More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3691 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
526 aa  1042    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  59.53 
 
 
528 aa  546  1e-154  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  51.29 
 
 
545 aa  486  1e-136  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  50.87 
 
 
531 aa  481  1e-134  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  50.95 
 
 
530 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  50.76 
 
 
530 aa  463  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  50.76 
 
 
530 aa  463  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  49.11 
 
 
534 aa  460  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  50.3 
 
 
560 aa  457  1e-127  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4056  FAD dependent oxidoreductase  52.94 
 
 
580 aa  440  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  48.91 
 
 
534 aa  431  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  49.22 
 
 
528 aa  421  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1761  amine oxidase  49.49 
 
 
530 aa  406  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0378062  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  41.03 
 
 
524 aa  308  2.0000000000000002e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2416  FAD dependent oxidoreductase  36.7 
 
 
487 aa  273  6e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.28605  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  37.07 
 
 
470 aa  269  8.999999999999999e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3246  FAD dependent oxidoreductase  36.66 
 
 
515 aa  256  7e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  35.98 
 
 
472 aa  253  6e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4519  FAD dependent oxidoreductase  35.21 
 
 
506 aa  248  1e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  32.89 
 
 
474 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  33.08 
 
 
474 aa  244  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0562  phytoene dehydrogenase  33.08 
 
 
476 aa  241  2e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03260  putative dehydrogenase  29.92 
 
 
476 aa  237  3e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0553  FAD dependent oxidoreductase  33.79 
 
 
472 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3691  FAD dependent oxidoreductase  36.19 
 
 
481 aa  234  2.0000000000000002e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128787  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0335  FAD dependent oxidoreductase  31.4 
 
 
476 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000674369  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  35.32 
 
 
523 aa  233  6e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0229  FAD dependent oxidoreductase  38.08 
 
 
474 aa  233  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0239  FAD dependent oxidoreductase  36.77 
 
 
505 aa  232  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.771217 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1398  FAD dependent oxidoreductase  37.21 
 
 
469 aa  229  7e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.389386  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  30.83 
 
 
533 aa  229  8e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0251  FAD dependent oxidoreductase  38.34 
 
 
474 aa  229  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1663  phytoene dehydrogenase, putative  33.79 
 
 
465 aa  227  4e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.638198  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0240  FAD dependent oxidoreductase  38.03 
 
 
474 aa  224  3e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3180  FAD dependent oxidoreductase  30.56 
 
 
478 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  32.06 
 
 
535 aa  219  7.999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  32.88 
 
 
523 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2084  FAD dependent oxidoreductase  30.12 
 
 
477 aa  211  3e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.424143 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11461  dehydrogenase  32.49 
 
 
473 aa  209  9e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0268  FAD dependent oxidoreductase  34.24 
 
 
466 aa  207  4e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2860  FAD dependent oxidoreductase  31.9 
 
 
468 aa  203  6e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15580  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  33.9 
 
 
469 aa  202  9.999999999999999e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0617882  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2736  FAD dependent oxidoreductase  29.96 
 
 
484 aa  201  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118695  hitchhiker  0.0000199916 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14190  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  36.02 
 
 
511 aa  201  3.9999999999999996e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00208581  normal  0.0106814 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  29.15 
 
 
556 aa  200  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  30.23 
 
 
522 aa  194  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  26.62 
 
 
564 aa  194  4e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  31.07 
 
 
554 aa  191  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  28.66 
 
 
531 aa  189  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3794  FAD dependent oxidoreductase  33.27 
 
 
484 aa  186  7e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  29.64 
 
 
559 aa  186  7e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  29.16 
 
 
554 aa  186  8e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2057  FAD dependent oxidoreductase  31.14 
 
 
487 aa  186  9e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.548507  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  30.65 
 
 
531 aa  184  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  26.31 
 
 
565 aa  183  9.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31610  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  31.89 
 
 
503 aa  182  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.911892  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4153  putative dehydrogenase  31.07 
 
 
479 aa  182  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4109  FAD dependent oxidoreductase  31.61 
 
 
491 aa  181  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0668634  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  26.97 
 
 
547 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0214  FAD dependent oxidoreductase  31.85 
 
 
491 aa  179  9e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.942451  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17640  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  32 
 
 
499 aa  179  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.760158  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  29.98 
 
 
510 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0818  dehydrogenase  30.58 
 
 
496 aa  173  6.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.486977 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  29.08 
 
 
556 aa  172  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3920  putative dehydrogenase  33.2 
 
 
482 aa  172  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13012  hypothetical protein  30.93 
 
 
480 aa  171  3e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0101829  normal  0.587267 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  25.92 
 
 
563 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26280  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  32.63 
 
 
477 aa  167  4e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  28.63 
 
 
528 aa  166  9e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  28.62 
 
 
561 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  29.19 
 
 
547 aa  162  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0805  dehydrogenase  31.07 
 
 
437 aa  161  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4235  hypothetical protein  30.67 
 
 
482 aa  162  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0811417  normal  0.282669 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  26.39 
 
 
524 aa  160  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2127  hypothetical protein  30.71 
 
 
482 aa  157  6e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255916  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1889  hypothetical protein  30.34 
 
 
476 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247314  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  27.62 
 
 
529 aa  152  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  28.18 
 
 
530 aa  150  5e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1909  hypothetical protein  30.34 
 
 
491 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1955  hypothetical protein  30.34 
 
 
491 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  29.62 
 
 
514 aa  146  7.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  28.49 
 
 
510 aa  145  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3302  FAD dependent oxidoreductase  30.4 
 
 
532 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  30.09 
 
 
532 aa  141  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  30.09 
 
 
532 aa  141  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  29.31 
 
 
536 aa  141  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  28.86 
 
 
533 aa  137  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 
539 aa  136  9e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1978  FAD dependent oxidoreductase  27.98 
 
 
534 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413393  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  30.22 
 
 
533 aa  133  6.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 
552 aa  131  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  28.98 
 
 
510 aa  130  5.0000000000000004e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  27.31 
 
 
537 aa  130  6e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2541  putative phytoene dehydrogenase  28.18 
 
 
530 aa  130  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.553028 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  23.88 
 
 
555 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0947  FAD dependent oxidoreductase  26.96 
 
 
532 aa  128  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1063  FAD dependent oxidoreductase  29.3 
 
 
545 aa  126  9e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164132  normal  0.870572 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  24.39 
 
 
518 aa  125  2e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  28.36 
 
 
536 aa  124  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  25.46 
 
 
516 aa  122  9.999999999999999e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.470789 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>