More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0381 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  100 
 
 		 510 aa  1017    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  73.23 
 
 		 510 aa  752    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  69.61 
 
 		 514 aa  714    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  58.8 
 
 		 510 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  44.47 
 
 		 554 aa  404  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  43.83 
 
 		 547 aa  403  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  41.6 
 
 		 559 aa  386  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  41.98 
 
 		 554 aa  384  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3290  amine oxidase  42.37 
 
 		 545 aa  331  2e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2659  beta-carotene ketolase  42.47 
 
 		 526 aa  325  1e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3030  FAD dependent oxidoreductase  40.23 
 
 		 551 aa  305  1.0000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.788741  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  34.16 
 
 		 556 aa  300  3e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  34.26 
 
 		 547 aa  277  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  32.9 
 
 		 564 aa  262  1e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  33.52 
 
 		 561 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  33.09 
 
 		 565 aa  251  3e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  33.4 
 
 		 556 aa  246  9e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  31.8 
 
 		 563 aa  234  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  33.71 
 
 		 516 aa  229  1e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.470789 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  31.74 
 
 		 518 aa  222  9.999999999999999e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  29.83 
 
 		 555 aa  207  4e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  30.9 
 
 		 533 aa  196  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3530  oxidoreductase  32.39 
 
 		 531 aa  190  5e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  31.07 
 
 		 530 aa  188  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3174  FAD dependent oxidoreductase  32.01 
 
 		 531 aa  186  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.919135 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2838  FAD dependent oxidoreductase  32.39 
 
 		 531 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  32.28 
 
 		 532 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  32.28 
 
 		 532 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  30.6 
 
 		 539 aa  179  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  32.08 
 
 		 535 aa  178  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  29.24 
 
 		 549 aa  177  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  29.24 
 
 		 537 aa  177  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  30.21 
 
 		 529 aa  175  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  33.4 
 
 		 536 aa  173  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  29.52 
 
 		 547 aa  171  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  29.91 
 
 		 552 aa  170  5e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1063  FAD dependent oxidoreductase  30.41 
 
 		 545 aa  169  9e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164132  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2541  putative phytoene dehydrogenase  30.55 
 
 		 530 aa  169  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.553028 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  31.53 
 
 		 530 aa  169  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  30.21 
 
 		 533 aa  169  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  29.94 
 
 		 527 aa  167  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2744  FAD dependent oxidoreductase  31.72 
 
 		 535 aa  167  5e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294261  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  27.55 
 
 		 537 aa  164  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  29.16 
 
 		 536 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3302  FAD dependent oxidoreductase  31.6 
 
 		 532 aa  164  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  28.95 
 
 		 536 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  32.16 
 
 		 523 aa  159  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  29.29 
 
 		 524 aa  155  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  31.01 
 
 		 531 aa  153  8e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  29.71 
 
 		 530 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2949  FAD dependent oxidoreductase  30.81 
 
 		 517 aa  151  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1978  FAD dependent oxidoreductase  28.54 
 
 		 534 aa  150  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  29.47 
 
 		 530 aa  149  9e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  29.47 
 
 		 530 aa  149  9e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4888  FAD dependent oxidoreductase  29.52 
 
 		 520 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.162383 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  30.55 
 
 		 528 aa  137  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4505  FAD dependent oxidoreductase  28.78 
 
 		 520 aa  137  5e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4592  FAD dependent oxidoreductase  28.78 
 
 		 520 aa  137  5e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.593862 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1677  FAD dependent oxidoreductase  27.76 
 
 		 519 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  27.43 
 
 		 527 aa  132  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5076  FAD dependent oxidoreductase  26.72 
 
 		 520 aa  130  8.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1810  phytoene dehydrogenase family protein  22.92 
 
 		 499 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.149228  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0948  FAD dependent oxidoreductase  29.12 
 
 		 536 aa  122  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0947  FAD dependent oxidoreductase  28.71 
 
 		 532 aa  121  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  29.89 
 
 		 523 aa  120  4.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  28.68 
 
 		 560 aa  120  6e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  26.37 
 
 		 512 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  26.37 
 
 		 512 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  29.53 
 
 		 528 aa  117  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  26.08 
 
 		 506 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  29.75 
 
 		 507 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  27.79 
 
 		 526 aa  114  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  26.35 
 
 		 493 aa  114  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3577  zeta-phytoene desaturase  27.7 
 
 		 504 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557125  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2742  phytoene desaturase  25.79 
 
 		 553 aa  112  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  28.24 
 
 		 528 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2211  phytoene desaturase  28.12 
 
 		 531 aa  110  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  0.130578 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  26.77 
 
 		 533 aa  110  8.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13863  dehydrogenase  26.37 
 
 		 536 aa  109  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5197  phytoene desaturase  28.79 
 
 		 525 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0988  FAD dependent oxidoreductase  26.33 
 
 		 528 aa  107  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3691  FAD dependent oxidoreductase  28.93 
 
 		 481 aa  107  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1024  phytoene dehydrogenase-related protein  27.29 
 
 		 518 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1935  FAD dependent oxidoreductase  31.83 
 
 		 521 aa  107  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790128  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2416  FAD dependent oxidoreductase  28.85 
 
 		 487 aa  106  9e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.28605  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1712  phytoene desaturase  27.47 
 
 		 504 aa  106  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678565  normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1585  zeta-phytoene desaturase  27.81 
 
 		 492 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  28.4 
 
 		 534 aa  105  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  24.72 
 
 		 506 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0637  putative dehydrogenase  27.05 
 
 		 548 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0715988 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5075  amine oxidase  29.28 
 
 		 512 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  27.63 
 
 		 545 aa  105  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  26.27 
 
 		 532 aa  105  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5163  phytoene dehydrogenase-related protein  29.28 
 
 		 512 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  27.8 
 
 		 474 aa  105  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  27.15 
 
 		 511 aa  104  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1619  phytoene dehydrogenase-related protein  26.44 
 
 		 508 aa  104  5e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  25.92 
 
 		 503 aa  103  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1069  FAD dependent oxidoreductase  26.44 
 
 		 496 aa  103  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.302171  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  27.07 
 
 		 515 aa  103  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>