186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2084 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0562  phytoene dehydrogenase  65.53 
 
 
476 aa  639    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0335  FAD dependent oxidoreductase  67.3 
 
 
476 aa  701    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000674369  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2084  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
477 aa  978    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.424143 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2736  FAD dependent oxidoreductase  68.13 
 
 
484 aa  673    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118695  hitchhiker  0.0000199916 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3180  FAD dependent oxidoreductase  61.84 
 
 
478 aa  622  1e-177  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  58.67 
 
 
474 aa  550  1e-155  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  57.78 
 
 
474 aa  543  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2416  FAD dependent oxidoreductase  56.03 
 
 
487 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.28605  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  53.32 
 
 
470 aa  503  1e-141  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03260  putative dehydrogenase  50.74 
 
 
476 aa  498  1e-139  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  54.06 
 
 
472 aa  488  1e-137  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0239  FAD dependent oxidoreductase  53.4 
 
 
505 aa  464  1e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.771217 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1663  phytoene dehydrogenase, putative  51.5 
 
 
465 aa  451  1e-125  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.638198  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4519  FAD dependent oxidoreductase  48.95 
 
 
506 aa  447  1.0000000000000001e-124  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0229  FAD dependent oxidoreductase  52.56 
 
 
474 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0553  FAD dependent oxidoreductase  45.86 
 
 
472 aa  422  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0268  FAD dependent oxidoreductase  46.57 
 
 
466 aa  420  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11461  dehydrogenase  45.26 
 
 
473 aa  419  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3246  FAD dependent oxidoreductase  46.41 
 
 
515 aa  418  9.999999999999999e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0251  FAD dependent oxidoreductase  52.99 
 
 
474 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0240  FAD dependent oxidoreductase  52.99 
 
 
474 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2860  FAD dependent oxidoreductase  44.73 
 
 
468 aa  412  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4153  putative dehydrogenase  45.57 
 
 
479 aa  413  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3691  FAD dependent oxidoreductase  45.65 
 
 
481 aa  404  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128787  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3794  FAD dependent oxidoreductase  46.48 
 
 
484 aa  396  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1398  FAD dependent oxidoreductase  46.14 
 
 
469 aa  394  1e-108  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.389386  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3920  putative dehydrogenase  46.95 
 
 
482 aa  391  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4109  FAD dependent oxidoreductase  43.55 
 
 
491 aa  374  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0668634  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26280  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  46.07 
 
 
477 aa  370  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31610  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  43.24 
 
 
503 aa  369  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.911892  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14190  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  43.86 
 
 
511 aa  352  7e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00208581  normal  0.0106814 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2057  FAD dependent oxidoreductase  40.79 
 
 
487 aa  349  8e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.548507  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0818  dehydrogenase  39.34 
 
 
496 aa  345  7e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.486977 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0214  FAD dependent oxidoreductase  40.75 
 
 
491 aa  339  5e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.942451  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15580  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  43.35 
 
 
469 aa  339  5.9999999999999996e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0617882  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17640  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  39.26 
 
 
499 aa  333  3e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.760158  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  41.46 
 
 
524 aa  330  2e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13012  hypothetical protein  39.66 
 
 
480 aa  324  2e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0101829  normal  0.587267 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2127  hypothetical protein  38.88 
 
 
482 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255916  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1889  hypothetical protein  39.62 
 
 
476 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247314  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1909  hypothetical protein  39.71 
 
 
491 aa  313  4.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1955  hypothetical protein  39.71 
 
 
491 aa  313  4.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4235  hypothetical protein  39.09 
 
 
482 aa  310  4e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0811417  normal  0.282669 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0214  FAD dependent oxidoreductase  44.12 
 
 
568 aa  255  2.0000000000000002e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.646521  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0805  dehydrogenase  36.38 
 
 
437 aa  248  2e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  33.2 
 
 
531 aa  241  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  30.99 
 
 
530 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  33.74 
 
 
545 aa  220  5e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  30.77 
 
 
530 aa  216  7e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  30.77 
 
 
530 aa  216  7e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  32.15 
 
 
560 aa  208  2e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  30.57 
 
 
534 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  31.46 
 
 
528 aa  191  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  31.45 
 
 
528 aa  190  4e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  29.78 
 
 
526 aa  189  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1761  amine oxidase  30.83 
 
 
530 aa  182  9.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0378062  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  30.16 
 
 
534 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4056  FAD dependent oxidoreductase  30.3 
 
 
580 aa  175  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  27.06 
 
 
523 aa  147  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  27.85 
 
 
528 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  25.24 
 
 
535 aa  137  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  26.01 
 
 
522 aa  134  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  26.2 
 
 
533 aa  131  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  28.25 
 
 
531 aa  130  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  27.42 
 
 
531 aa  129  8.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  29.01 
 
 
510 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  25.14 
 
 
547 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  27.42 
 
 
527 aa  125  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 
523 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  27.86 
 
 
530 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  25.14 
 
 
565 aa  116  7.999999999999999e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  24.08 
 
 
537 aa  115  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  23.36 
 
 
564 aa  113  7.000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  25.28 
 
 
537 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  25.46 
 
 
549 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  25.28 
 
 
547 aa  112  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  26.26 
 
 
533 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  25.52 
 
 
523 aa  111  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  26.91 
 
 
547 aa  110  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  23.94 
 
 
556 aa  109  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  26.79 
 
 
539 aa  109  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  23.62 
 
 
563 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  23.4 
 
 
524 aa  107  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  27.37 
 
 
535 aa  106  9e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  23.81 
 
 
554 aa  106  9e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  24.29 
 
 
559 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  24.36 
 
 
561 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  24.11 
 
 
530 aa  103  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  25.09 
 
 
555 aa  103  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  25.88 
 
 
536 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  25.73 
 
 
533 aa  103  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2744  FAD dependent oxidoreductase  26.68 
 
 
535 aa  101  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294261  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  22.73 
 
 
527 aa  100  7e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  25.42 
 
 
536 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  25.52 
 
 
529 aa  98.6  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  25.38 
 
 
536 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  24.35 
 
 
556 aa  95.9  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  24.34 
 
 
514 aa  91.7  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1063  FAD dependent oxidoreductase  26.58 
 
 
545 aa  89.7  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164132  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  25 
 
 
510 aa  89  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>