272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0947 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0947  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
532 aa  1041    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  36.74 
 
 
555 aa  326  6e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  33.65 
 
 
530 aa  268  2e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  37.36 
 
 
536 aa  250  4e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  33.77 
 
 
547 aa  240  4e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  35.57 
 
 
532 aa  230  5e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  35.57 
 
 
532 aa  230  5e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  34.26 
 
 
527 aa  227  4e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  33.7 
 
 
533 aa  227  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  30.7 
 
 
537 aa  221  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  32.91 
 
 
536 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  33.4 
 
 
536 aa  220  5e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2541  putative phytoene dehydrogenase  32.96 
 
 
530 aa  219  7e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.553028 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  33.09 
 
 
539 aa  218  2e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  33.39 
 
 
552 aa  217  5e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  32.9 
 
 
537 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3302  FAD dependent oxidoreductase  35.2 
 
 
532 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  32.72 
 
 
535 aa  214  3.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  32.45 
 
 
530 aa  213  7e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2744  FAD dependent oxidoreductase  33.27 
 
 
535 aa  212  1e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294261  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  33.09 
 
 
533 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2838  FAD dependent oxidoreductase  31.38 
 
 
531 aa  210  5e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3530  oxidoreductase  31.13 
 
 
531 aa  208  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  31.43 
 
 
549 aa  208  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 
556 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  28.44 
 
 
564 aa  206  6e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3174  FAD dependent oxidoreductase  30.75 
 
 
531 aa  206  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.919135 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  29.4 
 
 
565 aa  203  5e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1978  FAD dependent oxidoreductase  30.11 
 
 
534 aa  198  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413393  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0948  FAD dependent oxidoreductase  33.96 
 
 
536 aa  196  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  29.07 
 
 
547 aa  196  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  28.71 
 
 
518 aa  193  7e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  29.68 
 
 
554 aa  193  8e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  30.73 
 
 
516 aa  192  1e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.470789 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  29.94 
 
 
559 aa  191  4e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  28.55 
 
 
563 aa  187  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  28.78 
 
 
556 aa  179  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  28.44 
 
 
561 aa  178  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  29.1 
 
 
554 aa  176  9e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  28.7 
 
 
547 aa  164  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  31.41 
 
 
510 aa  158  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5076  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 
520 aa  158  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  30.8 
 
 
528 aa  153  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  30.35 
 
 
514 aa  145  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1677  FAD dependent oxidoreductase  27.62 
 
 
519 aa  145  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4888  FAD dependent oxidoreductase  28.44 
 
 
520 aa  143  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.162383 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  29.14 
 
 
510 aa  142  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4505  FAD dependent oxidoreductase  28.44 
 
 
520 aa  141  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4592  FAD dependent oxidoreductase  28.44 
 
 
520 aa  141  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.593862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  27.12 
 
 
524 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13863  dehydrogenase  28.1 
 
 
536 aa  136  9e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 
533 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  25.24 
 
 
527 aa  133  6.999999999999999e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  29 
 
 
530 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  30.24 
 
 
531 aa  131  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  28.3 
 
 
530 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  28.3 
 
 
530 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0988  FAD dependent oxidoreductase  28.21 
 
 
528 aa  128  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  29.21 
 
 
510 aa  126  8.000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  29.24 
 
 
523 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 
531 aa  124  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  28.82 
 
 
534 aa  124  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  30.22 
 
 
523 aa  124  5e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  29.09 
 
 
545 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1278  FAD dependent oxidoreductase  29.69 
 
 
523 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 
534 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  26.15 
 
 
526 aa  117  6e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3290  amine oxidase  30.27 
 
 
545 aa  114  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  27.94 
 
 
531 aa  112  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  28.26 
 
 
529 aa  112  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1331  FAD dependent oxidoreductase  29.51 
 
 
531 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1063  FAD dependent oxidoreductase  29 
 
 
545 aa  109  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164132  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  28.27 
 
 
528 aa  108  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3030  FAD dependent oxidoreductase  27.84 
 
 
551 aa  108  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.788741  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  25.89 
 
 
522 aa  107  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4056  FAD dependent oxidoreductase  29.33 
 
 
580 aa  107  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  28.14 
 
 
560 aa  107  6e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  27.82 
 
 
528 aa  107  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  28.81 
 
 
472 aa  107  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  28.11 
 
 
535 aa  106  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1505  FAD dependent oxidoreductase  29.17 
 
 
527 aa  105  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00846828  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0637  putative dehydrogenase  26.43 
 
 
548 aa  103  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0715988 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1935  FAD dependent oxidoreductase  27.54 
 
 
521 aa  102  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790128  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  28.89 
 
 
470 aa  100  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4519  FAD dependent oxidoreductase  28.54 
 
 
506 aa  99.4  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2659  beta-carotene ketolase  28.52 
 
 
526 aa  95.5  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  28.94 
 
 
474 aa  95.5  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2949  FAD dependent oxidoreductase  27.73 
 
 
517 aa  95.1  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3794  FAD dependent oxidoreductase  34.68 
 
 
484 aa  94.4  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  28.44 
 
 
474 aa  93.2  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3691  FAD dependent oxidoreductase  28.47 
 
 
481 aa  92  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128787  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2352  FAD dependent oxidoreductase  24.19 
 
 
495 aa  89  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.125181  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2257  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.24 
 
 
520 aa  88.2  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  28.71 
 
 
524 aa  85.5  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1160  FAD dependent oxidoreductase  28.73 
 
 
516 aa  85.5  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3180  FAD dependent oxidoreductase  24.72 
 
 
478 aa  84.7  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6398  amine oxidase  28.11 
 
 
504 aa  84.3  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2146  FAD dependent oxidoreductase  27.57 
 
 
505 aa  84  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.220753  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0263  FAD dependent oxidoreductase  25.46 
 
 
513 aa  80.1  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  24.12 
 
 
506 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>