249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3030 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3030  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 551 aa  1084    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.788741  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2659  beta-carotene ketolase  57.17 
 
 		 526 aa  551  1e-156  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3290  amine oxidase  50.36 
 
 		 545 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  40.23 
 
 		 554 aa  362  1e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  40.38 
 
 		 547 aa  362  1e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  42.12 
 
 		 554 aa  358  9.999999999999999e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  41.18 
 
 		 559 aa  354  2e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  40.53 
 
 		 514 aa  322  8e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  40.87 
 
 		 510 aa  322  9.999999999999999e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  39.07 
 
 		 510 aa  310  4e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  40.86 
 
 		 510 aa  293  8e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  36.24 
 
 		 556 aa  288  1e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  30.78 
 
 		 547 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  28.85 
 
 		 564 aa  221  3e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  28.8 
 
 		 565 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  30.29 
 
 		 561 aa  213  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  29.97 
 
 		 556 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  27.92 
 
 		 563 aa  207  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  29.07 
 
 		 516 aa  176  9.999999999999999e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.470789 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  27.74 
 
 		 518 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2541  putative phytoene dehydrogenase  29.85 
 
 		 530 aa  160  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.553028 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  29.71 
 
 		 539 aa  160  7e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  33.03 
 
 		 535 aa  159  8e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 537 aa  159  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  30.36 
 
 		 533 aa  159  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  29.62 
 
 		 537 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  29.42 
 
 		 547 aa  157  4e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  28.11 
 
 		 555 aa  157  7e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  33.27 
 
 		 532 aa  156  8e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  33.27 
 
 		 532 aa  156  9e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  30.98 
 
 		 527 aa  155  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  31.05 
 
 		 536 aa  154  5e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  30.11 
 
 		 536 aa  153  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2838  FAD dependent oxidoreductase  30.35 
 
 		 531 aa  153  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  30.07 
 
 		 549 aa  152  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3174  FAD dependent oxidoreductase  29.85 
 
 		 531 aa  151  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.919135 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3530  oxidoreductase  29.62 
 
 		 531 aa  150  7e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  31.11 
 
 		 536 aa  149  9e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1063  FAD dependent oxidoreductase  30.83 
 
 		 545 aa  147  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164132  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  27.97 
 
 		 533 aa  148  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  30.16 
 
 		 552 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  31.68 
 
 		 530 aa  145  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  26.07 
 
 		 527 aa  135  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  28.06 
 
 		 530 aa  134  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2949  FAD dependent oxidoreductase  30.98 
 
 		 517 aa  131  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  28.84 
 
 		 529 aa  131  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  28.94 
 
 		 530 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2744  FAD dependent oxidoreductase  30.76 
 
 		 535 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294261  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 530 aa  128  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 530 aa  128  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1978  FAD dependent oxidoreductase  30.66 
 
 		 534 aa  125  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  30.14 
 
 		 523 aa  123  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  29.84 
 
 		 528 aa  121  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  29.15 
 
 		 528 aa  119  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  29.58 
 
 		 531 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0948  FAD dependent oxidoreductase  30.77 
 
 		 536 aa  115  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4888  FAD dependent oxidoreductase  29.08 
 
 		 520 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.162383 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5076  FAD dependent oxidoreductase  28.52 
 
 		 520 aa  114  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4505  FAD dependent oxidoreductase  28.52 
 
 		 520 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4592  FAD dependent oxidoreductase  28.52 
 
 		 520 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.593862 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3180  FAD dependent oxidoreductase  27.8 
 
 		 478 aa  111  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  29.4 
 
 		 545 aa  111  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1505  FAD dependent oxidoreductase  30.49 
 
 		 527 aa  110  8.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00846828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  30.62 
 
 		 524 aa  109  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1677  FAD dependent oxidoreductase  28.36 
 
 		 519 aa  107  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4153  putative dehydrogenase  29.53 
 
 		 479 aa  106  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0947  FAD dependent oxidoreductase  27.55 
 
 		 532 aa  105  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  27.54 
 
 		 535 aa  103  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1331  FAD dependent oxidoreductase  28.75 
 
 		 531 aa  103  7e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13863  dehydrogenase  27.67 
 
 		 536 aa  103  8e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1398  FAD dependent oxidoreductase  30.15 
 
 		 469 aa  103  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.389386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  27.52 
 
 		 522 aa  101  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  29.11 
 
 		 470 aa  101  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3691  FAD dependent oxidoreductase  28.86 
 
 		 481 aa  100  8e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0637  putative dehydrogenase  26.82 
 
 		 548 aa  98.6  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0715988 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  27.69 
 
 		 523 aa  99.4  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1935  FAD dependent oxidoreductase  26.48 
 
 		 521 aa  98.2  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790128  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15580  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  30.54 
 
 		 469 aa  97.4  5e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0617882  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 		 533 aa  97.4  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31610  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  29.86 
 
 		 503 aa  96.3  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.911892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2416  FAD dependent oxidoreductase  29.4 
 
 		 487 aa  96.7  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.28605  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0335  FAD dependent oxidoreductase  25.51 
 
 		 476 aa  96.3  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000674369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1278  FAD dependent oxidoreductase  28.18 
 
 		 523 aa  95.9  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  29.02 
 
 		 523 aa  94.7  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  25.82 
 
 		 524 aa  94.4  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  26.47 
 
 		 515 aa  93.6  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0562  phytoene dehydrogenase  23.94 
 
 		 476 aa  92.8  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  27.95 
 
 		 472 aa  91.3  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  30.63 
 
 		 534 aa  90.9  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1663  phytoene dehydrogenase, putative  28.68 
 
 		 465 aa  90.5  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.638198  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2146  FAD dependent oxidoreductase  28.09 
 
 		 505 aa  89.4  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.220753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4519  FAD dependent oxidoreductase  28.89 
 
 		 506 aa  88.2  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  28.04 
 
 		 531 aa  88.2  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  30.26 
 
 		 534 aa  87.8  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17640  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  28.17 
 
 		 499 aa  87  7e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.760158  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3246  FAD dependent oxidoreductase  28.55 
 
 		 515 aa  86.7  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  26.12 
 
 		 474 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3920  putative dehydrogenase  28.97 
 
 		 482 aa  85.9  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6398  amine oxidase  28.74 
 
 		 504 aa  85.5  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0988  FAD dependent oxidoreductase  24.62 
 
 		 528 aa  85.1  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>