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  24.21 
 
 		 530 aa  94.7  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  30.19 
 
 		 554 aa  94  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.975068 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>