More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3530 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3530  oxidoreductase  100 
 
 		 531 aa  1090    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2838  FAD dependent oxidoreductase  96.61 
 
 		 531 aa  1014    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3174  FAD dependent oxidoreductase  99.06 
 
 		 531 aa  1083    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.919135 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2541  putative phytoene dehydrogenase  51.42 
 
 		 530 aa  521  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.553028 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  51.89 
 
 		 530 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  39.47 
 
 		 555 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  39.89 
 
 		 537 aa  370  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  40.56 
 
 		 547 aa  370  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  40.23 
 
 		 527 aa  347  3e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  40.34 
 
 		 536 aa  341  2e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  39.96 
 
 		 539 aa  338  1.9999999999999998e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  38.84 
 
 		 533 aa  337  3.9999999999999995e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  37.15 
 
 		 537 aa  326  5e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  37.36 
 
 		 549 aa  325  1e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  38.45 
 
 		 533 aa  322  9.999999999999999e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  36.02 
 
 		 530 aa  319  6e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  37.22 
 
 		 516 aa  317  2e-85  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.470789 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  37.74 
 
 		 536 aa  317  5e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  37.17 
 
 		 552 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  34.84 
 
 		 518 aa  309  5.9999999999999995e-83  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  37.97 
 
 		 535 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  36.87 
 
 		 536 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  38.25 
 
 		 532 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  38.43 
 
 		 532 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2744  FAD dependent oxidoreductase  37.73 
 
 		 535 aa  300  3e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294261  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3302  FAD dependent oxidoreductase  38.35 
 
 		 532 aa  300  4e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1978  FAD dependent oxidoreductase  36.87 
 
 		 534 aa  298  1e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  36.19 
 
 		 559 aa  279  1e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  35.45 
 
 		 554 aa  277  4e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  34.14 
 
 		 554 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  33.93 
 
 		 547 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  32.47 
 
 		 547 aa  252  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  31.58 
 
 		 565 aa  244  3e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0948  FAD dependent oxidoreductase  35.48 
 
 		 536 aa  240  4e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  30.76 
 
 		 564 aa  238  2e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  31.84 
 
 		 556 aa  238  3e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  34.29 
 
 		 510 aa  235  2.0000000000000002e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  31.69 
 
 		 556 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  31.71 
 
 		 561 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  31.02 
 
 		 563 aa  226  7e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  32.89 
 
 		 510 aa  223  6e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  31.95 
 
 		 528 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  31.82 
 
 		 514 aa  209  7e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0947  FAD dependent oxidoreductase  30.59 
 
 		 532 aa  208  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  32.51 
 
 		 510 aa  206  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5076  FAD dependent oxidoreductase  29.09 
 
 		 520 aa  194  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3290  amine oxidase  30.65 
 
 		 545 aa  187  5e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4888  FAD dependent oxidoreductase  28.39 
 
 		 520 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.162383 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4505  FAD dependent oxidoreductase  27.94 
 
 		 520 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4592  FAD dependent oxidoreductase  27.94 
 
 		 520 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.593862 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  29.44 
 
 		 527 aa  177  3e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1677  FAD dependent oxidoreductase  27.61 
 
 		 519 aa  177  4e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3030  FAD dependent oxidoreductase  29.7 
 
 		 551 aa  169  8e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.788741  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  30.66 
 
 		 523 aa  166  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0988  FAD dependent oxidoreductase  28.44 
 
 		 528 aa  164  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1278  FAD dependent oxidoreductase  28.96 
 
 		 523 aa  164  5.0000000000000005e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  28.08 
 
 		 533 aa  162  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13863  dehydrogenase  28.15 
 
 		 536 aa  162  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  29.28 
 
 		 529 aa  159  8e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  29.11 
 
 		 531 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1331  FAD dependent oxidoreductase  28.68 
 
 		 531 aa  153  8.999999999999999e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  27.91 
 
 		 545 aa  152  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  29.81 
 
 		 528 aa  150  6e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  28.96 
 
 		 523 aa  147  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  27.41 
 
 		 524 aa  147  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1505  FAD dependent oxidoreductase  27.75 
 
 		 527 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00846828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  29.06 
 
 		 531 aa  139  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  27.5 
 
 		 531 aa  138  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  26.39 
 
 		 530 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  30.02 
 
 		 534 aa  137  5e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  30.78 
 
 		 528 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2659  beta-carotene ketolase  27.39 
 
 		 526 aa  134  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  26.13 
 
 		 530 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  26.13 
 
 		 530 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2949  FAD dependent oxidoreductase  27.64 
 
 		 517 aa  133  9e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  29.49 
 
 		 534 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  27.62 
 
 		 524 aa  130  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2157  FAD dependent oxidoreductase  26.12 
 
 		 430 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0637  putative dehydrogenase  27.17 
 
 		 548 aa  127  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0715988 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  27.62 
 
 		 535 aa  124  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  27.34 
 
 		 526 aa  124  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  27.12 
 
 		 523 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2146  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 		 505 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.220753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  27.22 
 
 		 472 aa  118  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  25.32 
 
 		 502 aa  116  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1160  FAD dependent oxidoreductase  29.14 
 
 		 516 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  25.39 
 
 		 506 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1063  FAD dependent oxidoreductase  28.96 
 
 		 545 aa  115  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164132  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  26.42 
 
 		 470 aa  114  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  24.09 
 
 		 506 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  25.79 
 
 		 522 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  25.29 
 
 		 512 aa  110  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1935  FAD dependent oxidoreductase  27.23 
 
 		 521 aa  110  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790128  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4868  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.5 
 
 		 517 aa  109  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6398  amine oxidase  29.25 
 
 		 504 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  25.1 
 
 		 512 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  25.05 
 
 		 511 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2512  FAD dependent oxidoreductase  24.62 
 
 		 497 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224928  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  25.05 
 
 		 511 aa  106  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  23.58 
 
 		 532 aa  105  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>