More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2949 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2949  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
517 aa  1026    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0637  putative dehydrogenase  39.92 
 
 
548 aa  310  5e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0715988 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1935  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
521 aa  228  3e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790128  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  30.83 
 
 
565 aa  202  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  30.73 
 
 
556 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  30.75 
 
 
510 aa  197  3e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  29.62 
 
 
564 aa  196  9e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  31.37 
 
 
556 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  29.83 
 
 
547 aa  184  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  30.24 
 
 
561 aa  177  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  31.86 
 
 
554 aa  177  5e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  29.87 
 
 
547 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  28.36 
 
 
563 aa  170  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  32.05 
 
 
514 aa  167  2.9999999999999998e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  31.05 
 
 
549 aa  167  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 
518 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  29.15 
 
 
554 aa  163  8.000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  31.14 
 
 
533 aa  160  7e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  29.49 
 
 
559 aa  158  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  30.29 
 
 
510 aa  158  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 
537 aa  157  3e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  28.49 
 
 
555 aa  157  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3290  amine oxidase  31.69 
 
 
545 aa  158  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  30.09 
 
 
536 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0948  FAD dependent oxidoreductase  30.97 
 
 
536 aa  154  5e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  28.84 
 
 
539 aa  153  8e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  30.5 
 
 
529 aa  152  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  29.42 
 
 
533 aa  151  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  30.77 
 
 
510 aa  150  6e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  29.51 
 
 
537 aa  150  8e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  30.24 
 
 
527 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  28.49 
 
 
516 aa  146  8.000000000000001e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.470789 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  29.72 
 
 
536 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  29.35 
 
 
552 aa  144  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  29.52 
 
 
547 aa  142  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2659  beta-carotene ketolase  30.43 
 
 
526 aa  137  6.0000000000000005e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  28.97 
 
 
535 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1063  FAD dependent oxidoreductase  29.89 
 
 
545 aa  135  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164132  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2744  FAD dependent oxidoreductase  29.42 
 
 
535 aa  131  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294261  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  28.78 
 
 
527 aa  131  3e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  27.62 
 
 
530 aa  130  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  30.57 
 
 
523 aa  127  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5076  FAD dependent oxidoreductase  27.12 
 
 
520 aa  124  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3030  FAD dependent oxidoreductase  30.74 
 
 
551 aa  124  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.788741  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  30.02 
 
 
536 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1677  FAD dependent oxidoreductase  26.65 
 
 
519 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  28.93 
 
 
528 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1978  FAD dependent oxidoreductase  28.03 
 
 
534 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413393  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3632  phytoene desaturase  25.99 
 
 
512 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.109765  normal  0.0371662 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4888  FAD dependent oxidoreductase  27.58 
 
 
520 aa  116  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.162383 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02162  phytoene dehydrogenase  22.73 
 
 
537 aa  114  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0143  amine oxidase  24.58 
 
 
519 aa  114  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4505  FAD dependent oxidoreductase  27.58 
 
 
520 aa  114  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4592  FAD dependent oxidoreductase  27.58 
 
 
520 aa  114  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.593862 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3745  phytoene desaturase  26.18 
 
 
512 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3436  phytoene desaturase  26.18 
 
 
512 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.240701 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  30.05 
 
 
532 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  30.05 
 
 
532 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3302  FAD dependent oxidoreductase  30.6 
 
 
532 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2541  putative phytoene dehydrogenase  29.49 
 
 
530 aa  110  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.553028 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1024  phytoene dehydrogenase-related protein  24.11 
 
 
518 aa  110  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  25.29 
 
 
493 aa  110  7.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  26.64 
 
 
524 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3508  phytoene dehydrogenase  26.24 
 
 
524 aa  107  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.691648  normal  0.885719 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3530  oxidoreductase  27.09 
 
 
531 aa  107  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13863  dehydrogenase  26.94 
 
 
536 aa  107  6e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  28.71 
 
 
530 aa  107  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  29.45 
 
 
534 aa  107  8e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5031  phytoene desaturase  25.54 
 
 
509 aa  105  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2838  FAD dependent oxidoreductase  26.99 
 
 
531 aa  104  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  27.72 
 
 
522 aa  104  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  29.02 
 
 
531 aa  103  8e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3200  phytoene desaturase  26.83 
 
 
508 aa  103  9e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177165  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  27.26 
 
 
560 aa  102  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3577  zeta-phytoene desaturase  25.91 
 
 
504 aa  100  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557125  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  28.88 
 
 
523 aa  100  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3174  FAD dependent oxidoreductase  26.41 
 
 
531 aa  100  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.919135 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  25.68 
 
 
505 aa  100  7e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1712  phytoene desaturase  25.19 
 
 
504 aa  99.4  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678565  normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  24.28 
 
 
511 aa  99.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  28.35 
 
 
545 aa  99.4  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  26.53 
 
 
507 aa  98.6  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0562  phytoene dehydrogenase  26.82 
 
 
476 aa  98.2  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2128  phytoene desaturase  26.05 
 
 
504 aa  97.4  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.423753  decreased coverage  0.0000406201 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2146  FAD dependent oxidoreductase  28.36 
 
 
505 aa  97.4  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.220753  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0271  phytoene dehydrogenase  25.19 
 
 
518 aa  95.5  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3156  phytoene desaturase  25.59 
 
 
509 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.205158  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1914  phytoene dehydrogenase-related protein  25.19 
 
 
518 aa  95.5  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.603026 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0988  FAD dependent oxidoreductase  26.72 
 
 
528 aa  95.1  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  23.91 
 
 
511 aa  94.7  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  28.79 
 
 
474 aa  94  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  26.81 
 
 
508 aa  94  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  28.82 
 
 
534 aa  94  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  28.38 
 
 
524 aa  92.8  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0947  FAD dependent oxidoreductase  27.45 
 
 
532 aa  92.4  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  29.82 
 
 
528 aa  92  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1585  zeta-phytoene desaturase  24.45 
 
 
492 aa  92.4  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  22.5 
 
 
492 aa  92.4  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  25.19 
 
 
512 aa  91.3  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  23.38 
 
 
511 aa  91.3  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>