More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1960 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
523 aa  1029    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  41.87 
 
 
523 aa  327  3e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  40.26 
 
 
535 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  37.38 
 
 
522 aa  305  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  39.06 
 
 
531 aa  298  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  41.7 
 
 
531 aa  297  2e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  37.62 
 
 
533 aa  290  6e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  36.43 
 
 
531 aa  246  6e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  35.24 
 
 
545 aa  240  5.999999999999999e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  37.92 
 
 
527 aa  227  5.0000000000000005e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  36.45 
 
 
534 aa  225  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  34.31 
 
 
554 aa  224  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  34 
 
 
559 aa  220  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  35.23 
 
 
526 aa  219  8.999999999999998e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  33.39 
 
 
547 aa  217  2.9999999999999998e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  33.89 
 
 
549 aa  217  5e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  35.45 
 
 
533 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  36.67 
 
 
534 aa  211  3e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  34.11 
 
 
560 aa  210  5e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  31.84 
 
 
554 aa  209  7e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  35.66 
 
 
536 aa  204  3e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  36.51 
 
 
524 aa  204  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4056  FAD dependent oxidoreductase  37.05 
 
 
580 aa  204  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  35.96 
 
 
539 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  31.91 
 
 
530 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  31.91 
 
 
530 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  31.91 
 
 
530 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  30.67 
 
 
537 aa  196  7e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  33.27 
 
 
537 aa  196  9e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1761  amine oxidase  35.69 
 
 
530 aa  192  9e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0378062  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  34.58 
 
 
536 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  28.81 
 
 
555 aa  191  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  35.05 
 
 
535 aa  190  5e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  28.49 
 
 
547 aa  190  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  33.46 
 
 
533 aa  189  9e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  27.64 
 
 
564 aa  187  3e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  34.45 
 
 
552 aa  186  6e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  34.51 
 
 
532 aa  186  7e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  33.14 
 
 
528 aa  186  7e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3302  FAD dependent oxidoreductase  34.26 
 
 
532 aa  186  9e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  34.44 
 
 
528 aa  186  9e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  34.07 
 
 
532 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  33.64 
 
 
536 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2744  FAD dependent oxidoreductase  34.81 
 
 
535 aa  182  9.000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294261  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  27.83 
 
 
565 aa  182  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  29.3 
 
 
563 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  32.58 
 
 
528 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  28.94 
 
 
556 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  29.83 
 
 
524 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2416  FAD dependent oxidoreductase  33.59 
 
 
487 aa  173  5.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.28605  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  28.99 
 
 
561 aa  170  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4519  FAD dependent oxidoreductase  30.38 
 
 
506 aa  168  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  30.48 
 
 
547 aa  167  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2541  putative phytoene dehydrogenase  31.29 
 
 
530 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.553028 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2838  FAD dependent oxidoreductase  31.02 
 
 
531 aa  163  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  31.63 
 
 
470 aa  162  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1978  FAD dependent oxidoreductase  30.23 
 
 
534 aa  162  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413393  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  29.66 
 
 
530 aa  162  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  32.14 
 
 
514 aa  161  3e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  28.08 
 
 
529 aa  160  5e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  25.86 
 
 
527 aa  159  1e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  30.23 
 
 
474 aa  159  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  29.47 
 
 
474 aa  158  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  30.74 
 
 
530 aa  157  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0239  FAD dependent oxidoreductase  35.09 
 
 
505 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.771217 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3530  oxidoreductase  30.64 
 
 
531 aa  157  6e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3174  FAD dependent oxidoreductase  30.45 
 
 
531 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.919135 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1663  phytoene dehydrogenase, putative  29.38 
 
 
465 aa  154  4e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.638198  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0948  FAD dependent oxidoreductase  31.62 
 
 
536 aa  152  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3180  FAD dependent oxidoreductase  29.56 
 
 
478 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  30.94 
 
 
472 aa  152  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  28.47 
 
 
556 aa  150  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1398  FAD dependent oxidoreductase  29.98 
 
 
469 aa  149  9e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.389386  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3246  FAD dependent oxidoreductase  30.97 
 
 
515 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2084  FAD dependent oxidoreductase  27.06 
 
 
477 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.424143 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  30.6 
 
 
510 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0553  FAD dependent oxidoreductase  29.46 
 
 
472 aa  147  5e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0562  phytoene dehydrogenase  28.05 
 
 
476 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  28.68 
 
 
523 aa  147  7.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2736  FAD dependent oxidoreductase  27.92 
 
 
484 aa  143  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118695  hitchhiker  0.0000199916 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0335  FAD dependent oxidoreductase  26.4 
 
 
476 aa  143  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000674369  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11461  dehydrogenase  27.54 
 
 
473 aa  140  7e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15580  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  31.92 
 
 
469 aa  137  4e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0617882  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  29.4 
 
 
510 aa  137  6.0000000000000005e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0240  FAD dependent oxidoreductase  34.17 
 
 
474 aa  133  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0268  FAD dependent oxidoreductase  28.35 
 
 
466 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  26 
 
 
518 aa  131  3e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0251  FAD dependent oxidoreductase  34.42 
 
 
474 aa  131  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  26.25 
 
 
516 aa  130  6e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.470789 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4153  putative dehydrogenase  28.46 
 
 
479 aa  127  7e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03260  putative dehydrogenase  25.9 
 
 
476 aa  125  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1063  FAD dependent oxidoreductase  30.3 
 
 
545 aa  125  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164132  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2659  beta-carotene ketolase  29.61 
 
 
526 aa  124  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2860  FAD dependent oxidoreductase  27.74 
 
 
468 aa  123  7e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0947  FAD dependent oxidoreductase  29.96 
 
 
532 aa  122  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17640  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  30.11 
 
 
499 aa  121  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.760158  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14190  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  32.03 
 
 
511 aa  120  3.9999999999999996e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00208581  normal  0.0106814 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31610  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  29.14 
 
 
503 aa  120  6e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.911892  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  29.57 
 
 
510 aa  120  7.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2057  FAD dependent oxidoreductase  28.27 
 
 
487 aa  120  9e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.548507  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>